inst/app/ui.R
In sollano/AppInventarioNativas: AppInventarioNativas
library(shiny)
suppressPackageStartupMessages(library(DT))
#library(plotly)
library(formattable)
library(readxl)
#library(plyr)
library(tibble)
library(tidyr)
suppressPackageStartupMessages(library(dplyr))
library(lazyeval)
library(ggplot2)
library(ggdendro)
library(ggthemes)
library(openxlsx)
library(rmarkdown)
shinyUI(
# Intro, taglists e error messages colors ####
tagList(tags$style(HTML(".irs-single, .irs-bar-edge, .irs-bar{background: #00a90a}")), # this is actually .css; this changes the color for the sliders
# Timeout: depois de 20 minutos (12000000 milisegundos) fecha a aba do navegador
tags$script(
"function idleTimer() {
var t = setTimeout(logout, 5000);
window.onmousemove = resetTimer; // catches mouse movements
window.onmousedown = resetTimer; // catches mouse movements
window.onclick = resetTimer; // catches mouse clicks
window.onscroll = resetTimer; // catches scrolling
window.onkeypress = resetTimer; //catches keyboard actions
function logout() {
process.exit(); //close the window
}
function resetTimer() {
clearTimeout(t);
t = setTimeout(logout, 12000000); // time is in milliseconds (1000 is 1 second)
}
}
idleTimer();"
),
# Cor de todas as mensagens da funcao need
tags$head(
tags$style(HTML("
.shiny-output-error-validation {
color: #00a90a;
}
"))
),
# cor das mensagens que eu especificar com "WRONG"
tags$head(
tags$style(HTML("
.shiny-output-error-WRONG {
color: red;
}
"))
),
# cor das mensagens que eu especificar com "AVISO"
tags$head(
tags$style(HTML("
.shiny-output-error-AVISO {
color: orange;
}
"))
),
tags$head(
tags$link(
rel = "icon",
type = "image/x-icon",
href = "http://localhost:1984/default.ico")
),
# Version ####
navbarPage("App Inventário de Nativas 2.0.9",
# ####
theme = "green_yeti2.css",
# theme = "green.css", # seleciona um tema contido na pasta www
# theme = shinythemes::shinytheme("paper"), # seleciona um tema utilizando pacote
# Painel Intro ####
tabPanel( "Intro" ,
fluidRow(
column(5,
includeMarkdown("about.md")
),
column(6,
img(contentType = "image/jpg",
src="intro_picture.jpg",
width = 770,
# height = 750)
height = 856)
)
) # fluid row
), # Painel Intro
# Upload de dados ####
tabPanel("Importação",
sidebarLayout(
sidebarPanel(
h3("Dados"),
radioButtons("df_select",
"Fazer o upload de um arquivo, ou utilizar o dado de exemplo?",
c("Fazer o upload",
"Utilizar o dado de exemplo em nivel de fuste",
"Utilizar o dado de exemplo em nivel de arvore" ),
selected = "Fazer o upload"),
radioButtons("df",
"Tipo da base de dados:",
choices = c("Dados em nivel de fuste",
"Dados em nivel de arvore",
"Dados em nivel de parcela"),
selected = "Dados em nivel de arvore"),
uiOutput("upload"), # tipos de arquivos aceitos
hr(),
uiOutput("upload_csv"), # tipos de arquivos aceitos
uiOutput("upload_xlsx") # tipos de arquivos aceitos
), # sidebarPanel
mainPanel(
DT::dataTableOutput("rawdata")
) # mainPanel
) # sidebarLayout
),
# Mapeamento ####
tabPanel("Mapeamento de variáveis",
fluidPage(
#h1("Shiny", span("Widgets Gallery", style = "font-weight: 300"),
h1("Definição dos nomes das variáveis",
style = "text-align: center;"),
br(),
# h4("Nesta aba serão indicados os nomes das colunas que serão utilizadas nas análises em todo o app"),
fluidRow( # fluidRow 1 start
column(4,
wellPanel(
h3("Árvore"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Árvore':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_arvore")
)), # Coluna Espécie
column(4,
wellPanel(
h3("Parcela*"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Parcela':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_parcelas")
)),
column(4,
wellPanel(
h3("Espécie*"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Espécie':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_especies")
)) # Coluna Espécie,
), # fluidRow 1 end
fluidRow( # fluidRow 2 start
column(4,
wellPanel(
h3("Circunferência (CAP)*"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'CAP':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_cap")
)), # Coluna Espécie
column(4,
wellPanel(
h3("Diâmetro (DAP)*"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'DAP':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_dap")
)), # Coluna dap
column(4,
wellPanel(
h3("Altura total"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Altura total':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_ht")
)) # Coluna ht
), # fluidRow 2 end
fluidRow( # fluidRow 3 start
column(4,
wellPanel(
h3("Volume com casca"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Volume com casca':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_vcc")
)), #, # Coluna vcc
column(4,
wellPanel(
h3("Área da parcela"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Área da parcela (m²)':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_area.parcela")
)), # Coluna area.parcela
column(4,
wellPanel(
h3("Área total"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Área total (ha)'"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_area.total")
)) # Coluna area.total
# column(4,
# wellPanel(
# h3("Volume sem casca"),
# p("Selecione o nome da variável referente à Volume sem casca:"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
# ),
# uiOutput("selec_vsc")
# )) # Coluna vsc
),# fluidRow 3 end
fluidRow( # fluidRow 4 start
column(4,
wellPanel(
h3("Estrutura vertical"),
p("Selecione o método de definição da 'Estrutura vertical'"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
radioButtons("est.vert.calc",
"Deseja definir a posição sociológica com base na variável altura,
ou inserir uma variável referente à posição sociológica?",
c("Definir", "Inserir"),
inline = T,
selected = "Inserir"
),
uiOutput("selec_est.vertical_2"),
uiOutput("selec_est.vertical_warning")
)), # Coluna area.total
column(4,
wellPanel(
h3("Estrutura interna"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Estrutura interna'"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_est.interna")
)), # Coluna area.total
column(4,
wellPanel(
h3("Estrato"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Estrato'"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_estrato")
))
) # fluidRow 4 end
) # fluidPage
),# tabPanel Mapeamento
# tabPanel Preparação ####
tabPanel("Preparação dos dados",
fluidPage(
fluidRow(
h1("Preparação dos dados",style = "text-align: center;"),
br()
),
fluidRow(
sidebarPanel(
h3("Intervalo de classe"),
numericInput("int.classe", "Insira o intervalo de classe:", 5, 1, 50, 0.5),
h3("Diâmetro mínimo"),
numericInput("diam.min", "Insira o diâmetro mínimo:", 1, 1, 100, 1),
uiOutput("selec_rotuloNI"),
h3("Transformar zero em NA"),
radioButtons("zero_to_NA","Transformar zeros em variávies numéricas em NA? (recomendado)",c("Sim"=TRUE,"Nao"=FALSE), inline = TRUE),
h3("Filtrar dados"),
uiOutput("rm_data_var"),
uiOutput("rm_data_level"),
uiOutput("rm_vars"),
uiOutput("selec_area_parcela_num"),
uiOutput("selec_area_total_num"),
uiOutput("ui_estvcc1"),
uiOutput("ui_estvcc3"),
uiOutput("ui_estvcc4"),
uiOutput("checkbox_calc.est.vert"),
uiOutput("consist_warning1")
),# sidebarPanel
mainPanel( tabsetPanel(
tabPanel("Dado pos preparação",
shiny::htmlOutput("avisos_prep"),
DT::dataTableOutput("prep_table"),
hr(),
tableOutput("teste")
),
tabPanel("Dados inconsistentes",
uiOutput("consist_warning2"),
uiOutput("consist_table_help"),
uiOutput("consist_choice"),
DT::dataTableOutput("consist_table")
)
))# mainPanel
)
)
), # tabPanel preparacao dados
# Totalização de fustes ####
tabPanel("Totalização de fustes",
fluidPage(
h1("Totalização de fustes", style = "text-align: center;"),
br(),
DT::dataTableOutput("tot_fuste_tab")
)
),# tabpanel Totalização de fustes
# navbarMenu fitossociologica ####
navbarMenu("Análise fitossociológica",
# Diversidade ####
tabPanel("Índices de diversidade",
fluidPage(
h1("Índices de diversidade", style = "text-align: center;"),
br(),
fluidRow(
column(5,
radioButtons("rb_div",
h3("Calcular diversidade por parcela?"),
c("Sim","Nao"),
"Nao",
TRUE),
offset = 7
)),
DT::dataTableOutput("div")
)
), #Diversidade tab
# Similaridade ####
tabPanel("Índices de similaridade",
fluidPage(
h1("Índices de similaridade", style = "text-align: center;"),
br(),
fluidRow(
column(width=4,
h3("Configuração dos gráficos:")
),
column(width=5,
radioButtons("rb_msim_graph",
"Selecione o método de classificação:",
c("Vizinho mais próximo" = "single",
"Vizinho mais distante" = "complete",
"Distância euclidiana" = "average"),
selected = "complete", inline = T) ),
column(width=3,
sliderInput("slider_msim_graph",
label = "Selecione o número de clusters:",
min = 1,
max = 10,
value = 3,
step = 1) )
),
fluidRow(
tabsetPanel(id = "mainPanel_Indices",
tabPanel("Matriz de Similaridadede de Jaccard", DT::dataTableOutput("msim1") ),
tabPanel("Dendrograma Jaccard", plotOutput("msim1_graph_",height = "600px"), value="id_msim1_graph" ),
tabPanel("Matriz de Similaridadede de Sorensen", DT::dataTableOutput("msim2") ),
tabPanel("Dendrograma Sorensen", plotOutput("msim2_graph_",height = "600px"), value="id_msim2_graph" )
) )
)
), # Similaridade tab
# Agregação ####
tabPanel("Índices de agregação",
fluidPage(
h1("Índices de agregação", style = "text-align: center;"),
br(),
DT::dataTableOutput("agreg")
)
), # Agregação tab
# Estrutura ####
tabPanel("Análise Estrutural",
fluidPage(
h1("Análise estrutural", style = "text-align: center;"),
br(),
fluidRow( uiOutput("ivi_graph_opts")
),
fluidRow(
tabsetPanel(id = "mainPanel_Estrutural",
tabPanel("Análise estrutural", DT::dataTableOutput("estr") ),
tabPanel("Gráfico IVI", plotOutput("estrg",height = "550px" ) ),
tabPanel("Gráfico estrutura vertical", plotOutput("est.vert_plot", height = "550px")) )
) #,
# fluidRow( column(width=4,uiOutput("rb_graphmsim"),offset = 3 ),
# column(width=3,uiOutput("slider_graphmsim")) )
)
) # Estrutura tab
),# navbarMenu fitossociologica end ####
# navbarMenu Quantificacao ####
navbarMenu( "Quantificação",
# tabPanel DD ####
tabPanel("Distribuição diamétrica",
fluidPage(
h1("Distribuição diamétrica (DD)", style = "text-align: center;"),
br(),
tabsetPanel(
tabPanel("Distribuição diamétrica Geral", DT::dataTableOutput("dd_geral_tab") ),
tabPanel("Distribuição diamétrica dos indivíduos por ha por espécie", DT::dataTableOutput("dd_indv_especie_tab") ),
tabPanel("Distribuição diamétrica do volume por ha por espécie", DT::dataTableOutput("dd_vol_especie_tab") ),
tabPanel("Distribuição diamétrica de G por ha por espécie", DT::dataTableOutput("dd_G_especie_tab") ),
tabPanel("Gráfico dos indivíduos por ha por classe diamétrica", plotOutput("dd_graph_indv",height = "550px") ),
tabPanel("Gráfico do volume por ha por classe diamétrica", plotOutput("dd_graph_vol",height = "550px")),
tabPanel("Gráfico de G por ha por classe diamétrica", plotOutput("dd_graph_G",height = "550px"))
)
)
), # tabPanel DD
# tabPanel BDq ####
tabPanel("BDq",
fluidPage(
h1("BDq Meyer", style = "text-align: center;"),
br(),
fluidRow(column(width=5,
sliderInput("i.licourtBDq",
label = "Selecione um valor de quociente de Licourt:",
min = 0,
max = 5,
value = 1.3,
step = .1),
offset=7
)),
tabsetPanel(
tabPanel("BDq", DT::dataTableOutput("BDq1") ),
tabPanel("Gráfico", plotOutput( "BDq_graph_" ,height = "550px") ),
tabPanel("Detalhes do ajuste", DT::dataTableOutput("BDq3", "70%") )
)
)
),# tabPanel BDq
# tabPanel Estrutura volumétrica ####
# tabPanel("Estrutura volumétrica"),
# tabPanel inventario florestal ####
tabPanel("Inventário florestal",
fluidPage(
h1("Inventário florestal", style = "text-align: center;"),
br(),
# ####
fluidRow(
column(2,
sliderInput("alpha_inv",
label = "Selecione o nível de significância:",
min = 0.01,
max = 0.10,
value = 0.10,
step = 0.01)
),
column( 2, sliderInput("erro_inv",
label = "Selecione o erro admitido (%):",
min = 1,
max = 20,
value = 10,
step = 1)),
column(2,
sliderInput("cd_inv",
label = "Selecione o nº de casas decimais:",
min = 0,
max = 10,
value = 4,
step = 1)
),
column(2,
radioButtons(
inputId='pop_inv', # Id
label='Considerar a população infinita ou finita?', # nome que sera mostrado na UI
choices=c(Infinita="inf", Finita="fin"), # opcoes e seus nomes
selected="inf",
inline = T)
),
column(3,
uiOutput("acs_estrato_rb"), uiOutput("as_estrato_rb"),
uiOutput("acs_as_warning")
)
),
fluidRow(
radioButtons("yi_inv",
label="Selecione a variável utilizada nas estatísticas:",
choices = c("Indv", "G","VCC"),
selected = "VCC",
inline=T )
),
fluidRow(
tabsetPanel(id="tabset_inv",
tabPanel("Totalização de parcelas",DT::dataTableOutput("tot_parc_tab") ) ,
tabPanel("Amostragem casual simples",DT::dataTableOutput("acs") ),
tabPanel("Amostragem casual estratificada",DT::dataTableOutput("ace1"),br(),DT::dataTableOutput("ace2") ),
tabPanel("Amostragem sistemática",DT::dataTableOutput("as") ) )
)
# ####
)
)# TabPanel Inventario
), # navbarMenu Quantificacao end ####
# navbarMenu Download ####
tabPanel("Download",
# Painel Download Tabelas ####
fluidPage(
h1("Download dos resultados", style = "text-align: center;"),
br(),
tabsetPanel(
tabPanel("Download de tabelas",
fluidPage(
h2("Download de tabelas", style = "text-align: center;"),
br(),
fluidRow(
column(
10
,uiOutput("checkbox_df_download")
)
),
br(),
fluidRow(column(3,downloadButton('downloadData', 'Baixar tabelas selecionadas'), offset=4)),
br(),
h3("Ou, para baixar todas as tabelas disponíveis, clique abaixo:"),
fluidRow(
column(3,downloadButton('downloadAllData', 'Baixar todas as tabelas'), offset=4)
)
)
), # download tabelas
# Painel Download Graficos ####
tabPanel("Download de graficos",
sidebarLayout(
sidebarPanel(
tags$style(type="text/css",
".recalculating {opacity: 1.0;}"
),
h3("Download de graficos"),
selectInput("graph_d", "Escolha um grafico:",
choices = c(
"Dendrograma - Jaccard",
"Dendrograma - Sorensen",
"Grafico IVI",
"Grafico Estrutura Vertical",
"Indv. por ha por CC",
"Vol. por ha por CC",
"G por ha por CC",
"Distribuicao - BDq Meyer" )),
selectInput("graphformat",
"Escolha o formato do gráfico:",
choices = c("PNG" = ".png",
"JPG" = ".jpg",
"PDF" = ".pdf") ),
downloadButton('downloadGraph', 'Download')
),
mainPanel(
plotOutput("graph_d_out",height = "550px")
)
)
) # download graficos
)
) # fluidPage
) # final navbarMenu download ####
# final da UI ####
) # navbarPage
)#tagList
) # ShinyUI
sollano/AppInventarioNativas documentation built on May 20, 2019, 10:23 p.m.
R Package Documentation
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library(shiny)
suppressPackageStartupMessages(library(DT))
#library(plotly)
library(formattable)
library(readxl)
#library(plyr)
library(tibble)
library(tidyr)
suppressPackageStartupMessages(library(dplyr))
library(lazyeval)
library(ggplot2)
library(ggdendro)
library(ggthemes)
library(openxlsx)
library(rmarkdown)
shinyUI(
# Intro, taglists e error messages colors ####
tagList(tags$style(HTML(".irs-single, .irs-bar-edge, .irs-bar{background: #00a90a}")), # this is actually .css; this changes the color for the sliders
# Timeout: depois de 20 minutos (12000000 milisegundos) fecha a aba do navegador
tags$script(
"function idleTimer() {
var t = setTimeout(logout, 5000);
window.onmousemove = resetTimer; // catches mouse movements
window.onmousedown = resetTimer; // catches mouse movements
window.onclick = resetTimer; // catches mouse clicks
window.onscroll = resetTimer; // catches scrolling
window.onkeypress = resetTimer; //catches keyboard actions
function logout() {
process.exit(); //close the window
}
function resetTimer() {
clearTimeout(t);
t = setTimeout(logout, 12000000); // time is in milliseconds (1000 is 1 second)
}
}
idleTimer();"
),
# Cor de todas as mensagens da funcao need
tags$head(
tags$style(HTML("
.shiny-output-error-validation {
color: #00a90a;
}
"))
),
# cor das mensagens que eu especificar com "WRONG"
tags$head(
tags$style(HTML("
.shiny-output-error-WRONG {
color: red;
}
"))
),
# cor das mensagens que eu especificar com "AVISO"
tags$head(
tags$style(HTML("
.shiny-output-error-AVISO {
color: orange;
}
"))
),
tags$head(
tags$link(
rel = "icon",
type = "image/x-icon",
href = "http://localhost:1984/default.ico")
),
# Version ####
navbarPage("App Inventário de Nativas 2.0.9",
# ####
theme = "green_yeti2.css",
# theme = "green.css", # seleciona um tema contido na pasta www
# theme = shinythemes::shinytheme("paper"), # seleciona um tema utilizando pacote
# Painel Intro ####
tabPanel( "Intro" ,
fluidRow(
column(5,
includeMarkdown("about.md")
),
column(6,
img(contentType = "image/jpg",
src="intro_picture.jpg",
width = 770,
# height = 750)
height = 856)
)
) # fluid row
), # Painel Intro
# Upload de dados ####
tabPanel("Importação",
sidebarLayout(
sidebarPanel(
h3("Dados"),
radioButtons("df_select",
"Fazer o upload de um arquivo, ou utilizar o dado de exemplo?",
c("Fazer o upload",
"Utilizar o dado de exemplo em nivel de fuste",
"Utilizar o dado de exemplo em nivel de arvore" ),
selected = "Fazer o upload"),
radioButtons("df",
"Tipo da base de dados:",
choices = c("Dados em nivel de fuste",
"Dados em nivel de arvore",
"Dados em nivel de parcela"),
selected = "Dados em nivel de arvore"),
uiOutput("upload"), # tipos de arquivos aceitos
hr(),
uiOutput("upload_csv"), # tipos de arquivos aceitos
uiOutput("upload_xlsx") # tipos de arquivos aceitos
), # sidebarPanel
mainPanel(
DT::dataTableOutput("rawdata")
) # mainPanel
) # sidebarLayout
),
# Mapeamento ####
tabPanel("Mapeamento de variáveis",
fluidPage(
#h1("Shiny", span("Widgets Gallery", style = "font-weight: 300"),
h1("Definição dos nomes das variáveis",
style = "text-align: center;"),
br(),
# h4("Nesta aba serão indicados os nomes das colunas que serão utilizadas nas análises em todo o app"),
fluidRow( # fluidRow 1 start
column(4,
wellPanel(
h3("Árvore"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Árvore':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_arvore")
)), # Coluna Espécie
column(4,
wellPanel(
h3("Parcela*"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Parcela':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_parcelas")
)),
column(4,
wellPanel(
h3("Espécie*"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Espécie':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_especies")
)) # Coluna Espécie,
), # fluidRow 1 end
fluidRow( # fluidRow 2 start
column(4,
wellPanel(
h3("Circunferência (CAP)*"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'CAP':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_cap")
)), # Coluna Espécie
column(4,
wellPanel(
h3("Diâmetro (DAP)*"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'DAP':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_dap")
)), # Coluna dap
column(4,
wellPanel(
h3("Altura total"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Altura total':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_ht")
)) # Coluna ht
), # fluidRow 2 end
fluidRow( # fluidRow 3 start
column(4,
wellPanel(
h3("Volume com casca"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Volume com casca':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_vcc")
)), #, # Coluna vcc
column(4,
wellPanel(
h3("Área da parcela"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Área da parcela (m²)':"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_area.parcela")
)), # Coluna area.parcela
column(4,
wellPanel(
h3("Área total"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Área total (ha)'"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_area.total")
)) # Coluna area.total
# column(4,
# wellPanel(
# h3("Volume sem casca"),
# p("Selecione o nome da variável referente à Volume sem casca:"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
# ),
# uiOutput("selec_vsc")
# )) # Coluna vsc
),# fluidRow 3 end
fluidRow( # fluidRow 4 start
column(4,
wellPanel(
h3("Estrutura vertical"),
p("Selecione o método de definição da 'Estrutura vertical'"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
radioButtons("est.vert.calc",
"Deseja definir a posição sociológica com base na variável altura,
ou inserir uma variável referente à posição sociológica?",
c("Definir", "Inserir"),
inline = T,
selected = "Inserir"
),
uiOutput("selec_est.vertical_2"),
uiOutput("selec_est.vertical_warning")
)), # Coluna area.total
column(4,
wellPanel(
h3("Estrutura interna"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Estrutura interna'"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_est.interna")
)), # Coluna area.total
column(4,
wellPanel(
h3("Estrato"),
p("Selecione o nome da variável referente à 'Estrato'"#,
#style = "font-family: 'Source Sans Pro';"
),
uiOutput("selec_estrato")
))
) # fluidRow 4 end
) # fluidPage
),# tabPanel Mapeamento
# tabPanel Preparação ####
tabPanel("Preparação dos dados",
fluidPage(
fluidRow(
h1("Preparação dos dados",style = "text-align: center;"),
br()
),
fluidRow(
sidebarPanel(
h3("Intervalo de classe"),
numericInput("int.classe", "Insira o intervalo de classe:", 5, 1, 50, 0.5),
h3("Diâmetro mínimo"),
numericInput("diam.min", "Insira o diâmetro mínimo:", 1, 1, 100, 1),
uiOutput("selec_rotuloNI"),
h3("Transformar zero em NA"),
radioButtons("zero_to_NA","Transformar zeros em variávies numéricas em NA? (recomendado)",c("Sim"=TRUE,"Nao"=FALSE), inline = TRUE),
h3("Filtrar dados"),
uiOutput("rm_data_var"),
uiOutput("rm_data_level"),
uiOutput("rm_vars"),
uiOutput("selec_area_parcela_num"),
uiOutput("selec_area_total_num"),
uiOutput("ui_estvcc1"),
uiOutput("ui_estvcc3"),
uiOutput("ui_estvcc4"),
uiOutput("checkbox_calc.est.vert"),
uiOutput("consist_warning1")
),# sidebarPanel
mainPanel( tabsetPanel(
tabPanel("Dado pos preparação",
shiny::htmlOutput("avisos_prep"),
DT::dataTableOutput("prep_table"),
hr(),
tableOutput("teste")
),
tabPanel("Dados inconsistentes",
uiOutput("consist_warning2"),
uiOutput("consist_table_help"),
uiOutput("consist_choice"),
DT::dataTableOutput("consist_table")
)
))# mainPanel
)
)
), # tabPanel preparacao dados
# Totalização de fustes ####
tabPanel("Totalização de fustes",
fluidPage(
h1("Totalização de fustes", style = "text-align: center;"),
br(),
DT::dataTableOutput("tot_fuste_tab")
)
),# tabpanel Totalização de fustes
# navbarMenu fitossociologica ####
navbarMenu("Análise fitossociológica",
# Diversidade ####
tabPanel("Índices de diversidade",
fluidPage(
h1("Índices de diversidade", style = "text-align: center;"),
br(),
fluidRow(
column(5,
radioButtons("rb_div",
h3("Calcular diversidade por parcela?"),
c("Sim","Nao"),
"Nao",
TRUE),
offset = 7
)),
DT::dataTableOutput("div")
)
), #Diversidade tab
# Similaridade ####
tabPanel("Índices de similaridade",
fluidPage(
h1("Índices de similaridade", style = "text-align: center;"),
br(),
fluidRow(
column(width=4,
h3("Configuração dos gráficos:")
),
column(width=5,
radioButtons("rb_msim_graph",
"Selecione o método de classificação:",
c("Vizinho mais próximo" = "single",
"Vizinho mais distante" = "complete",
"Distância euclidiana" = "average"),
selected = "complete", inline = T) ),
column(width=3,
sliderInput("slider_msim_graph",
label = "Selecione o número de clusters:",
min = 1,
max = 10,
value = 3,
step = 1) )
),
fluidRow(
tabsetPanel(id = "mainPanel_Indices",
tabPanel("Matriz de Similaridadede de Jaccard", DT::dataTableOutput("msim1") ),
tabPanel("Dendrograma Jaccard", plotOutput("msim1_graph_",height = "600px"), value="id_msim1_graph" ),
tabPanel("Matriz de Similaridadede de Sorensen", DT::dataTableOutput("msim2") ),
tabPanel("Dendrograma Sorensen", plotOutput("msim2_graph_",height = "600px"), value="id_msim2_graph" )
) )
)
), # Similaridade tab
# Agregação ####
tabPanel("Índices de agregação",
fluidPage(
h1("Índices de agregação", style = "text-align: center;"),
br(),
DT::dataTableOutput("agreg")
)
), # Agregação tab
# Estrutura ####
tabPanel("Análise Estrutural",
fluidPage(
h1("Análise estrutural", style = "text-align: center;"),
br(),
fluidRow( uiOutput("ivi_graph_opts")
),
fluidRow(
tabsetPanel(id = "mainPanel_Estrutural",
tabPanel("Análise estrutural", DT::dataTableOutput("estr") ),
tabPanel("Gráfico IVI", plotOutput("estrg",height = "550px" ) ),
tabPanel("Gráfico estrutura vertical", plotOutput("est.vert_plot", height = "550px")) )
) #,
# fluidRow( column(width=4,uiOutput("rb_graphmsim"),offset = 3 ),
# column(width=3,uiOutput("slider_graphmsim")) )
)
) # Estrutura tab
),# navbarMenu fitossociologica end ####
# navbarMenu Quantificacao ####
navbarMenu( "Quantificação",
# tabPanel DD ####
tabPanel("Distribuição diamétrica",
fluidPage(
h1("Distribuição diamétrica (DD)", style = "text-align: center;"),
br(),
tabsetPanel(
tabPanel("Distribuição diamétrica Geral", DT::dataTableOutput("dd_geral_tab") ),
tabPanel("Distribuição diamétrica dos indivíduos por ha por espécie", DT::dataTableOutput("dd_indv_especie_tab") ),
tabPanel("Distribuição diamétrica do volume por ha por espécie", DT::dataTableOutput("dd_vol_especie_tab") ),
tabPanel("Distribuição diamétrica de G por ha por espécie", DT::dataTableOutput("dd_G_especie_tab") ),
tabPanel("Gráfico dos indivíduos por ha por classe diamétrica", plotOutput("dd_graph_indv",height = "550px") ),
tabPanel("Gráfico do volume por ha por classe diamétrica", plotOutput("dd_graph_vol",height = "550px")),
tabPanel("Gráfico de G por ha por classe diamétrica", plotOutput("dd_graph_G",height = "550px"))
)
)
), # tabPanel DD
# tabPanel BDq ####
tabPanel("BDq",
fluidPage(
h1("BDq Meyer", style = "text-align: center;"),
br(),
fluidRow(column(width=5,
sliderInput("i.licourtBDq",
label = "Selecione um valor de quociente de Licourt:",
min = 0,
max = 5,
value = 1.3,
step = .1),
offset=7
)),
tabsetPanel(
tabPanel("BDq", DT::dataTableOutput("BDq1") ),
tabPanel("Gráfico", plotOutput( "BDq_graph_" ,height = "550px") ),
tabPanel("Detalhes do ajuste", DT::dataTableOutput("BDq3", "70%") )
)
)
),# tabPanel BDq
# tabPanel Estrutura volumétrica ####
# tabPanel("Estrutura volumétrica"),
# tabPanel inventario florestal ####
tabPanel("Inventário florestal",
fluidPage(
h1("Inventário florestal", style = "text-align: center;"),
br(),
# ####
fluidRow(
column(2,
sliderInput("alpha_inv",
label = "Selecione o nível de significância:",
min = 0.01,
max = 0.10,
value = 0.10,
step = 0.01)
),
column( 2, sliderInput("erro_inv",
label = "Selecione o erro admitido (%):",
min = 1,
max = 20,
value = 10,
step = 1)),
column(2,
sliderInput("cd_inv",
label = "Selecione o nº de casas decimais:",
min = 0,
max = 10,
value = 4,
step = 1)
),
column(2,
radioButtons(
inputId='pop_inv', # Id
label='Considerar a população infinita ou finita?', # nome que sera mostrado na UI
choices=c(Infinita="inf", Finita="fin"), # opcoes e seus nomes
selected="inf",
inline = T)
),
column(3,
uiOutput("acs_estrato_rb"), uiOutput("as_estrato_rb"),
uiOutput("acs_as_warning")
)
),
fluidRow(
radioButtons("yi_inv",
label="Selecione a variável utilizada nas estatísticas:",
choices = c("Indv", "G","VCC"),
selected = "VCC",
inline=T )
),
fluidRow(
tabsetPanel(id="tabset_inv",
tabPanel("Totalização de parcelas",DT::dataTableOutput("tot_parc_tab") ) ,
tabPanel("Amostragem casual simples",DT::dataTableOutput("acs") ),
tabPanel("Amostragem casual estratificada",DT::dataTableOutput("ace1"),br(),DT::dataTableOutput("ace2") ),
tabPanel("Amostragem sistemática",DT::dataTableOutput("as") ) )
)
# ####
)
)# TabPanel Inventario
), # navbarMenu Quantificacao end ####
# navbarMenu Download ####
tabPanel("Download",
# Painel Download Tabelas ####
fluidPage(
h1("Download dos resultados", style = "text-align: center;"),
br(),
tabsetPanel(
tabPanel("Download de tabelas",
fluidPage(
h2("Download de tabelas", style = "text-align: center;"),
br(),
fluidRow(
column(
10
,uiOutput("checkbox_df_download")
)
),
br(),
fluidRow(column(3,downloadButton('downloadData', 'Baixar tabelas selecionadas'), offset=4)),
br(),
h3("Ou, para baixar todas as tabelas disponíveis, clique abaixo:"),
fluidRow(
column(3,downloadButton('downloadAllData', 'Baixar todas as tabelas'), offset=4)
)
)
), # download tabelas
# Painel Download Graficos ####
tabPanel("Download de graficos",
sidebarLayout(
sidebarPanel(
tags$style(type="text/css",
".recalculating {opacity: 1.0;}"
),
h3("Download de graficos"),
selectInput("graph_d", "Escolha um grafico:",
choices = c(
"Dendrograma - Jaccard",
"Dendrograma - Sorensen",
"Grafico IVI",
"Grafico Estrutura Vertical",
"Indv. por ha por CC",
"Vol. por ha por CC",
"G por ha por CC",
"Distribuicao - BDq Meyer" )),
selectInput("graphformat",
"Escolha o formato do gráfico:",
choices = c("PNG" = ".png",
"JPG" = ".jpg",
"PDF" = ".pdf") ),
downloadButton('downloadGraph', 'Download')
),
mainPanel(
plotOutput("graph_d_out",height = "550px")
)
)
) # download graficos
)
) # fluidPage
) # final navbarMenu download ####
# final da UI ####
) # navbarPage
)#tagList
) # ShinyUI
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