Files in keita-iida/ASURATBI
A pipeline especially built for computing several single-cell datasets
.Rbuildignore
.gitignore
DESCRIPTION
LICENSE
NAMESPACE
NEWS
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R/Spaniel/DESCRIPTION
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R/Spaniel/R/shinySpaniel.R
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R/Spaniel/R/tenX.R
R/Spaniel/R/utilities.R
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R/Spaniel/inst/HE_Rep1_resized.jpg
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R/Spaniel/inst/extdata/image.rds
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R/Spaniel/inst/spot_positions.tsv
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R/Spaniel/man/parseImage.Rd
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R/Spaniel/man/runShinySpaniel.Rd
R/Spaniel/man/selectSpots.Rd
R/Spaniel/man/spanielPlot.Rd
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R/Spaniel/vignettes/spaniel-vignette-tenX-import.Rmd
R/Spaniel/vignettes/spaniel-vignette-tenX-import.html
R/create_signs.R
R/data.R
R/find_marker_signs.R
R/plot.R
R/plot_additional.R
R/preprocess.R
R/zzz.R
README.md
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data/human_GO_eg.RData
data/human_KEGG_eg.RData
data/pbmc_eg.RData
data/pbmcs_eg.RData
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docs/07-misc.html
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man/human_GO_eg.Rd
man/human_KEGG_eg.Rd
man/makeSignMatrix.Rd
man/pbmc_eg.Rd
man/pbmcs_eg.Rd
man/plot_dataframe3D.Rd
man/plot_elasticTree3D.Rd
man/plot_multiheatmaps.Rd
man/plot_pseudotime3D.Rd
man/plot_pseudotimecourse_wTree.Rd
man/plot_pseudotimecourse_woTree.Rd
man/remove_samples.Rd
man/remove_signs.Rd
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man/remove_variables.Rd
man/remove_variables_second.Rd
man/select_signs_manually.Rd
man/swap_pass.Rd
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src/bubble_sort.cpp
vignettes/01-sclc.Rmd
vignettes/01-sclc.md
vignettes/02-pbmc4k.Rmd
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vignettes/03-pbmc6k.Rmd
vignettes/03-pbmc6k.md
vignettes/04-pbmc130k.Rmd
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vignettes/05-pdac.Rmd
vignettes/05-pdac.md
vignettes/06-pbmcs.Rmd
vignettes/06-pbmcs.md
vignettes/07-misc.Rmd
vignettes/07-misc.md
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