MapEcol.camp | R Documentation |
Utiliza los datos del Camp representar la variación geográfica de los índices ecológicos
MapEcol.camp(
gr,
esp = "999",
camp,
dns = "Porc",
ind = "n",
indec = "div",
plot = TRUE,
subtit = TRUE,
bw = FALSE,
ti = " ",
idi = "l",
es = TRUE,
out.dat = FALSE,
layout = NA,
cex.pt = 1,
cexleg = 1,
years = TRUE,
graf = FALSE,
xpng = 1200,
ypng = 800,
ppng = 15
)
gr |
Grupo de la especie: 1 peces, 2 crustáceos 3 moluscos 4 equinodermos 5 invertebrados. 6 Desechos y otros no se incluye en esta función |
esp |
ha de ser 999 cuando se quiere incluir todas las especies del grupo, o elegir todas las especies deseadas con los codigos de las especies |
camp |
Campaña de la que se extraen los datos: un año comcreto (XX): Demersales "NXX", Porcupine "PXX", Arsa primavera "1XX" y Arsa otoño "2XX" |
dns |
Elige el origen de las bases de datos: Porcupine "Porc" o "Pnew", Cantábrico "Cant, Golfo de Cádiz "Arsa" (únicamente para sacar datos al IBTS, no gráficos) |
ind |
Elige el valor (n)úmero o (p)eso sobre el que se calculan los índices de diversidad, dominancia.... |
indec |
Elige el índice ecológico a representar: opciones disponibles: Shannon-Wiener: 'div', Número de especies: 'nesp' y Diversidad Simpson: 'simp'. |
plot |
Saca el gráfico (si T) o si se salva como objeto se puede componer para componer con otros gráficos de lattice (F) |
subtit |
Si T, es el valor por defecto, incluye un subtítulo abajo del gráfico con el índice representado, si F no se pone el subtítulo pero convendría que añadirlo a posteriori |
ti |
por defecto en blanco (" "), pero pone el texto que se quiera poner como título |
idi |
Nombre científico de la especie ("l") o nombre común ("e") |
es |
Si T saca los titulos y rotulos en español, si F en inglés |
out.dat |
Si T el resultado final de la función es la figura en pantalla, pero los datos en objeto |
layout |
Organización de gráficos en filas ó columnas c(r,c) |
cex.pt |
Varía el tamaño de los puntos en los gráficos |
cexleg |
varía el tamaño del texto de la leyenda y los ejes |
years |
Si T saca los años como nombre de campaña en los paneles lattice de campañas |
graf |
si F no el gráfico va a pantalla, si nombre fichero va a fichero en el directorio en que está wdf |
xpng |
width archivo png si graf es el nombre del fichero |
ypng |
height archivo png si graf es el nombre del fichero |
ppng |
points png archivo si graf es el nombre del fichero |
Saca el mapa de diversidad en la campaña seleccionada.
Other mapas:
BelgicaMound
,
GrafMarksGPS_2()
,
GrafMarksGPS()
,
MapGaltal()
,
MapHidro.camp()
,
MapHidro_b.camp()
,
MapLansGPS()
,
MapLansHH()
,
MatchHidro.ctd()
,
NepFUs.camp()
,
NewPorcCanyon
,
PorShelfSAC
,
PorcNWSAC
,
PorcSWSAC
,
VedaCigala.out
,
VedaCigala
,
arMapLansGPS()
,
armap.camp()
,
armap.tot()
,
hmmSAC
,
map.check()
,
mapICESStatRec.plotrix()
,
mapICESStatRec()
,
maparea()
,
maphistage()
,
maphistal()
,
maphist()
Other ecologia:
ecolgr.camp()
MapEcol.camp(c(2:5),999,"N24","Cant",ind = "n",indec = "div",ti="Invertebrados")
dumbecol<-MapEcol.camp(1,999,Nsh[25:30],"Cant",ind="n",bw=TRUE,indec="simp",out.dat=TRUE,layout=c(2,3),ti=" ")
dumbecol<-MapEcol.camp(2:5,999,Nsh[25:30],"Cant",ind="n",ti="Invertebrados, sin peces",bw=TRUE,indec="simp",out.dat=TRUE,layout=c(2,3))
dumbecol$estrato<-cut(dumbecol$prof,c(0,70,120,200,500,900),c("A1","A","B","C","D"))
lattice::bwplot(numbesp~estrato|camp,dumbecol,horizontal=FALSE,main="Número de especies",xlab="Estrato")
lattice::bwplot(div~estrato|camp,dumbecol,horizontal=FALSE,main="Shannon Wiener",xlab="Estrato")
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