histboxplot: Gráficos de boxplot para la serie histórica incluyendo lances...

In fvgls/CampR: Libreria de funciones en R para el programa CAMP

Gráficos de boxplot para la serie histórica incluyendo lances especiales o no y con rangos de profundidad

Description

Crea box plots con la distribución de la abundancia, en biomasa o número, no teniendo en cuenta la ponderación al área (see details) para distintas zonas: Porcupine (dns="Porc"), el Cantábrico (dns=Cant), Cádiz= (dns=Arsa), y el Mediterráneo (dns=Medi).

Usage

histboxplot(
  gr,
  esp,
  camps,
  dns = "Porc",
  cor.time = TRUE,
  incl2 = TRUE,
  es = T,
  bw = TRUE,
  ti = TRUE,
  sub = NULL,
  out.dat = FALSE,
  ind = "p",
  idi = "l",
  ceros = TRUE,
  cex.leg = 1.1,
  years = TRUE,
  profrange = NA,
  proflab = F,
  nlans = TRUE,
  lan.cex = 0.6
)

Arguments

gr	Grupo de la especie: 1 peces, 2 crustáceos 3 moluscos 4 equinodermos 5 invertebrados 6 desechos y otros, 9 escoge todos los orgánicos pero excluye desechos
esp	Código de la especie numérico o carácter con tres espacios. 999 para todas las especies del grupo
camps	Campaña a representar en el mapa de un año concreto (XX): Demersales "NXX", Porcupine "PXX", Arsa primavera "1XX" y Arsa otoño "2XX"
dns	Elige el origen de las bases de datos: Porcupine "Porc" o "Pnew", Cantábrico "Cant", Golfo de Cadiz "Arsa" (proporciona los datos para Medits pero no saca mapas)
cor.time	Si T corrige las abundancias en función de la duración del lance
incl2	Si F no tiene en cuenta los lances especiales, si T si los tiene en cuenta, pero da problemas por que no puede calcular las abundancias estratificadas
es	Si T rotulos gráfico en español, si F en inglés
bw	Gráfico en blanco en negro si T o en color si F
ti	Añade el nombre de la especie en latín sin T, si F no añade titulo
sub	Añade un subtítulo debajo del gráfico, sin texto por defecto.
out.dat	Si T el resultado final de la función es la figura en pantalla, pero los datos en objeto
ind	Parámetro a representar saca los datos en "p"eso o "n"úmero
idi	Nombre científico de la especie ("l") o nombre común ("e")
ceros	por defecto incluye los valores de 0 al calcular los rangos y medianas, si T los quita, Es importante avisarlo en el la explicación de la gráfica
cex.leg	Varía el tamaño de letra de los ejes y del número de la leyenda
years	Si T saca los años como nombre de campaña en los paneles lattice de campañas
profrange	Si c(profmin,profmax) filtra por ese rango de profundidad por defecto NA no filtra profundidades
nlans	T por defecto presenta el número de lances en la campaña por encima del eje x
lan.cex	tamaño de las etiquetas del numero de lances por campaña
plot	Saca el gráfico (T) o lo guarda como objeto para componer con otros gráficos (F)
escmult	Varía la relación de tamaño de los puntos con la leyenda y el máximo en los datos

Details

Estos boxplots pueden ser engañosos y hay que explicar bien en la gráfica sus resultados. Sí se decide eliminar los ceros (=F) hay que tener cuidado porque los resultados pueden depender mucho del número de lances sin captura y dar resultados muy engañosos al poder compararse datos con distinto numero de lances. Ver en examples ambas opciones

Value

Si out.dat=TRUE devuelve un data.frame con columnas: lan,lat,long,prof,peso.gr,numero (de individuos entre tmin y tmax),camp, si out.dat=F saca el gráfico en pantalla o como objeto para combinar con otros gráficos con print.trellis

See Also

Other abunds: grafhistbox.comp(), grafhistbox(), grafhisttalbox(), histboxplot.comp()

Examples

histboxplot(1,50,Nsh[7:27],"Cant",years=TRUE)
histboxplot(1,50,Nsh[7:27],"Cant",years=TRUE,ind="n")
histboxplot(1,50,Nsh[7:27],"Cant",years=TRUE,ind="n",ceros=FALSE)

fvgls/CampR documentation built on April 5, 2024, 2:56 p.m.