Data/cc.genes.R

In natsuhiko/GASPACHO: GAuSsian Processes for Association mapping leveraging Cell HeterOgeneity

cc.genes <-
list(s.genes = c("MCM5", "PCNA", "TYMS", "FEN1", "MCM2", "MCM4", 
"RRM1", "UNG", "GINS2", "MCM6", "CDCA7", "DTL", "PRIM1", "UHRF1", 
"MLF1IP", "HELLS", "RFC2", "RPA2", "NASP", "RAD51AP1", "GMNN", 
"WDR76", "SLBP", "CCNE2", "UBR7", "POLD3", "MSH2", "ATAD2", "RAD51", 
"RRM2", "CDC45", "CDC6", "EXO1", "TIPIN", "DSCC1", "BLM", "CASP8AP2", 
"USP1", "CLSPN", "POLA1", "CHAF1B", "BRIP1", "E2F8"), g2m.genes = c("HMGB2", 
"CDK1", "NUSAP1", "UBE2C", "BIRC5", "TPX2", "TOP2A", "NDC80", 
"CKS2", "NUF2", "CKS1B", "MKI67", "TMPO", "CENPF", "TACC3", "FAM64A", 
"SMC4", "CCNB2", "CKAP2L", "CKAP2", "AURKB", "BUB1", "KIF11", 
"ANP32E", "TUBB4B", "GTSE1", "KIF20B", "HJURP", "CDCA3", "HN1", 
"CDC20", "TTK", "CDC25C", "KIF2C", "RANGAP1", "NCAPD2", "DLGAP5", 
"CDCA2", "CDCA8", "ECT2", "KIF23", "HMMR", "AURKA", "PSRC1", 
"ANLN", "LBR", "CKAP5", "CENPE", "CTCF", "NEK2", "G2E3", "GAS2L3", 
"CBX5", "CENPA"))