R/HOPS-internal.R

In rondolab/HOPS: The HOPS (HOrizontal Pleiotropy Score) package allows to compute the Horizontal pleiotropy score as described in Jordan et al.

.Random.seed <-
c(403L, 2L, 1335194966L, 1768157184L, 462098755L, 1353555169L, 
-1948944816L, -1188754770L, -858878375L, 336991851L, 1386027994L, 
-1468175204L, -1318721889L, -1588794123L, -559084148L, 293820514L, 
-2068121539L, 267190967L, -1429927586L, 1449201816L, 754637819L, 
1321355673L, -896943576L, -2081514794L, 1528467281L, 1292161539L, 
300524946L, -525589724L, -274008601L, -1909538243L, 1753611444L, 
-949798118L, 2111066213L, -156985089L, 970185094L, -454054128L, 
-1011139661L, -1633322927L, 1837542400L, -1002263330L, 1824227113L, 
-919592229L, 85072362L, 2035605900L, -57456945L, 776247941L, 
1567207740L, -78406638L, -972213491L, 1869922375L, 1497969198L, 
426965896L, 198350475L, -2113165207L, 1637332024L, -416434970L, 
2099379329L, -861463533L, 1568603074L, -1475591052L, 1442085495L, 
15246189L, -27593724L, -1864093910L, 974466197L, 705833775L, 
295811638L, 1852358240L, 653565091L, 2117924801L, 119686064L, 
865937102L, 1799631929L, 1564215883L, 509337594L, 1867922172L, 
-1372614849L, -458842091L, 1603334956L, 935499778L, 1046225629L, 
188434903L, 1871938750L, -2094268680L, -909710117L, -2053476551L, 
355289736L, -1070158282L, -155197839L, 141393059L, 686700018L, 
-1012861628L, 1684059655L, 982447069L, 1221745876L, 1340031994L, 
1946465093L, -598743137L, -1098011354L, -1347422800L, 741748307L, 
-1952667279L, 1074118816L, -2140434370L, 1684059977L, -623993349L, 
1813004746L, 1625091884L, -1502097617L, -450740763L, -1419935588L, 
-110844686L, -943694483L, 544811687L, -1609382706L, -1884067288L, 
1198701099L, 719261769L, 1919144280L, -62945274L, -2059732511L, 
986186611L, 1893554146L, -864616620L, -2002111913L, -396303795L, 
1989740004L, -2035818550L, 498295349L, -325457777L, -208856682L, 
-227695296L, 2139207683L, -28759519L, -1718145776L, -493952274L, 
-2082963815L, 171720491L, -602228198L, -856872740L, 446096607L, 
-1535122763L, -1986153396L, 1797228706L, 1993623549L, -451234569L, 
-1818664418L, -1622385448L, 1973264443L, -1662457383L, 1698205544L, 
1525760662L, 464423953L, 1612701123L, 1136484818L, -2070845340L, 
-1155250265L, 1784236285L, -922673932L, -1912636454L, 2003423013L, 
-1761864129L, -861708858L, 1461713488L, -1646954893L, 1207794321L, 
1510261440L, 1825105054L, 995543145L, 2100831387L, 1292574122L, 
1215221196L, -941793137L, -1050500923L, -1793437572L, -1402213166L, 
-1891335091L, 247371015L, -1978861330L, 1945885128L, -1881489717L, 
318484265L, -1163053192L, 1989381286L, 545185473L, 470390611L, 
1507873794L, -28872396L, -1391600969L, 215484077L, 1449920452L, 
40005610L, 1969533013L, -1520267793L, 1188369910L, -1588546784L, 
-1694307101L, -1755289215L, 1316282352L, -818512242L, -759348743L, 
407030667L, 145590202L, -1662630212L, -8069633L, 1343462229L, 
1880984684L, 287795394L, -1757529315L, 635220375L, 1731422462L, 
-78087496L, 1212925083L, 1231930105L, -1457159096L, -1509234826L, 
-581983567L, 98185955L, -1153224270L, -1574206972L, 2126313799L, 
435946525L, 1119107732L, 982757946L, -866272123L, 787079519L, 
422162918L, -828678032L, -1005739117L, -234430368L, 2121287548L, 
-267084848L, 1005686050L, 632940200L, -372094068L, 816438460L, 
525973298L, -254078400L, -1631254348L, 982215240L, -1371542086L, 
1893577232L, 44924652L, 130702676L, 1863787794L, 808950176L, 
359661260L, -695110048L, 853353410L, 1953022760L, -1665655892L, 
-62857412L, 863874418L, -1160388816L, -845142748L, 1112312632L, 
-1616920870L, -1697451120L, -1626653956L, -241904748L, -1640218558L, 
-1090567936L, -977931204L, 2107356496L, -1170599774L, -530547384L, 
-1154286836L, -1399967012L, -795262638L, -702480256L, 441351252L, 
1907862504L, 671204602L, -1380376752L, -520048852L, 1585294708L, 
1496747922L, -1598210976L, 1741784460L, -1500759200L, -408017438L, 
-472751192L, -710414132L, -428737540L, -1767386702L, -1363108368L, 
-62001212L, -184377000L, 146834810L, 528412592L, -83814980L, 
-1509813164L, 375007170L, -1276221408L, 345991356L, -1698687408L, 
1684516834L, -1998018456L, 13951052L, -1511648004L, 809318386L, 
-796214016L, 1416140148L, 2021869576L, -65670214L, -1341086256L, 
1924206572L, -211735148L, 576772562L, -499343008L, -487646388L, 
549734688L, -1781520510L, -1781709080L, -847056660L, 783050812L, 
1088507762L, -1688297872L, -376447964L, -346683592L, 1294898330L, 
-970808624L, 1399621820L, -979478892L, -1665024382L, 572901568L, 
-1367875780L, -1410223984L, -1798867422L, -1087276024L, -146531060L, 
-1793483620L, -1741835758L, -60963968L, 1112307220L, 565573160L, 
-567616198L, 1748194768L, -2048921492L, 656680244L, 287883922L, 
915199840L, -1964224692L, -1727983648L, 721849250L, -1887655000L, 
-1698735732L, 761758908L, 275755378L, -142511888L, -1590263740L, 
1401621848L, -1895390662L, -787538064L, -614962116L, -1318630636L, 
-1007790654L, 1045026528L, -74779780L, -447474992L, -769272670L, 
1512630312L, -1992079092L, 1805636540L, 1424426290L, 344703424L, 
-1097764300L, -628832312L, -470948678L, 1356437904L, 357163500L, 
-1744454060L, -1372853102L, 1525955360L, -1491967540L, -986579488L, 
-1158189374L, -737759192L, 1382735532L, -1520226116L, 113284594L, 
-451044048L, -1787771740L, 1444012728L, 1855781210L, 1576145296L, 
-1257533572L, -279238380L, -1611911358L, 466456320L, 1242473404L, 
112999248L, 1739050786L, -1164122808L, 723043852L, -677289892L, 
2001565906L, -1510984192L, 839072084L, 1254442472L, -1074240518L, 
218459344L, -233096916L, 1736144628L, 884700562L, 1890918496L, 
206959884L, 357679840L, 471049570L, 1627687592L, 1663251020L, 
-296571524L, 1974952242L, -1775772560L, -1137065148L, 1425144280L, 
1876081786L, -628146640L, 1323164348L, -1869903020L, -1241431998L, 
-103294560L, -636320068L, 72582608L, -1466864286L, -1587601432L, 
-657158196L, 1401453308L, 226450930L, -1463053184L, -1556668172L, 
1168433800L, 1451000634L, -1967780016L, 370274924L, 695482516L, 
587673938L, -634468640L, -312308020L, -783232864L, 982706050L, 
1302230760L, -479797524L, 1417142332L, 537431666L, 1538186352L, 
-39316956L, -579321800L, 1652381722L, -805927216L, 874040380L, 
1819620500L, 882350210L, -1653223488L, -721516228L, 1690680976L, 
-939717517L, -692783724L, -1901687774L, -180401353L, 822480385L, 
1979457286L, 1320907588L, -1852864907L, -1686104097L, 453389112L, 
1113120022L, 234930467L, 811829989L, -1584872702L, 1799014768L, 
-28319463L, 1124548875L, -575774212L, -202671574L, -1435497889L, 
667834857L, 146150142L, -2095277332L, -1739953603L, -1751102969L, 
542891504L, 1271418254L, 582439867L, -1430336099L, 1172493130L, 
-1745049752L, 61245777L, -1380439485L, 1734020932L, 158475250L, 
828864967L, -2065158255L, 570562326L, -1978408076L, 138385925L, 
-913601969L, -1943378360L, 2026080230L, -1789359853L, -1862068619L, 
1688022098L, 1959175840L, -1022884983L, -252436549L, -1679302644L, 
-1089860198L, 110636303L, -770378919L, 249564654L, -2012927876L, 
2053487853L, -1863058537L, 1954964576L, -1412053442L, -1679044853L, 
843576717L, 356892346L, -415773448L, -2087081311L, -1116607917L, 
-598108812L, -1812628734L, -20403305L, -1362461343L, -1167893082L, 
-2059870300L, -954086827L, -350020865L, -1056809064L, 1572909238L, 
651203907L, -1513466747L, -1538249438L, -1612220912L, -290941511L, 
-685201813L, 2006423900L, 1006170250L, 1382078591L, -780936759L, 
1297177182L, 26562828L, -1476148003L, -2108141081L, 1108511248L, 
-285645010L, -1052693541L, -1462522691L, -380293590L, -2027666744L, 
867170289L, 653654371L, 1772054884L, -877646702L, 1220002151L, 
-1104538831L, 1486510198L, -1621622380L, 1772692901L, -2114347345L, 
-1983002776L, 1876618054L, 1472547571L, 85959765L, 974219314L, 
1645913600L, -1429420311L, 1204901211L, 1516091308L, -1555522630L, 
-809474705L, -1738117383L, 1651636110L, 1467150940L, -662794035L, 
-1195728841L, 1970895552L, 414432670L, 1479249515L, -2001795603L, 
1132237914L, -913939688L, 2038909057L, 116174387L, 519386196L, 
-1846661022L, 1152366327L, 953600321L, 517468102L, 1571656964L, 
-142717771L, 493710239L, 1764066296L, -945463850L, 1480369251L, 
2036699173L, -846747710L, -439731024L, 1016477913L, 1610985035L, 
1936508092L, -1721156886L, 532888351L, -1386105943L, -1118948034L, 
-669598676L, -1541604739L, -50072377L, 164303280L, 76463054L, 
-1391466245L, 1252011869L, 1960479882L, -1999881560L, 1968424465L, 
153540355L, -487149052L, 1375156786L, -919901561L, -976613679L, 
-63301546L, -1178752972L, -974910651L, -1890797169L, 1439269887L
)