maphistal | R Documentation |
Saca mapas de distribución de una especie entre tallas tmin y tmax para varias campañas
maphistal(
gr,
esp,
camps,
dns = "Porc",
tmin = 0,
tmax = 999,
cor.time = TRUE,
incl2 = TRUE,
ind = "n",
ICESrect = FALSE,
sex = NA,
bw = FALSE,
ti = TRUE,
subti = TRUE,
plot = TRUE,
out.dat = FALSE,
idi = "l",
layout = NA,
leg = TRUE,
ceros = TRUE,
escmult = 0.25,
cexleg = 1,
years = TRUE,
graf = FALSE,
xpng = 1200,
ypng = 800,
ppng = 15
)
gr |
Grupo de la especie: 1 peces, 2 crustaceos 3 moluscos 4 equinodermos 5 invertebrados. 6 Desechos y otros inorgánicos no tiene sentido sacar tallas, sólo recogidas en peces, crustáceos decápodos y algunos moluscos |
esp |
Código de la especie numerico o caracter con tres espacios. 999 para todas las especies del grupo |
camps |
Campaña a representar en el mapa de un año comcreto (XX): Demersales "NXX", Porcupine "PXX", Arsa primavera "1XX" y Arsa otoño "2XX" |
dns |
Elige el origen de las bases de datos: Porcupine "Porc", Cantábrico "Cant", Golfo de Cádiz "Arsa" (únicamente para sacar datos al IBTS, no gráficos) |
tmin |
Talla mínima del intervalo de tallas a incluir, si 0 el subtítulo sale =< tmax |
tmax |
Talla máxima del intervalo de tallas a incluir, si 999 el subtítulo sale >= tmin |
cor.time |
Si T corrige las abundancias en función de la duración del lance |
incl2 |
Si F no presenta los lances especiales, si T si los tiene en cuenta, pero puede dar problemas por que no puede calcular las abundancias estratificadas |
ind |
Permite elegir entre número "n" o peso "p" peso sólo funciona cuando existen a y b en especies.dbf y se elige sólo una especie |
ICESrect |
Si T saca los rectangulos ices de 1 grado de latitud por medio de longitud |
sex |
Permite elegir entre machos(1), hembras(2) o indeterminados(3), NA escoge sin tener en cuenta el sexo |
bw |
gráfico en blanco en negro si T o en color si F |
ti |
Si T añade titulo al mapa, el nombre de la especie en latín. También se puede poner como list con parámetros main: el título, font y demás. |
subti |
ti T añade un subtítulo bajo la gráfica con el rango de tallas seleccionado. |
plot |
Saca el gráfico (T) o si se salva como objeto se puede componer para componer con otros gráficos de lattice (F) |
out.dat |
Si T el resultado final de la funcion es la figura en pantalla, pero los datos en objeto |
idi |
Nombre científico de la especie ("l") o nombre común ("e") |
layout |
Organización de gráficos en filas ó columnas c(r,c) |
leg |
Si T añade la leyenda |
ceros |
Añade puntos para los datos igual a 0 si T, si F no incluye x en los valores 0 |
escmult |
Varía la relación de tamaño de los puntos con la leyenda y el máximo en los datos |
cexleg |
Varía el tamaño de letra de los ejes y del número de la leyenda |
years |
Si T saca los años como nombre de campaña en los paneles lattice de campañas |
graf |
Si F no saca nada, si pones el nombre de un gráfico lo saca saca como archivo png y al final del proceso dice dónde está el mapa con ese nombre: |
xpng |
width archivo png si graf es el nombre del fichero |
ypng |
height archivo png si graf es el nombre del fichero |
ppng |
points png archivo si graf es el nombre del fichero |
Si out.dat=TRUE devuelve un data.frame con columnas: lan,lat,long,prof,numero (de individuos entre tmin y tmax),camp, si out.dat=F saca el gráfico en pantalla o como objeto para combinar con otros gráficos con print.trellis
Other mapas:
BelgicaMound
,
GrafMarksGPS_2()
,
GrafMarksGPS()
,
MapEcol.camp()
,
MapGaltal()
,
MapHidro.camp()
,
MapHidro_b.camp()
,
MapLansGPS()
,
MapLansHH()
,
MatchHidro.ctd()
,
NepFUs.camp()
,
NewPorcCanyon
,
PorShelfSAC
,
PorcNWSAC
,
PorcSWSAC
,
VedaCigala.out
,
VedaCigala
,
arMapLansGPS()
,
armap.camp()
,
armap.tot()
,
hmmSAC
,
map.check()
,
mapICESStatRec.plotrix()
,
mapICESStatRec()
,
maparea()
,
maphistage()
,
maphist()
Other tallas:
MapGaltal()
maphistal(1,50,Psh[1:12],"Porc",1,23,layout=c(4,3),out.dat=TRUE)
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