tests/plot_Probe_Meth450.R

In MD-Anderson-Bioinformatics/GeneSurvey: MD Anderson Gene Survey

library(GeneSurvey)

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baseDir <- getBaseDir()
zipFile <- getZipDir()
if ((!is.null(baseDir))&&(!is.null(zipFile)))
{
  initGeneReport("-Xmx4800m")
  foo <- plot_Probe_Meth450("cg22949073", theOutputDir=file.path(baseDir, "plotMeth450probe"), theZipFile=zipFile)

  ("17-7572391-TP53-cg22949073_Meth450_Stripchart.PNG"==basename(foo[1]))
} else {
  message("No test data. Skip test.")
  TRUE
}