grafhistbox: Evolución en biomasa o abundancia de la especie en la serie...

In fvgls/CampR: Libreria de funciones en R para el programa CAMP

Evolución en biomasa o abundancia de la especie en la serie histórica

Description

Gráfico de cajas con la evolución en biomasa o abundancia en la serie histórica

Usage

grafhistbox(
  gr,
  esp,
  camps,
  dns = "Porc",
  ind = "p",
  cor.time = TRUE,
  kg = TRUE,
  ci.lev = 0.8,
  DLS = F,
  DLSrat = c(2, 5),
  idi = "l",
  SE = TRUE,
  es = TRUE,
  excl.sect = NA,
  sector = NA,
  ti = TRUE,
  Nas = FALSE,
  ymax = NA,
  mar = NA,
  tline = FALSE,
  years = TRUE,
  sub = FALSE,
  cex.leg = 1.1,
  graf = FALSE,
  xpng = 1200,
  ypng = 800,
  ppng = 15
)

Arguments

gr	Grupo de la especie: 1 peces, 2 crustáceos 3 moluscos 4 equinodermos 5 invertebrados 6 para deshechos y otros. 9 incluye todos los grupos a excepción del 6
esp	Codigo de la especie numérico o carácter con tres espacios. 999 para todas las especies del grupo
camps	campañas de la serie de datos a representar en el gráfico de abundancias Demersales Nsh, Porcupine Psh, Arsa primavera As1 y Arsa otoño As2
dns	Elige el origen de las bases de datos: Porcupine "Pnew" o "Porc", Cantábrico "Cant" o "Cnew", Golfo de Cádiz "Arsa" y Mediterráneo "Medi" P
ind	Parámetro a representar saca los datos en "p"eso o "n"úmero
cor.time	Si T corrige las abundancias en función de la duración del lance
kg	Si T el gráfico está en kgs, si F en gramos
ci.lev	El intervalo de confianza a representar
DLS	si T muestra las medias de los dos últimos años y de los cinco precedentes
DLSrat	ratio Elige el numero de años para el enfoque DLS 3/2 short life, 5/2 long life, vector con dos números, intervalo reciente intervalo histórico
idi	Nombre científico de la especie ("l") o nombre común ("e")
SE	Si T dibuja las cajas representando el error estándar, si F no aparecen la cajas
es	Si T ejes y unidades en español, si F en inglés
excl.sect	Sectores a excluir como carácter, se pueden elegir tanto los sectores como estratos
sector	Alternativa a excl.sect para un sólo sector. Si especificado como carácter solo toma el sector elegido
ti	Si T muestra el título con el nombre de la especie (y el sector si se elige sect o excl.sect si falso no muestra nada. También se puede dar un valor y aparece el texto incluido o dar un list(label=(título), font, cex)
Nas	Si F no representa las cajas en los sectores/estratos en los que algún sector o estrato tiene un sólo lance. Si T utiliza el valor del estrato y evita los NAs
ymax	Valor máximo del eje y
mar	Sirve para definir los margenes de la figura alrededor del gráfico mismo. Por defecto es NA y deja los definicos por defecto por R. Si se definen tiene que ser un vector con cuatro valores numéricos en líneas: c(bottom,left,upper,right)
tline	Si T dibuja una línea de tendencia a traves de un glm con los datos de abundancia. gráficos evaluación MSFD.
years	Si T saca los años como nombre de campaña en el eje de las equis en vez de de campañas
sub	Añade un subtítulo con el valor que se le ponga si no F
cex.leg	Sirve para modificar los tamaños de letra del gráfico, funciona con ejes y títulos. Por defecto en 1.1
graf	si F no el gráfico va a pantalla, si nombre fichero va a fichero en el directorio en que está wdf
xpng	width archivo png si graf es el nombre del fichero
ypng	height archivo png si graf es el nombre del fichero
ppng	points png archivo si graf es el nombre del fichero
las	Sirve para modificar la dirección de las etiquetas en el eje de las equis, por defecto F pero se cambia cuando se elige years=T, si no se cambia salen paralelas

Value

Crea una gráfica de evolución de las abundancias en biomasa o número y devuelve en consola un data.frame con columnas: avg,SE (error estándar),camp

See Also

grafhistbox.comp

Other abunds: grafhistbox.comp(), grafhisttalbox(), histboxplot.comp(), histboxplot()

Examples

grafhistbox(1,45,Nsh[7:27],"Cant",es=FALSE,years=TRUE,tline=TRUE,DLS=FALSE,ti=TRUE,sub=TRUE)
grafhistbox(1,45,Nsh[1:31],"Cant",es=FALSE,years=TRUE,tline=FALSE,DLS=TRUE,ti=TRUE,sub=TRUE)
grafhistbox(1,79,Nsh[1:38],"Cant",years=T,ci.lev = 0,DLS=T,es=F,SE=F,excl.sect = 1,sub="8c division")

fvgls/CampR documentation built on April 14, 2025, 1:13 a.m.