Man pages for maous1/Syngulon
analyse bacteria genome
| amelioration.annotation | Fonction qui retire les underscore dans la colonne gene des... |
| analyse.annotation | A function to summarize the presence of some genes based on... |
| analyse.blast.table | A function to summarize the presence of some genes based on... |
| dl.annot.genome | telecharge les fichiers d'annotations et des genomes en lui... |
| download.accession.chromosome | Create accession csv file à la base du package genome. il... |
| download.accession.chromosome.plasmid | Create accession csv file à la base du package genome. il... |
| download.accession.NCBI | Telecharge les accessions list sur NCBI |
| download.annotation | Telecharge les annotations |
| download.annotation.key | Telecharge les annotations |
| download.genome | Download genomes of selected species |
| extract.1.gene.annotationbased | utiliser dans extract all genes. La fonction va isoler un... |
| extract.all.genes.annotationbased | Extraire les séquences des gènes de collicin dans le génome... |
| extract.bacteria.table | extract a table of bacteria with accession numbers based on... |
| extract.phylum | extract a table of the phylum of bacteria based on the taxize... |
| extract.sequences.annotation | extrait les sequences comportant colicin et ne comportant pas... |
| extract.sequences.annotation.nom | extrait les sequences comportant colicin et ne comportant pas... |
| Gram | ajoute si le sous-groupe fait partie des bactéries gram + ou... |
| hello | Hello, World! |
| otus | Title |
| phylo.all | fait un arbre phylogenetic. Utiliser avec de grand nombre de... |
| phylo.from.otus | A function to plot phylogenetic tree of all genes based on... |
| screenBlast | Screen a sequence using Blast |
| screenBlastkey | Screen a sequence using Blast. utiliser pour les keys |
