est_mixed: TMB::MakeADFunに必要な引数から固定効果とランダム効果を推定する関数

In ShotaNishijima/frasam: Fisheries Research Agency (FRA) provides an R package for analyzing the State-space Assessment Model (SAM)

TMB::MakeADFunに必要な引数から固定効果とランダム効果を推定する関数

Description

TMB::MakeADFunに必要な引数から固定効果とランダム効果を推定する関数

Usage

est_mixed(
  tmbdata,
  par_init,
  map,
  random = "U",
  cpp.file.name = "sam2",
  silent = TRUE,
  bias_correct = TRUE
)

Arguments

tmbdata	tmbdata
par_init	パラメータの初期値
map	推定しない（初期値で固定する）パラメータ
random	ランダム効果で推定するパラメータ
cpp.file.name	cppファイルの名前（初期設定："sam"）
bias_correct	平均値のバイアス補正をするかどうか

ShotaNishijima/frasam documentation built on Sept. 9, 2024, 8:43 p.m.