scale_tabs: Conversion tables for cover-abundance scales

scale_tabsR Documentation

Conversion tables for cover-abundance scales

Description

Dataset containing the conversion tables for cover-abundance scales used by the functions of this package, e.g. cov2per and merge_taxa.

Usage

data(scale_tabs)

Format

A list of 6 dataframes, each containing one conversion table

  • "braun.blanquet" - Braun-Blanquet scale (Braun-Blanquet 1929, 1964). Conversion based on default values of the Turboveg program (Hennekens & Schaminee 2001).

  • "braun.blanquet2" - Extended Braun-Blanquet scale (Reichelt & Wilmanns 1973). Conversion based on default values of the Turboveg program (Hennekens & Schaminee 2001).

  • "kohler" - Kohler scale (Kohler 1978). Own conversion adapted from Lüderitz et al. (2009) and Janauer & Heindl (1998).

  • "kohler.zeltner" - Simplified 3-level Kohler scale (Kohler & Zeltner 1974). Own conversion.

  • "londo" - Londo scale (Londo 1976).

  • "niwap" - Scale used by Lower Saxony species survey programs (Schacherer 2001). Own conversion as approximation based on a/b-values, which are based on individual counts. Needs to be adapted to sample sizes.

  • "pa" - Presence/absence data (1/0).

Each dataframe has three columns:

  • "code" - Cover-abundance code of scale

  • "cov_mean" - Mean percentage cover of class for transformation into percentage values. All code values will be transformed to the corresponding value by cov2per

  • "cov_max" - Maximum percentage cover of class. All values greater then the next lower class value up to this value will be transformed to the corresponding code by per2cov

References

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Janauer, G. A. & Heindl, E. (1998): Die Schätzskala nach Kohler: Zur Gültigkeit der Funktion f(y) = ax3 als Maß für die Pflanzenmenge von Makrophyten. Verhandlungen der zoologisch-botanischen Gesellschaft in Wien, 135: 117–128.

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Kohler, A. (1978): Methoden der Kartierung von Flora und Vegetation von Süßwasserbiotopen. Landschaft + Stadt, 10: 73–85.

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Reichelt, G. & Wilmanns, O. (1973): Vegetationsgeographie. Braunschweig: Westermann.

Tichý, L., Hennekens, S. M., Novák, P., Rodwell, J. S., Schaminée, J. H. J. & Chytrý, M. (2020): Optimal transformation of species cover for vegetation classification. Applied Vegetation Science, 23: 710–717. \Sexpr[results=rd]{tools:::Rd_expr_doi("https://doi.org/10.1111/avsc.12510")}

Schacherer, A. (2001): Das Niedersächsische Pflanzenartenerfassungsprogramm. Herausgegeben vom Niedersächsischen Landesamt für Ökologie - Fachbehörde für Naturschutz. Informationsdienst Naturschutz Niedersachsen, 21(5 - Supplement Pflanzen): 1–20.


fgoral/goeveg documentation built on Feb. 27, 2024, 6:32 a.m.