violinplot_emmeans: Violinplot con pvalues obtenidos con emmeans

In mariosandovalmx/tlamatini: Tlamatini: Funciones utiles para biologxs y ecologxs confundidos con los modelos lineales

Violinplot con pvalues obtenidos con emmeans

Description

Violinplot con los valores de p obtenidos con emmeans de un LM, LMM, GLM, GLMM, etc. Gráficos generados con paqueteria "ggplot", por ahora solo permite una variable explicativa sin interacciones. Proporciona informacion sobre la distribución de cada grupo, así como la media y los quantiles.

Usage

violinplot_emmeans(formula, modelo, data, p.adjust.method = NULL)

Arguments

formula	Formula de los contrastes que nos interesan obtener.
modelo	Modelo LM, GLM, GLMM, etc.
data	Base de datos con que se ajusto el modelo.
p.adjust.method	método para ajustar los valores p para comparaciones múltiples. Se utiliza cuando se realizan comparaciones por pares. Los valores permitidos incluyen "holm", "hochberg", "hommel", "bonferroni", "BH", "BY", "fdr", "none". Si no desea ajustar el valor p (no recomendado), utilice p.adjust.method = "none".

Value

Violinplot de los contrastes posthoc en el modelo todas las variables explicativas del modelo.

Examples

library(tlamatini)
data(iris)
iris$Species <- as.factor(iris$Species)
mod <- glm(Petal.Width ~ Species, family = gaussian("log"), data=iris)
violinplot_emmeans(formula = Petal.Width ~ Species, modelo=mod, data= iris)

mariosandovalmx/tlamatini documentation built on Nov. 20, 2024, 12:28 a.m.