R/aa-functions.R

In sgibb/detectability: Detectability of Peptides in Mass Spectrometry Experiments

.aaNames <- c("Alanine", "Arginine", "Asparagine", "Aspartic Acid", "Cysteine",
              "Glutamine", "Glutamic Acid", "Glycine", "Histidine",
              "Isoleucine", "Leucine", "Lysine", "Methionine", "Phenylalanine",
              "Proline", "Serine", "Threonine", "Tryptophan", "Tyrosine",
              "Valine")
.aaNames1 <- c("A", "R", "N", "D", "C", "Q", "E", "G", "H", "I", "L", "K", "M",
               "F", "P", "S", "T", "W", "Y", "V")
.aaNames3 <- c("Ala", "Arg", "Asn", "Asp", "Cys", "Gln", "Glu", "Gly", "His",
               "Ile", "Leu", "Lys", "Met", "Phe", "Pro", "Ser", "Thr", "Trp",
               "Tyr", "Val")