NepFU30.camp: Información anual sobre cigala para la FU 30 en el Golfo de...
In fvgls/CampR: Libreria de funciones en R para el programa CAMP

NepFU30.camp

R Documentation

Información anual sobre cigala para la FU 30 en el Golfo de Cádiz

Description

Función de acceso a datos: Extrae las características de los lances para una campaña determinada y las capturas de cigala por unidad funcional

Usage

NepFU30.camp(
  camp = camp,
  dns = "Arsa",
  trimes = 4,
  plot = TRUE,
  es = FALSE,
  ti = TRUE,
  ICESlab = FALSE,
  ceros = T,
  leg = T,
  escmult = 0.25,
  cexleg = 1,
  ICESrectcol = 1,
  ICESrect = TRUE,
  places = TRUE,
  FU = "FU30",
  ColFU = "white",
  dens = 20,
  out.dat = TRUE,
  bw = FALSE
)

Arguments

`camp`	Campaña de la que se extraen los datos: año concreto (XX): Arsa "1XX"
`dns`	Sólo disponible para el Golfo de Cádiz "Cant" combinados con "dnsred" busca los datos en el servidor de Santander si se han creado las odbcs
`plot`	Saca el gráfico (T) o lo omite para dejar sólo los datos (F)
`es`	si T letreros en español, si F en inglés (F por defecto)
`ICESlab`	Si T incluye las etiquetas de los rectángulos ICES
`ICESrect`	Si T saca los rectangulos ices de 1 grado de latitud por medio de longitud
`places`	Si T saca etiquetas de principales ciudades en el mapa, si F se omiten los letreros
`FU`	pinta los límites de la FU30 en color rojo
`ColFU`	color de relleno de la FU, blanco por defecto, con dens=0 se omite el relleno.
`dens`	valores de 20 hace que el color permita ver el fondo con los ICES rects y la batimetría, más lo deja en color sólido, 0 quita el relleno del todo.
`out.dat`	Si T el resultado final de la función es la figura en pantalla, pero los datos de abundancia de cigala en cada FU con datos de biomasa, numero, desviaciones estándar y número de lances en cada FU.
`year`	si T incluye una columna con el año al final de los datos
`plotnep`	si T presenta todos los lances en los que ha habido cigala en la campaña, además de los lances en cada FU, con o sín captura. Si F sólo saca los lances en cada FU sin marcar si ha habido cigala o no.
`icesrectcol`	Color para los rectángulos ICES
`ICESlabcex`	tamaño del ICESlab en cex, .5 por defecto subirlo si se quiere más grande

Details

Un problema que ocurre al utilizar el CampR con ficheros dbf de las primeras campañas puede ser que al fichero lanceXXX.dbf le falte algún campo, habitualmente el campo ESTN utilizado en las últimas versiones del CAMP para ligar lances con las estaciones de CTD. El error usual es $ operator is invalid for atomic vectors Si se detecta este error revisar la estructura de lanceXXX.dbf con la de otros ficheros de lances de los últimos años