grafhistbox: Evolución en biomasa o abundancia de la especie en la serie...

Description Usage Arguments Value See Also Examples

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Description

Gráfico de cajas con la evolución en biomasa o abundancia en la serie histórica

Usage

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grafhistbox(gr, esp, camps, dns = "Porc", ind = "p", cor.time = TRUE,
  kg = TRUE, ci.lev = 0.8, DLS = F, DLSrat = c(2, 5), idi = "l",
  SE = TRUE, es = TRUE, excl.sect = NA, sector = NA, ti = TRUE,
  Nas = FALSE, ymax = NA, mar = NA, tline = FALSE, years = TRUE,
  sub = FALSE, cex.leg = 1.1)

Arguments

gr

Grupo de la especie: 1 peces, 2 crustáceos 3 moluscos 4 equinodermos 5 invertebrados 6 para deshechos y otros. 9 incluye todos los grupos a excepción del 6

esp

Codigo de la especie numérico o carácter con tres espacios. 999 para todas las especies del grupo

camps

campañas de la serie de datos a representar en el gráfico de abundancias Demersales Nsh, Porcupine Psh, Arsa primavera As1 y Arsa otoño As2

dns

Elige el origen de las bases de datos: Porcupine "Pnew" o "Porc", Cantábrico "Cant" o "Cnew", Golfo de Cádiz "Arsa" y Mediterráneo "Medi" P

ind

Parámetro a representar saca los datos en "p"eso o "n"úmero

cor.time

Si T corrige las abundancias en función de la duración del lance

kg

Si T el gráfico está en kgs, si F en gramos

ci.lev

El intervalo de confianza a representar

DLS

si T muestra las medias de los dos últimos años y de los cinco precedentes

DLSrat

ratio Elige el numero de años para el enfoque DLS 3/2 short life, 5/2 long life, vector con dos números, intervalo reciente intervalo histórico

idi

Nombre científico de la especie ("l") o nombre común ("e")

SE

Si T dibuja las cajas representando el error estándar, si F no aparecen la cajas

es

Si T ejes y unidades en español, si F en inglés

excl.sect

Sectores a excluir como carácter, se pueden elegir tanto los sectores como estratos

sector

Alternativa a excl.sect para un sólo sector. Si especificado como carácter solo toma el sector elegido

ti

Si T muestra el título con el nombre de la especie (y el sector si se elige sect o excl.sect si falso no muestra nada. También se puede dar un valor y aparece el texto incluido o dar un list(label=(título), font, cex)

Nas

Si F no representa las cajas en los sectores/estratos en los que algún sector o estrato tiene un sólo lance. Si T utiliza el valor del estrato y evita los NAs

ymax

Valor máximo del eje y

mar

Sirve para definir los margenes de la figura alrededor del gráfico mismo. Por defecto es NA y deja los definicos por defecto por R. Si se definen tiene que ser un vector con cuatro valores numéricos en líneas: c(bottom,left,upper,right)

tline

Si T dibuja una línea de tendencia a traves de un glm con los datos de abundancia. gráficos evaluación MSFD.

years

Si T saca los años como nombre de campaña en el eje de las equis en vez de de campañas

sub

Añade un subtítulo con el valor que se le ponga si no F

cex.leg

Sirve para modificar los tamaños de letra del gráfico, funciona con ejes y títulos. Por defecto en 1.1

las

Sirve para modificar la dirección de las etiquetas en el eje de las equis, por defecto F pero se cambia cuando se elige years=T, si no se cambia salen paralelas

Value

Crea una gráfica de evolución de las abundancias en biomasa o número y devuelve en consola un data.frame con columnas: avg,SE (error estándar),camp

See Also

grafhistbox.comp

Examples

1
2
grafhistbox(1,45,Nsh[7:27],"Cant",es=FALSE,years=TRUE,tline=TRUE,DLS=FALSE,ti=TRUE,sub=TRUE)
grafhistbox(1,45,Nsh[1:31],"Cant",es=FALSE,years=TRUE,tline=FALSE,DLS=TRUE,ti=TRUE,sub=TRUE)

fvgls/CampR documentation built on Dec. 14, 2018, 6:20 p.m.