ge_stats: Computa diversas estatisticas relacionadas a interação...

In TiagoOlivoto/cursoR: Curso R do grupo Experimentacao da UFSM-SM

Description

Retorna diversas informações baseadas em um conjunto de dados com a estrutura GEN, AMB, REP, tais como as médias e efeitos da interação GxE, bem como algumas estatisticas de estabilidade.

Usage

ge_stats(data, resp, gen, env, rep)

Arguments

data	O conjunto de dados. Deve conter os seguintes fatores: Ambiente, Genótipo, Bloco e variável(is) resposta.
resp	A variável resposta a ser analizada, por exemplo resP = "RG"
gen	O nome atribuído a coluna que contém os genótipos, por exemplo, gen = "HIBRIDO"
env	O nome atribuído a coluna que contém os ambientes, por exemplo, env = "AMBIENTES"
rep	O nome atribuído a coluna que contém as repetições/blocos, por exemplo, rep = "BLOCO"

Value

individual	Uma lista com os resultados da análise de variância individual de cada ambiente. No dataframe individual são são calculados os seguintes valores: ENV, , o código do ambiente, Mean, a média do ambiente, MSblock, o quadrado médio do bloco, MSgen, o quadrado médio do genótipo, MSres, o quadrado médio do erro, Fcal(Blo) e Fcal(Gen) são o F faculado para o bloco e genótipo, com as respectivas probabilidades [ Pr>F(Blo) e Fcal(Gen)], CV é o coeficiente de variação, h2 é a herdabilidade média, AS é a acurácia seletiva e R2 é o coeficiente de determinação
ge_means	Uma lista com os seguintes data frames: ge_means, contendo as médias dos genótipos nos ambientes; ge_effects, os efeitos da interação genótipo vs ambiente e gge_effects, os efeitos dos genótipos + interação genótipo vs ambiente
anovaconj	A análise de variância conjunta considerando o delineamento de blocos completos casualizados
ER	A análise de estabilidade pelo método de Eberhart e Russell (1966)
stab_meas	Uma lista contendo os seguintes data frames: StabMeasures, MeanVarPlot, MeanEcovPlot e MeanShuklaVarPlot
stab_reg	Uma lista com o data frame StabIndvReg, contendo a regressão individual dos genótipos nos ambientes e MeanSlopePlot que é um gráfico com os valores do slope e da média dos genótipos

Author(s)

Tiago Olivoto [e-mail]

TiagoOlivoto/cursoR documentation built on May 13, 2019, 1:23 p.m.