vignettes/ExtendingGenomicRanges.R

In vjcitn/GenomicRangesGHA: Representation and manipulation of genomic intervals; demo with github actions binary generation

### R code from vignette source 'ExtendingGenomicRanges.Rnw'

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### code chunk number 1: style
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BiocStyle::latex(use.unsrturl=FALSE)


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### code chunk number 2: options
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options(width=72)
options(showHeadLines=3)
options(showTailLines=3)


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### code chunk number 3: granges-ranges
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library(GenomicRangesGHA)
selectMethod(ranges, "GRanges")


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### code chunk number 4: delegating-granges-ranges
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selectMethod(ranges, "DelegatingGenomicRanges")


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### code chunk number 5: gnclist-granges
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getSlots("GNCList")["granges"]


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### code chunk number 6: vranges
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GenomicRangesGHA:::extraColumnSlotNames(VariantAnnotation:::VRanges())