maphistal: Mapa distribución entre tallas tmin y tmax

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maphistalR Documentation

Mapa distribución entre tallas tmin y tmax

Description

Saca mapas de distribución de una especie entre tallas tmin y tmax para varias campañas

Usage

maphistal(
  gr,
  esp,
  camps,
  dns = "Porc",
  tmin = 0,
  tmax = 999,
  cor.time = TRUE,
  incl2 = TRUE,
  ind = "n",
  ICESrect = FALSE,
  sex = NA,
  bw = FALSE,
  ti = TRUE,
  subti = TRUE,
  plot = TRUE,
  out.dat = FALSE,
  idi = "l",
  layout = NA,
  leg = TRUE,
  ceros = TRUE,
  escmult = 0.25,
  cexleg = 1,
  years = TRUE,
  graf = FALSE,
  xpng = 1200,
  ypng = 800,
  ppng = 15
)

Arguments

gr

Grupo de la especie: 1 peces, 2 crustaceos 3 moluscos 4 equinodermos 5 invertebrados. 6 Desechos y otros inorgánicos no tiene sentido sacar tallas, sólo recogidas en peces, crustáceos decápodos y algunos moluscos

esp

Código de la especie numerico o caracter con tres espacios. 999 para todas las especies del grupo

camps

Campaña a representar en el mapa de un año comcreto (XX): Demersales "NXX", Porcupine "PXX", Arsa primavera "1XX" y Arsa otoño "2XX"

dns

Elige el origen de las bases de datos: Porcupine "Porc", Cantábrico "Cant", Golfo de Cádiz "Arsa" (únicamente para sacar datos al IBTS, no gráficos)

tmin

Talla mínima del intervalo de tallas a incluir, si 0 el subtítulo sale =< tmax

tmax

Talla máxima del intervalo de tallas a incluir, si 999 el subtítulo sale >= tmin

cor.time

Si T corrige las abundancias en función de la duración del lance

incl2

Si F no presenta los lances especiales, si T si los tiene en cuenta, pero puede dar problemas por que no puede calcular las abundancias estratificadas

ind

Permite elegir entre número "n" o peso "p" peso sólo funciona cuando existen a y b en especies.dbf y se elige sólo una especie

ICESrect

Si T saca los rectangulos ices de 1 grado de latitud por medio de longitud

sex

Permite elegir entre machos(1), hembras(2) o indeterminados(3), NA escoge sin tener en cuenta el sexo

bw

gráfico en blanco en negro si T o en color si F

ti

Si T añade titulo al mapa, el nombre de la especie en latín. También se puede poner como list con parámetros main: el título, font y demás.

subti

ti T añade un subtítulo bajo la gráfica con el rango de tallas seleccionado.

plot

Saca el gráfico (T) o si se salva como objeto se puede componer para componer con otros gráficos de lattice (F)

out.dat

Si T el resultado final de la funcion es la figura en pantalla, pero los datos en objeto

idi

Nombre científico de la especie ("l") o nombre común ("e")

layout

Organización de gráficos en filas ó columnas c(r,c)

leg

Si T añade la leyenda

ceros

Añade puntos para los datos igual a 0 si T, si F no incluye x en los valores 0

escmult

Varía la relación de tamaño de los puntos con la leyenda y el máximo en los datos

cexleg

Varía el tamaño de letra de los ejes y del número de la leyenda

years

Si T saca los años como nombre de campaña en los paneles lattice de campañas

graf

Si F no saca nada, si pones el nombre de un gráfico lo saca saca como archivo png y al final del proceso dice dónde está el mapa con ese nombre:

xpng

width archivo png si graf es el nombre del fichero

ypng

height archivo png si graf es el nombre del fichero

ppng

points png archivo si graf es el nombre del fichero

Value

Si out.dat=TRUE devuelve un data.frame con columnas: lan,lat,long,prof,numero (de individuos entre tmin y tmax),camp, si out.dat=F saca el gráfico en pantalla o como objeto para combinar con otros gráficos con print.trellis

See Also

Other mapas: BelgicaMound, GrafMarksGPS_2(), GrafMarksGPS(), MapEcol.camp(), MapGaltal(), MapHidro.camp(), MapHidro_b.camp(), MapLansGPS(), MapLansHH(), MatchHidro.ctd(), NepFUs.camp(), NewPorcCanyon, PorShelfSAC, PorcNWSAC, PorcSWSAC, VedaCigala.out, VedaCigala, arMapLansGPS(), armap.camp(), armap.tot(), hmmSAC, map.check(), mapICESStatRec.plotrix(), mapICESStatRec(), maparea(), maphistage(), maphist()

Other tallas: MapGaltal()

Examples

maphistal(1,50,Psh[1:12],"Porc",1,23,layout=c(4,3),out.dat=TRUE)

fvgls/CampR documentation built on April 14, 2025, 1:13 a.m.