inst/doc/gettingstartedMC.R

In doMC: Foreach Parallel Adaptor for 'parallel'

### R code from vignette source 'gettingstartedMC.Rnw'

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### code chunk number 1: loadLibs
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library(doMC)
registerDoMC(2)
foreach(i=1:3) %dopar% sqrt(i)


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### code chunk number 2: bootpar
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x <- iris[which(iris[,5] != "setosa"), c(1,5)]
trials <- 10000

ptime <- system.time({
  r <- foreach(icount(trials), .combine=cbind) %dopar% {
    ind <- sample(100, 100, replace=TRUE)
    result1 <- glm(x[ind,2]~x[ind,1], family=binomial(logit))
    coefficients(result1)
  }
})[3]
ptime


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### code chunk number 3: bootseq
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stime <- system.time({
  r <- foreach(icount(trials), .combine=cbind) %do% {
    ind <- sample(100, 100, replace=TRUE)
    result1 <- glm(x[ind,2]~x[ind,1], family=binomial(logit))
    coefficients(result1)
  }
})[3]
stime


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### code chunk number 4: getDoParWorkers
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getDoParWorkers()


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### code chunk number 5: getDoParName
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getDoParName()
getDoParVersion()


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### code chunk number 6: options
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mcoptions <- list(preschedule=FALSE, set.seed=FALSE)
foreach(i=1:3, .options.multicore=mcoptions) %dopar% sqrt(i)


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### code chunk number 7: coreoptions2
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registerDoMC(2)
options(cores=4)
getDoParWorkers()