calcular_incidencia_sex: Calcular incidencia por sexo

In sivirep: Data Wrangling and Automated Reports from 'SIVIGILA' Source

Calcular incidencia por sexo

Description

Función que calcula la incidencia de una enfermedad o evento para todos los departamentos de Colombia o los municipios de un departamento por cada sexo.

Usage

calcular_incidencia_sex(
  data_incidencia = NULL,
  ruta_dir = NULL,
  cache = FALSE,
  data_agrupada,
  year = NULL,
  dpto = NULL,
  mpio = NULL
)

Arguments

data_incidencia	Un 'data.frame' que contiene las proyecciones poblacionales del DANE; su valor por defecto es 'NULL'.
ruta_dir	Un 'character' (cadena de caracteres) que especifica la ruta del directorio donde se almacenarán la población a riesgo o las proyecciones poblacionales DANE. Su valor por defecto es 'NULL'.
cache	Un 'logical' ('TRUE' o 'FALSE') que indica si la población a riesgo o las proyecciones poblacionales DANE descargadas deben ser almacenados en caché. Su valor por defecto es 'FALSE'.
data_agrupada	Un 'data.frame' que contiene los datos de la enfermedad agrupados por departamento o municipio y número de casos.
year	Un 'numeric' (numérico) con el año que se debe tomar en la población a riesgo o en las proyecciones poblacionales DANE; su valor por defecto es 'NULL'.
dpto	Un 'character' (cadena de caracteres) o 'numeric' (numérico) que contiene el código o nombre del departamento; su valor por defecto es 'NULL'.
mpio	Un 'character' (cadena de caracteres) o 'numeric' (numérico) que contiene el código o nombre del municipio; su valor por defecto es 'NULL'.

Value

Un 'data.frame' con el cálculo de la incidencia para todos los departamentos de Colombia o los municipios de un departamento por sexo.

Examples

data(dengue2020)
data_limpia <- limpiar_data_sivigila(data_event = dengue2020)
# Cálculo de la incidencia con proyecciones poblacionales por sexo y
# departamento
data_filtrada <- geo_filtro(
  data_event = data_limpia,
  dpto = "05"
)
data_agrupada <- agrupar_sex(data_filtrada)
if (interactive()) {
  calcular_incidencia_sex(
    data_agrupada = data_agrupada,
    dpto = "05",
    year = 2020,
    cache = TRUE
  )
}
#' Cálculo de la incidencia con proyecciones poblacionales por sexo y
# municipio
data_filtrada <- geo_filtro(
  data_event = data_limpia,
  dpto = "05",
  mpio = "Medellin"
)
calcular_incidencia_sex(
  data_agrupada = data_agrupada,
  dpto = "05",
  mpio = "Medellin",
  ruta_dir = tempdir()
)

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