prepLearnSets: A prepLearnSets Function

Description Usage Arguments Value Author(s) References See Also Examples

View source: R/prepLearnSets.R

Description

Genera datos de entrenamiento a partir de una base de datos mediante diferentes técnicas de cross-validation

Usage

1
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prepLearnSets(Y.tr, learnSetNames, compName, resultsDir, fold = 5,
  niter = 100, saveLearnSet = T)

Arguments

Y.tr

vector de datos de clase "factor" donde se indican las condiciones experimentales (a comparar) de cada individuo

learnSetNames

método a utilizar para la generación de "learningsSets". Los diferentes métodos (LOOCV, CV, MCCV, bootstrap) se explican en GenerateLearningsets

compName

nombre de la comparación, se usara como identificador y para el nombre de archivos resultantes

resultsDir

carpeta donde se guardaran los resultados. p.e. "results/". Solo necesario cuando saveLearnSet = TRUE

fold

Gives the number of CV-groups. Used only when method="CV"

niter

Number of iterations.

saveLearnSet

valor logico que indica si se guardan los resultados en disco

Value

learningSets datos resultantes, "datos de entrenamiento". Objeto con clase "learningsets".

learningSetsFileName nombre del archivo guardado con los "datos de entrenamiento"

Author(s)

Miriam Mota [email protected]

References

M Slawski, M Daumer and A-L Boulesteix, CMA – a comprehensive Bioconductor package for supervised classification with high dimensional data

See Also

Text with GenerateLearningsets

Examples

1
2
y <- factor(c(rep("A",10),rep("B",10)))
lSet <- prepLearnSets(Y.tr = y , learnSetNames = "LOOCV", compName = "AvsB", saveLearnSet = FALSE) 

miriamMota/biom documentation built on April 13, 2018, 7:32 p.m.