get_sim_capitulos: Get mortality data from SIM for several capítulos

In bigdata-icict/pcdasindi: Calculates health indicators to Brazil

Description

This function retrieves mortality data from PCDaS ElasticSearch cluster for a specified year and for several capítulos.

Usage

get_sim_capitulos(conn, ano, agr, causabas_capitulos)

Arguments

conn	Connection object created with pcdas_connect.
ano	numeric. Year of death.
causabas_capitulos	string vector of desired capítulos.
agg	string. Aggregation level. 'mun' for municipalities, 'uf' for "unidades federativas" or 'regsaude' for "regiões de saúde".

Details

This function uses raw data from the Sistema de Informações de Mortalidade (SIM) available at the PCDaS ElasticSearch cluster. A documentation about this data can be found at https://bigdata-metadados.icict.fiocruz.br/dataset/sistema-de-informacoes-de-mortalidade-sim. The CID-10 codes and name for chapters, group, category and subcategories of basic cause of death can be inspected at the same address above.

Value

A data.frame containing number of deceased (sim) for the aggregation level.

Examples

sim <- get_sim_capitulos(conn = conn, ano = 2010, agr = "mun", causabas_capitulos = c("I.   Algumas doenças infecciosas e parasitárias", "II.  Neoplasias (tumores)"))

bigdata-icict/pcdasindi documentation built on March 11, 2020, 5:15 p.m.