illuminaio: Parsing Illumina Microarray Output Files

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Tools for parsing Illumina's microarray output files, including IDAT.

Author
Keith Baggerly [aut], Henrik Bengtsson [aut], Kasper Daniel Hansen [aut, cre], Matt Ritchie [aut], Mike L. Smith [aut], Tim Triche Jr. [ctb]
Date of publication
None
Maintainer
Kasper Daniel Hansen <kasperdanielhansen@gmail.com>
License
GPL-2
Version
0.16.0
URLs

View on Bioconductor

Man pages

readBGX
Low-level function to read BGX files
readBPM
Low-level function to read BPM files
readIDAT
Low-level function to read IDAT files

Files in this package

illuminaio/DESCRIPTION
illuminaio/NAMESPACE
illuminaio/NEWS
illuminaio/R
illuminaio/R/readBGX.R
illuminaio/R/readBPM.R
illuminaio/R/readIDAT.R
illuminaio/R/readIDAT_enc.R
illuminaio/R/readIDAT_nonenc.R
illuminaio/R/zzz.R
illuminaio/build
illuminaio/build/vignette.rds
illuminaio/inst
illuminaio/inst/CITATION
illuminaio/inst/doc
illuminaio/inst/doc/EncryptedFormat.Rnw
illuminaio/inst/doc/EncryptedFormat.pdf
illuminaio/inst/doc/illuminaio.R
illuminaio/inst/doc/illuminaio.Rnw
illuminaio/inst/doc/illuminaio.pdf
illuminaio/inst/unitTests
illuminaio/man
illuminaio/man/readBGX.Rd
illuminaio/man/readBPM.Rd
illuminaio/man/readIDAT.Rd
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illuminaio/src/des.c
illuminaio/src/des.h
illuminaio/src/local_des.c
illuminaio/tests
illuminaio/tests/readBPM.R
illuminaio/tests/readIDAT_370k.R
illuminaio/tests/readIDAT_370k_gz.R
illuminaio/tests/readIDAT_450k.R
illuminaio/tests/readIDAT_450k_gz.R
illuminaio/tests/readIDAT_gs_wg6v2.R
illuminaio/tests/readIDAT_ht12v4.R
illuminaio/tests/readIDAT_wg6v2.R
illuminaio/vignettes
illuminaio/vignettes/EncryptedFormat.Rnw
illuminaio/vignettes/illuminaio.Rnw
illuminaio/vignettes/illuminaio.bib