label.prop: Label propagation

Description Usage Arguments Details Value References Examples

Description

Function that implements the Label propagation algorithm of Zhu and Ghahramani

Usage

1
label.prop(W, ind.positives, tmax = 1000, eps = 1e-05, norm = TRUE)

Arguments

W

a numeric matrix representing the adjacency matrix of the graph

ind.positives

indices of the "core" positive examples of the graph. They represent the indices of W corresponding to the positive examples

tmax

maximum number of iterations (def: 1000)

eps

numeric. Maximum allowed difference between the computed probabilities at the steady state (def. 1e-5)

norm

boolean. If TRUE (def) the adjacency matrix W of the graph is normalized to M = D^{-1} * W, otherwise it is assumed that the matrix W is just normalized

Details

label.prop implements the label propagation algorithm on a given graph by performing 1 or more steps on the graph, depending on the value of the tmax parameter. It stops also if the difference of the norm of the scores between two consecutive steps is less than eps.

Value

A list with three elements:

p

numeric vector. Scores of each node at the steady state or after tmax iterations

ind.positives

indices of the "core" positive examples of the graph (it is equal to the same input parameter)

n.iter

number of performed steps/iterations

References

Zhu, X., Ghahramani, Z., Lafferty, J.: Semi-Supervised Learning Using Gaussian Fields and Harmonic Functions. In: Proc. of the Twentieth International Conference on Machine Learning, Washington DC (2003) 912-919

Examples

1
2
3
4
5
6
7
8
9
# Application of label prop algorithm to the prediction of the DrugBank category Penicillins
# using the Tanimoto chemical structure similarity network 
# between 1253 DrugBank drugs
library(bionetdata);
data(DD.chem.data);
data(DrugBank.Cat);
labels <- DrugBank.Cat[,"Penicillins"];
ind.pos <- which(labels==1);
label.prop(DD.chem.data, ind.pos, tmax = 10, eps = 1e-05, norm = TRUE);

Example output

RANKS: ranking and classification with kernelized score functions.

$p
               [,1]
DB00115 0.145642652
DB00116 0.170523407
DB00117 0.124820483
DB00118 0.132417449
DB00119 0.066023637
DB00120 0.176800627
DB00121 0.150488677
DB00122 0.073080508
DB00123 0.125955459
DB00125 0.132255510
DB00126 0.107059821
DB00127 0.084132511
DB00128 0.116425643
DB00129 0.123433628
DB00130 0.124433851
DB00131 0.124697364
DB00132 0.096083456
DB00133 0.100227695
DB00134 0.113561627
DB00135 0.179648015
DB00136 0.119055268
DB00138 0.099714880
DB00139 0.077592566
DB00140 0.150618780
DB00141 0.161317451
DB00142 0.122108829
DB00143 0.159718393
DB00144 0.119930763
DB00145 0.074849071
DB00146 0.114168703
DB00147 0.117942765
DB00148 0.088469385
DB00149 0.111118530
DB00150 0.171071467
DB00151 0.105066848
DB00152 0.106766083
DB00153 0.113996153
DB00154 0.096083456
DB00155 0.138467978
DB00156 0.117778409
DB00157 0.131966860
DB00158 0.159424195
DB00159 0.091008044
DB00160 0.099677586
DB00161 0.115437377
DB00162 0.082276951
DB00163 0.159041091
DB00165 0.110993946
DB00166 0.109290617
DB00167 0.124239715
DB00168 0.190092816
DB00169 0.116013084
DB00170 0.128538601
DB00171 0.124749011
DB00172 0.153463003
DB00173 0.076620064
DB00174 0.118239514
DB00175 0.140559098
DB00176 0.138882440
DB00177 0.171912439
DB00178 0.209587223
DB00179 0.151665104
DB00180 0.135237249
DB00181 0.168114584
DB00182 0.144590110
DB00183 0.182895331
DB00184 0.143813387
DB00185 0.141150695
DB00186 0.152685527
DB00187 0.180931355
DB00188 0.166432792
DB00189 0.061378964
DB00190 0.168020185
DB00191 0.139487054
DB00192 0.170565870
DB00193 0.185522112
DB00194 0.125971731
DB00195 0.171302697
DB00196 0.125710883
DB00198 0.167785510
DB00199 0.158611970
DB00200 0.123073953
DB00201 0.110846793
DB00202 0.117931471
DB00203 0.138418911
DB00204 0.162351372
DB00205 0.117853938
DB00206 0.176120123
DB00207 0.169940658
DB00208 0.140634778
DB00209 0.188285154
DB00210 0.155746427
DB00211 0.170301453
DB00212 0.182320006
DB00213 0.121460050
DB00214 0.136159323
DB00215 0.168055633
DB00216 0.165510034
DB00217 0.115417030
DB00218 0.170145093
DB00219 0.185636132
DB00220 0.183102255
DB00221 0.176778419
DB00222 0.159788523
DB00223 0.138990278
DB00224 0.186458185
DB00226 0.114860342
DB00227 0.142849335
DB00228 0.050783469
DB00229 0.151866522
DB00230 0.119620369
DB00231 0.154468774
DB00232 0.117535439
DB00233 0.134441348
DB00234 0.168708012
DB00235 0.111745096
DB00237 0.120254189
DB00238 0.135230451
DB00239 0.131127094
DB00240 0.142399006
DB00241 0.122563357
DB00242 0.130066675
DB00243 0.173315454
DB00245 0.186538757
DB00246 0.158026183
DB00247 0.167929172
DB00248 0.174384633
DB00249 0.134708330
DB00250 0.092299071
DB00251 0.152390596
DB00252 0.165141344
DB00253 0.136092729
DB00254 0.166349905
DB00255 0.142645325
DB00256 0.165865924
DB00257 0.131494076
DB00259 0.087516652
DB00260 0.102870903
DB00261 0.140065600
DB00262 0.072194445
DB00263 0.099220408
DB00264 0.161816151
DB00266 0.144139779
DB00267 0.149784751
DB00268 0.164141929
DB00269 0.139217295
DB00270 0.153670245
DB00272 0.092668117
DB00273 0.124315615
DB00274 0.137571686
DB00275 0.125648966
DB00276 0.112318122
DB00277 0.109640997
DB00278 0.173162042
DB00279 0.168087441
DB00280 0.165595202
DB00281 0.143618151
DB00282 0.073764530
DB00283 0.184414556
DB00284 0.150175415
DB00285 0.184969517
DB00286 0.152627024
DB00287 0.161734467
DB00288 0.142147089
DB00289 0.168716897
DB00290 0.143493322
DB00292 0.133774597
DB00293 0.160215229
DB00294 0.114148012
DB00295 0.170353625
DB00296 0.179802004
DB00297 0.173421788
DB00298 0.134230324
DB00299 0.120034321
DB00301 1.000000000
DB00302 0.126102904
DB00303 0.168210907
DB00304 0.069588260
DB00306 0.122113726
DB00307 0.144481897
DB00308 0.167945133
DB00309 0.169027180
DB00310 0.154254667
DB00311 0.110485505
DB00312 0.121610093
DB00313 0.087463464
DB00315 0.182368917
DB00316 0.127970675
DB00317 0.147968714
DB00318 0.169124393
DB00319 1.000000000
DB00320 0.177285189
DB00321 0.148997647
DB00322 0.136716175
DB00323 0.131722625
DB00324 0.132493297
DB00325 0.032281988
DB00327 0.183222949
DB00328 0.155823840
DB00330 0.110840001
DB00331 0.039907094
DB00332 0.196016957
DB00333 0.175392861
DB00334 0.111880602
DB00335 0.175659911
DB00336 0.087596373
DB00337 0.164842960
DB00338 0.125838074
DB00339 0.091625581
DB00340 0.153816498
DB00341 0.169835626
DB00342 0.179336408
DB00343 0.174471176
DB00344 0.158061544
DB00346 0.165119054
DB00347 0.124545900
DB00348 0.135875409
DB00349 0.137319017
DB00350 0.121455520
DB00351 0.127729931
DB00353 0.172270042
DB00354 0.147237716
DB00355 0.137785233
DB00356 0.121536162
DB00357 0.184040646
DB00358 0.169027894
DB00359 0.099581090
DB00360 0.130558349
DB00361 0.164167079
DB00363 0.131554395
DB00364 0.115369067
DB00365 0.159411844
DB00366 0.151876949
DB00367 0.084349630
DB00368 0.152026907
DB00369 0.112800657
DB00370 0.153149878
DB00371 0.095820344
DB00372 0.128337909
DB00373 0.124902566
DB00374 0.164303228
DB00376 0.184153030
DB00377 0.180383225
DB00378 0.114923941
DB00379 0.137136004
DB00380 0.128842489
DB00381 0.157547732
DB00382 0.138967157
DB00383 0.172791865
DB00384 0.108029634
DB00385 0.163841412
DB00387 0.184153030
DB00388 0.165154128
DB00389 0.090697849
DB00390 0.135665983
DB00391 0.160366544
DB00392 0.130570976
DB00393 0.157580358
DB00394 0.132866843
DB00396 0.117964288
DB00397 0.164557016
DB00398 0.145487688
DB00399 0.084523727
DB00400 0.149658639
DB00401 0.156272693
DB00402 0.137516479
DB00403 0.191890770
DB00404 0.120277523
DB00405 0.149080224
DB00407 0.146628212
DB00408 0.137132537
DB00409 0.164216298
DB00410 0.138451945
DB00411 0.090131592
DB00412 0.179271276
DB00413 0.121684080
DB00414 0.155474316
DB00415 1.000000000
DB00416 0.154671015
DB00417 1.000000000
DB00418 0.129385686
DB00419 0.147549908
DB00420 0.123453936
DB00421 0.133015487
DB00422 0.193297055
DB00423 0.119679804
DB00424 0.192748868
DB00425 0.136625867
DB00426 0.126929835
DB00427 0.145589517
DB00429 0.125128391
DB00430 0.172355528
DB00431 0.057247278
DB00432 0.135438108
DB00433 0.134560014
DB00434 0.154345030
DB00435 0.016827133
DB00436 0.139590474
DB00437 0.096086985
DB00438 0.155480695
DB00440 0.130727935
DB00441 0.133273417
DB00443 0.136148469
DB00444 0.152056412
DB00445 0.158056790
DB00446 0.172010520
DB00447 0.188664967
DB00448 0.126838885
DB00449 0.169242862
DB00450 0.159175917
DB00451 0.168087441
DB00452 0.139762625
DB00453 0.162024148
DB00454 0.188672002
DB00455 0.171119225
DB00456 0.169461408
DB00457 0.140271912
DB00458 0.154472838
DB00459 0.129013863
DB00461 0.157621179
DB00462 0.197699556
DB00463 0.114495544
DB00464 0.071629279
DB00465 0.151706146
DB00466 0.140302247
DB00467 0.151479547
DB00468 0.188145442
DB00469 0.128671161
DB00470 0.154407215
DB00471 0.154997530
DB00472 0.164780139
DB00473 0.173698211
DB00474 0.028759386
DB00475 0.116705493
DB00476 0.154283575
DB00477 0.124723148
DB00478 0.095776116
DB00479 0.166022084
DB00480 0.168312883
DB00481 0.153525349
DB00482 0.113153747
DB00483 0.122011783
DB00484 0.113189315
DB00485 1.000000000
DB00486 0.166560356
DB00487 0.159939123
DB00489 0.155627723
DB00490 0.146551650
DB00491 0.146892337
DB00492 0.170698802
DB00493 0.153514022
DB00494 0.098282630
DB00495 0.135090560
DB00496 0.193194030
DB00497 0.181469537
DB00498 0.138514285
DB00499 0.139687260
DB00500 0.139329791
DB00501 0.093301979
DB00502 0.180537568
DB00503 0.169793601
DB00504 0.182335555
DB00505 0.181682970
DB00506 0.084349630
DB00507 0.132064816
DB00508 0.133129212
DB00509 0.162778092
DB00510 0.086983274
DB00511 0.136391748
DB00512 0.169425910
DB00513 0.112959508
DB00514 0.183828875
DB00517 0.168554543
DB00518 0.114739024
DB00519 0.209963388
DB00521 0.177874700
DB00522 0.194715611
DB00523 0.091476081
DB00524 0.136681585
DB00527 0.165101980
DB00528 0.170444644
DB00529 0.036581498
DB00530 0.129931481
DB00532 0.172715056
DB00534 0.100452350
DB00535 0.152983512
DB00536 0.028610322
DB00537 0.163797939
DB00539 0.159533607
DB00540 0.148997647
DB00541 0.166687541
DB00542 0.195756238
DB00543 0.137132537
DB00544 0.093377143
DB00545 0.102805169
DB00546 0.124265739
DB00547 0.135412767
DB00548 0.088800525
DB00549 0.160858633
DB00550 0.108660550
DB00551 0.059875853
DB00552 0.132624104
DB00554 0.139947684
DB00555 0.103779246
DB00557 0.164792199
DB00558 0.143394096
DB00559 0.123045144
DB00560 0.167196103
DB00561 0.192939960
DB00562 0.134329777
DB00563 0.167245526
DB00564 0.126804443
DB00565 0.183139248
DB00567 0.184556732
DB00568 0.143018769
DB00569 0.137897831
DB00570 0.166115714
DB00571 0.146803643
DB00572 0.196016957
DB00573 0.146635424
DB00575 0.112805313
DB00576 0.102385178
DB00577 0.129998285
DB00579 0.143945844
DB00581 0.117892537
DB00582 0.136030610
DB00583 0.125586068
DB00584 0.204819072
DB00585 0.103666760
DB00586 0.153447392
DB00587 0.161770284
DB00588 0.135991803
DB00589 0.162274133
DB00590 0.154901677
DB00591 0.135268553
DB00592 0.073180894
DB00593 0.127766798
DB00594 0.096461922
DB00595 0.166547253
DB00596 0.140744947
DB00598 0.182666831
DB00599 0.119522610
DB00600 0.119920155
DB00602 0.132094018
DB00603 0.131969441
DB00604 0.172876352
DB00605 0.143009716
DB00606 0.136148030
DB00607 1.000000000
DB00608 0.145926427
DB00609 0.119571123
DB00610 0.166132805
DB00611 0.186533271
DB00612 0.151779842
DB00613 0.144892310
DB00615 0.149178660
DB00616 0.197381657
DB00617 0.135901355
DB00618 0.165945112
DB00619 0.143464166
DB00620 0.136148280
DB00621 0.141939512
DB00622 0.165705039
DB00623 0.151216498
DB00624 0.133448904
DB00625 0.145498355
DB00626 0.167533632
DB00627 0.114852262
DB00628 0.165038070
DB00629 0.099094986
DB00630 0.078460957
DB00631 0.124500571
DB00632 0.069233742
DB00633 0.117029579
DB00634 0.103217691
DB00635 0.134296007
DB00636 0.120732298
DB00637 0.124790350
DB00640 0.125971731
DB00641 0.140715511
DB00642 0.166445021
DB00643 0.147821365
DB00644 0.175522201
DB00645 0.189715144
DB00647 0.174940210
DB00648 0.106779649
DB00649 0.122867685
DB00650 0.171212104
DB00651 0.113844846
DB00652 0.179765747
DB00653 0.017374863
DB00654 0.173595144
DB00655 0.162245098
DB00656 0.131539087
DB00657 0.107211595
DB00659 0.095285584
DB00661 0.168595813
DB00663 0.139470945
DB00664 0.100924175
DB00665 0.145345873
DB00666 0.177737300
DB00667 0.093122607
DB00668 0.163816936
DB00669 0.145660629
DB00670 0.141638430
DB00671 0.150403348
DB00672 0.124064397
DB00673 0.147898856
DB00674 0.163206158
DB00675 0.164631722
DB00677 0.052574746
DB00678 0.123125287
DB00679 0.135908489
DB00680 0.149293634
DB00682 0.144985792
DB00683 0.125973602
DB00684 0.140411852
DB00685 0.155760832
DB00686 0.114336650
DB00687 0.133185673
DB00688 0.169336145
DB00690 0.149858429
DB00691 0.192617270
DB00692 0.142180561
DB00693 0.122189293
DB00694 0.158056790
DB00695 0.136063385
DB00696 0.172107538
DB00697 0.114311272
DB00698 0.107295591
DB00699 0.172377026
DB00700 0.137417910
DB00701 0.171281789
DB00703 0.083458746
DB00704 0.182778077
DB00705 0.148831834
DB00706 0.172643009
DB00707 0.151807473
DB00708 0.175222912
DB00709 0.117301035
DB00710 0.104948993
DB00711 0.098984200
DB00712 0.129288705
DB00713 1.000000000
DB00714 0.161680468
DB00715 0.177524586
DB00716 0.150888593
DB00717 0.065272777
DB00718 0.124624560
DB00719 0.154779292
DB00720 0.029155587
DB00721 0.152710024
DB00722 0.201196768
DB00723 0.153897387
DB00724 0.109061656
DB00725 0.195019169
DB00726 0.154472838
DB00727 0.054482254
DB00728 0.171312166
DB00729 0.161933404
DB00730 0.098227734
DB00731 0.203129336
DB00732 0.181246654
DB00733 0.084412844
DB00734 0.136059493
DB00735 0.124746370
DB00736 0.125838074
DB00737 0.148120502
DB00738 0.146972469
DB00739 1.000000000
DB00740 0.102027424
DB00741 0.136058864
DB00744 0.137676623
DB00745 0.139274862
DB00747 0.189785065
DB00748 0.153913022
DB00749 0.151078814
DB00750 0.157472947
DB00751 0.139328311
DB00752 0.149492853
DB00753 0.048148073
DB00754 0.168107434
DB00755 0.091476081
DB00756 0.129058591
DB00757 0.184125469
DB00758 0.167148754
DB00759 0.166541646
DB00760 0.154174410
DB00762 0.149061265
DB00763 0.055650985
DB00764 0.134079898
DB00765 0.174078637
DB00766 0.142309610
DB00767 0.181879740
DB00768 0.154227899
DB00769 0.150780448
DB00770 0.126470329
DB00771 0.189097903
DB00772 0.092264171
DB00773 0.155797446
DB00774 0.119106533
DB00775 0.178054541
DB00776 0.150371763
DB00777 0.159018055
DB00778 0.144300019
DB00780 0.129059752
DB00782 0.171288853
DB00783 0.160766619
DB00784 0.136958964
DB00786 0.152884512
DB00787 0.108873076
DB00788 0.154239341
DB00789 0.140783441
DB00790 0.180748809
DB00792 0.135357909
DB00794 0.169661463
DB00795 0.131538521
DB00796 0.126929001
DB00797 0.141565253
DB00798 0.135993078
DB00799 0.121901801
DB00800 0.158585925
DB00801 0.149685675
DB00802 0.163581081
DB00804 0.146370503
DB00805 0.136910653
DB00806 0.131002804
DB00807 0.159932734
DB00808 0.153881124
DB00809 0.172840719
DB00810 0.181510973
DB00811 0.117288605
DB00812 0.143100666
DB00813 0.181389899
DB00814 0.123591559
DB00816 0.162910761
DB00817 0.159626225
DB00818 0.124173633
DB00819 0.090128664
DB00820 0.172412792
DB00821 0.154234961
DB00822 0.058787648
DB00823 0.110798855
DB00824 0.117569376
DB00825 0.105354417
DB00827 0.154886701
DB00828 0.082289307
DB00829 0.150156238
DB00830 0.177090789
DB00831 0.139454137
DB00833 0.177942629
DB00834 0.011666352
DB00835 0.147285945
DB00836 0.190744505
DB00837 0.138844039
DB00838 0.137400536
DB00839 0.142025716
DB00841 0.174724106
DB00842 0.154468774
DB00843 0.180833804
DB00844 0.179135878
DB00845 0.115547566
DB00846 0.135267727
DB00847 0.047907453
DB00848 0.148158659
DB00849 0.167189935
DB00850 0.146687019
DB00851 0.089774352
DB00852 0.176235054
DB00854 0.182869953
DB00855 0.109990033
DB00857 0.055749084
DB00858 0.143529430
DB00860 0.136440146
DB00861 0.118366470
DB00862 0.126064232
DB00863 0.113999362
DB00864 0.164321465
DB00865 0.158742476
DB00866 0.158836384
DB00867 0.186191196
DB00868 0.162301847
DB00869 0.117705931
DB00870 0.127951320
DB00871 0.162910761
DB00872 0.140769062
DB00873 0.136173529
DB00875 0.147434945
DB00876 0.137404893
DB00877 0.165177300
DB00879 0.115659313
DB00880 0.107468153
DB00881 0.194664126
DB00882 0.156804782
DB00883 0.112542080
DB00884 0.112850835
DB00885 0.111628233
DB00887 0.152346992
DB00889 0.150349121
DB00890 0.139538934
DB00891 0.098541903
DB00892 0.164656616
DB00894 0.148049683
DB00896 0.132518127
DB00897 0.119976193
DB00898 0.039450733
DB00899 0.172659926
DB00900 0.124917904
DB00902 0.133300783
DB00903 0.148082543
DB00904 0.146003384
DB00905 0.185250309
DB00906 0.161363090
DB00907 0.188102797
DB00908 0.187703333
DB00909 0.104015398
DB00912 0.186249085
DB00913 0.195337732
DB00914 0.139735046
DB00915 0.095776116
DB00916 0.082660795
DB00917 0.125362650
DB00918 0.151047600
DB00919 0.156278421
DB00920 0.151762069
DB00921 0.175041647
DB00922 0.138962030
DB00923 0.168774692
DB00924 0.143056134
DB00925 0.149587731
DB00927 0.102779179
DB00928 0.135895084
DB00929 0.132531157
DB00932 0.149361944
DB00933 0.139688745
DB00934 0.157748509
DB00935 0.148362509
DB00936 0.124123704
DB00937 0.168074280
DB00938 0.188315878
DB00939 0.139189614
DB00940 0.171288853
DB00941 0.153617938
DB00942 0.184153030
DB00943 0.132676624
DB00944 0.145260242
DB00945 0.129694449
DB00946 0.144619040
DB00947 0.155714131
DB00948 1.000000000
DB00949 0.141589821
DB00950 0.187927779
DB00951 0.112301850
DB00952 0.158273834
DB00953 0.145920226
DB00955 0.146355698
DB00956 0.181877862
DB00957 0.065272777
DB00959 0.135845790
DB00960 0.148016872
DB00961 0.172959513
DB00962 0.137228570
DB00963 0.144128141
DB00964 0.111278526
DB00966 0.139410672
DB00967 0.155419411
DB00968 0.171217350
DB00969 0.149612090
DB00972 0.150238540
DB00973 0.192022807
DB00975 0.135572111
DB00977 0.065272777
DB00978 0.162090796
DB00979 0.184482094
DB00980 0.182456168
DB00981 0.170541037
DB00982 0.091476081
DB00983 0.179845284
DB00984 0.176333603
DB00985 0.145362444
DB00986 0.189266355
DB00987 0.133802995
DB00988 0.143652604
DB00989 0.152961999
DB00990 0.114200628
DB00991 0.122390776
DB00992 0.115332431
DB00993 0.099534319
DB00994 0.139762625
DB00995 0.112049722
DB00996 0.124875772
DB00997 0.158056790
DB00998 0.165138080
DB00999 0.108396225
DB01000 1.000000000
DB01001 0.161736686
DB01002 0.179802004
DB01003 0.138333357
DB01004 0.112263239
DB01005 0.042334248
DB01006 0.008797501
DB01007 0.135892457
DB01009 0.137474465
DB01010 0.118354252
DB01011 0.127531634
DB01012 0.157680538
DB01013 0.149434323
DB01014 0.155230026
DB01015 0.103730870
DB01016 0.166526215
DB01017 0.169657474
DB01018 0.156482275
DB01019 0.102849746
DB01020 0.112542080
DB01021 0.117446560
DB01022 0.144994604
DB01023 0.156946596
DB01024 0.148665894
DB01025 0.140070782
DB01026 0.163279114
DB01028 0.046989765
DB01029 0.145871395
DB01030 0.144885846
DB01031 0.111458202
DB01032 0.144463526
DB01033 0.093063806
DB01034 0.143641135
DB01035 0.147524116
DB01036 0.164715950
DB01037 0.159401780
DB01038 0.169505678
DB01039 0.150847013
DB01041 0.167288637
DB01043 0.095776116
DB01044 0.162031716
DB01045 0.157914447
DB01046 0.137309528
DB01047 0.136738187
DB01048 0.132182377
DB01049 0.178384025
DB01050 0.142026358
DB01051 0.158261290
DB01054 0.160475681
DB01055 0.115943016
DB01056 0.152095125
DB01057 0.074718280
DB01059 0.159939123
DB01060 1.000000000
DB01061 1.000000000
DB01062 0.055373274
DB01063 0.163313959
DB01064 0.164013396
DB01065 0.172579804
DB01066 0.149226169
DB01067 0.151527176
DB01068 0.143771712
DB01069 0.126454548
DB01070 0.094932958
DB01071 0.138227368
DB01072 0.176041617
DB01073 0.123616889
DB01074 0.115543161
DB01075 0.155412687
DB01076 0.154324561
DB01077 0.044151307
DB01078 0.136577572
DB01080 0.109234133
DB01081 0.148759572
DB01082 0.148788957
DB01083 0.165950781
DB01084 0.129646251
DB01085 0.132040160
DB01086 0.136472510
DB01087 0.145117679
DB01088 0.021150178
DB01089 0.177231710
DB01090 0.108794385
DB01091 0.143052417
DB01092 0.137984181
DB01093 0.026986040
DB01094 0.156594785
DB01095 0.156207230
DB01097 0.130599763
DB01098 0.146501351
DB01099 0.073897834
DB01100 0.163339029
DB01101 0.133753079
DB01102 0.183405816
DB01103 0.157896860
DB01104 0.157569648
DB01105 0.164965167
DB01106 0.195506239
DB01107 0.131977357
DB01108 0.122333703
DB01109 0.146628212
DB01110 0.140879387
DB01112 0.158639080
DB01113 0.140081431
DB01114 0.153059386
DB01115 0.155041940
DB01116 0.163450892
DB01117 0.149124720
DB01118 0.146269429
DB01119 0.126520649
DB01120 0.146179810
DB01121 0.159412272
DB01122 0.146777352
DB01123 0.094243955
DB01124 0.137787745
DB01125 0.154170251
DB01126 0.169040593
DB01127 0.140879387
DB01128 0.150208626
DB01129 0.134354527
DB01130 0.125394885
DB01131 0.101474347
DB01132 0.176880220
DB01133 0.074706193
DB01134 0.124405127
DB01135 0.170547401
DB01136 0.151685981
DB01137 0.156251203
DB01138 0.133651419
DB01139 0.163018102
DB01140 0.179010599
DB01142 0.147008136
DB01143 0.086787395
DB01144 0.087550183
DB01145 0.099213042
DB01146 0.173656877
DB01147 1.000000000
DB01148 0.165978743
DB01149 0.143010180
DB01150 0.178734495
DB01151 0.154472838
DB01153 0.138186581
DB01154 0.121996148
DB01155 0.147524357
DB01156 0.165554970
DB01157 0.139091229
DB01158 0.112087470
DB01159 0.030897438
DB01160 0.132517055
DB01161 0.151746370
DB01162 0.169042892
DB01163 1.000000000
DB01165 0.156872262
DB01166 0.167687793
DB01167 0.154885558
DB01169 0.033292430
DB01170 0.107251848
DB01171 0.160763121
DB01172 0.140885902
DB01173 0.154222876
DB01174 0.167879708
DB01175 0.168055633
DB01176 0.146819815
DB01177 0.158092239
DB01178 0.145953506
DB01179 0.165299619
DB01180 0.174581102
DB01182 0.178679166
DB01183 0.182012574
DB01184 0.146794251
DB01185 0.130713289
DB01186 0.160205505
DB01189 0.049527174
DB01190 0.156781652
DB01191 0.145144385
DB01192 0.182778077
DB01193 0.174206464
DB01194 0.126829121
DB01195 0.166292216
DB01196 0.169886698
DB01197 0.163310199
DB01198 0.134037316
DB01199 0.155239373
DB01200 0.167105832
DB01201 0.160468403
DB01202 0.137400661
DB01203 0.169362243
DB01204 0.156748736
DB01205 0.135831083
DB01207 0.141671145
DB01208 0.165150632
DB01209 0.165597224
DB01210 0.182354676
DB01211 0.156621517
DB01212 0.146611074
DB01213 0.064337290
DB01214 0.155530828
DB01215 0.121327046
DB01216 0.149211506
DB01217 0.028759386
DB01218 0.171458859
DB01219 0.117652632
DB01220 0.147455402
DB01221 0.173815231
DB01222 0.139880127
DB01223 0.112900360
DB01224 0.139264603
DB01225 0.146628212
DB01226 0.180524317
DB01227 0.186420952
DB01228 0.182522985
DB01229 0.175567609
DB01231 0.181973303
DB01232 0.189683241
DB01233 0.149392865
DB01234 0.136148469
DB01235 0.177589160
DB01236 0.053258878
DB01237 0.149985196
DB01238 0.183303357
DB01239 0.136616625
DB01240 0.129214498
DB01241 0.148255910
DB01242 0.153649282
DB01244 0.170495514
DB01245 0.086619169
DB01246 0.123453936
DB01247 0.115767878
DB01248 0.172608746
DB01251 0.168284822
DB01252 0.194625486
DB01253 0.170627441
DB01254 0.135718666
DB01255 0.188279605
DB01256 0.161915015
DB01258 0.194310102
DB01259 0.142853485
DB01260 0.138922425
DB01261 0.153610477
DB01262 0.137345060
DB01263 0.158221778
DB01264 0.171772148
DB01265 0.138648051
DB01267 0.144469777
DB01268 0.156952257
DB01273 0.161884691
DB01274 0.181562210
DB01275 0.085798428
DB01282 0.190391773
DB01283 0.146451041
DB01288 0.174103099
DB01291 0.144980093
DB01294 0.112625214
DB01295 0.167210452
DB01297 0.164303031
DB01298 0.110089189
DB01299 0.102055099
DB01301 0.165520071
DB01303 0.115677617
DB01319 0.163879806
DB01320 0.159887700
DB01321 0.153939144
DB01324 0.124927332
DB01325 0.146582015
DB01326 0.173580698
DB01327 0.139006791
DB01328 0.166630602
DB01329 0.176158735
DB01331 0.163477305
DB01332 0.153464757
DB01333 0.163506972
DB01334 0.170547401
DB01336 0.155239373
DB01337 0.173602614
DB01338 0.175333868
DB01339 0.173602614
DB01340 0.191239903
DB01342 0.117807795
DB01348 0.195889671
DB01351 0.121610093
DB01353 0.121610093
DB01354 0.128589124
DB01355 0.128239157
DB01357 0.065272777
DB01359 0.176455662
DB01361 0.159252661
DB01364 0.176235054
DB01365 0.151853930
DB01366 0.173141348
DB01367 0.011666352
DB01369 0.182955955
DB01380 0.140675627
DB01382 0.109089019
DB01384 0.131433905
DB01392 0.181454557
DB01393 0.177053435
DB01394 0.155985509
DB01395 0.144547628
DB01396 0.137203482
DB01398 0.123640687
DB01400 0.112974220
DB01403 0.140174412
DB01406 0.065272777
DB01407 0.162537340
DB01408 0.159667024
DB01409 0.178538669
DB01410 0.142930443
DB01411 0.154856569
DB01412 0.111211139
DB01413 0.153567205
DB01414 0.151860928
DB01415 0.157767378
DB01416 0.154828557
DB01418 0.147433648
DB01420 0.144496416
DB01421 0.139762625
DB01422 0.100077125
DB01425 0.165539138
DB01426 0.178259643
DB01427 0.126391908
DB01429 0.164414355
DB01430 0.134861879
DB01431 0.117200391
DB01433 0.184123260
DB01436 0.119055268
DB01437 0.182221411
DB01438 0.089868494
DB01440 0.077888598
DB01463 0.171009105
DB01544 0.138802839
DB01558 0.142626265
DB01559 0.134257347
DB01567 0.145936252
DB01576 0.144590110
DB01577 0.156301492
DB01579 0.177090789
DB01580 0.137862331
DB01581 0.108324414
DB01582 0.108133536
DB01583 0.170094341
DB01586 0.133761553
DB01587 0.151877144
DB01588 0.162655927
DB01589 0.132542487
DB01590 0.164089366
DB01591 0.188398258
DB01594 0.141422812
DB01595 0.142174904
DB01597 0.158132857
DB01598 0.152427234
DB01599 0.123554993
DB01601 0.191284627
DB01602 1.000000000
DB01603 1.000000000
DB01604 1.000000000
DB01605 1.000000000
DB01606 0.151856187
DB01607 1.000000000
DB01608 0.141397899
DB01611 0.158878200
DB01612 0.060058086
DB01613 0.059856222
DB01614 0.149802094
DB01615 0.152403135
DB01616 0.157961813
DB01618 0.161512423
DB01619 0.150045480
DB01620 0.151038577
DB01621 0.144963089
DB01622 0.130537987
DB01623 0.139777630
DB01624 0.153980104
DB01625 0.175030565
DB01626 0.052452409
DB01627 0.159905742
DB01628 0.123069139
DB01764 0.152829628
DB02300 0.102366374
DB02546 0.151428512
DB02638 0.184947587
DB02703 0.137227083
DB04552 0.135332088
DB04570 0.164239075
DB04573 0.161900121
DB04574 0.152866385
DB04575 0.065272777
DB04786 0.136594261
DB04794 0.129802609
DB04835 0.161597246
DB04837 0.168271223
DB04838 0.155258714
DB04839 0.128531370
DB04840 0.145685847
DB04841 0.140015535
DB04842 0.170069485
DB04843 0.186472699
DB04844 0.180739150
DB04845 0.159765702
DB04861 0.175206805
DB04868 0.131817477
DB04876 0.162804217
DB04877 0.167840314
DB04878 0.147753609
DB04880 0.155340504
DB04890 0.179346203
DB04894 0.174540213
DB04896 0.180217452
DB04898 0.186337597
DB04930 0.148799006
DB04942 0.171323944
DB04948 0.140565196
DB04967 0.144012882
DB05246 0.175083679
DB05260 0.017530653
DB05265 0.156080173
DB05266 0.129209566
DB05271 0.163473547
DB05630 0.096644937
DB06144 0.163352111
DB06147 0.096683589
DB06148 0.155173058
DB06155 0.128145142
DB06196 0.180696900
DB06209 0.159808680
DB06262 0.177042140
DB06267 0.143788640
DB06274 0.194408265
DB06287 0.163803965
DB06288 0.160149998
DB06694 0.138761540
DB06695 0.160637798
DB06696 0.152548433
DB06698 0.136841959
DB06699 0.187217005
DB06700 0.183384902
DB06702 0.174769885
DB06706 0.084323956
DB06707 0.164969471
DB06710 0.115034553
DB06711 0.145511212
DB06712 0.160475681
DB06714 0.099881998
DB06716 0.116640787
DB06717 0.139959143
DB06725 0.127364202
DB06766 0.143686590
DB06772 0.172407251
DB06781 0.137502357
DB06802 0.149282674
DB08795 1.000000000
DB08798 0.105770945
DB08799 0.134701159
DB08800 0.138171762
DB08801 0.149987799
DB08802 0.126711005
DB08804 0.143370888
DB08806 0.174121666
DB08807 0.167807127
DB08808 0.154949235

$ind.positives
DB00301 DB00319 DB00415 DB00417 DB00485 DB00607 DB00713 DB00739 DB00948 DB01000 
    175     191     278     280     344     449     544     570     750     795 
DB01060 DB01061 DB01147 DB01163 DB01602 DB01603 DB01604 DB01605 DB01607 DB08795 
    848     849     931     946    1147    1148    1149    1150    1152    1244 

$n.iter
[1] 10

RANKS documentation built on May 1, 2019, 9:27 p.m.