gaucho: Genetic Algorithms for Understanding Clonal Heterogeneity and Ordering

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Use genetic algorithms to determine the relationship between clones in heterogenous populations such as cancer sequencing samples

Author
Alex Murison [aut, cre], Christopher Wardell [aut, cre]
Date of publication
None
Maintainer
Alex Murison <Alexander.Murison@icr.ac.uk>, Christopher Wardell <Christopher.Wardell@icr.ac.uk>
License
GPL-3
Version
1.10.0

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Man pages

BYB1_G07_pruned
BYB1_G07_pruned
gaucho
Genetic Algorithm for Understanding Clonal Heterogeneity and...
gaucho_hidden_data
gaucho_hidden_data
gauchoReport
View solutions contained within gaucho output
gaucho_simple_data
gaucho_simple_data
gaucho_synth_data
gaucho_synth_data
gaucho_synth_data_jittered
gaucho_synth_data_jittered

Files in this package

gaucho/DESCRIPTION
gaucho/NAMESPACE
gaucho/R
gaucho/R/BYB1_G07_pruned_manpage.R
gaucho/R/gaucho.R
gaucho/R/gauchoReport.R
gaucho/R/gaucho_hidden_data_manpage.R
gaucho/R/gaucho_simple_data_manpage.R
gaucho/R/gaucho_synth_data_jittered_manpage.R
gaucho/R/gaucho_synth_data_manpage.R
gaucho/R/generate_phylo_matrix.R
gaucho/R/new_phylo.R
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gaucho/inst
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gaucho/inst/extdata/gaucho_synth_data_jittered.R
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gaucho/man
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gaucho/man/gaucho_synth_data_jittered.Rd
gaucho/vignettes
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