read_dirNIRraw: Lê dados NIR em formato bruto obtido em um espectrofotômetro...

In ricoperdiz/NIRtools: Tools to deal with near infrared (NIR) spectrocospy data

Lê dados NIR em formato bruto obtido em um espectrofotômetro Thermo Nicollet \(Thermo Fischer Scientific, Waltham, Massachusetts, USA\), modelo Antaris II FT-NIR Analyzer, hospedado no herbário do INPA, Amazonas, Brasil

Description

Lê dados NIR em formato bruto obtido em um espectrofotômetro Thermo Nicollet \(Thermo Fischer Scientific, Waltham, Massachusetts, USA\), modelo Antaris II FT-NIR Analyzer, hospedado no herbário do INPA, Amazonas, Brasil

Usage

read_dirNIRraw(arq, add_nir_id = TRUE)

Arguments

arq	Vetor de texto contendo caminho para um arquivo contendo dados de infravermelho próximo em formato bruto. Geralmente o dado será um arquivo de 1557 linhas, em que a primeira coluna conterá o número identificador do espectro, e a segunda coluna conterá o valor de absorbância NIR.
add_nir_id	Vetor lógico, 'TRUE' ou 'FALSE', para saber se deve ser adicionado a letra 'X' antes de cada variável NIR no arquivo final

Value

Um data.frame em formato amplo ('wide' em inglês) em que cada linha conterá as 1557 colunas de dados NIR..

Examples

# read file with raw data
nir_raw <- system.file("extdata", "nir_raw.csv", package = "NIRtools")
nir_raw <- read_dirNIRraw(arq = nir_raw, add_nir_id = TRUE)
# check first rows and 5 first columns of data
dim(nir_raw)
names(nir_raw)
head(nir_raw)[,1:10]

ricoperdiz/NIRtools documentation built on Oct. 24, 2023, 1:30 a.m.