marray.R
In marray: Exploratory analysis for two-color spotted microarray data

### R code from vignette source 'marray.Rnw'

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### code chunk number 1: marray.Rnw:86-88
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library(marray)
dir(system.file("swirldata", package="marray")) 


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### code chunk number 2: marray.Rnw:95-97
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datadir <- system.file("swirldata", package="marray")
swirlTargets <- read.marrayInfo(file.path(datadir, "SwirlSample.txt"))


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### code chunk number 3: marray.Rnw:104-105
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mraw <- read.Spot(targets = swirlTargets, path=datadir)


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### code chunk number 4: marray.Rnw:118-121
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galinfo <- read.Galfile("fish.gal", path=datadir)
mraw@maLayout <- galinfo$layout
mraw@maGnames <- galinfo$gnames