pairs_mantel: Pares de correlação de mantel para matrizes de distância

Description Usage Arguments Author(s)

Description

Plota o coeficiente de correlação de mantel de uma lista de objetos em formato de matriz.

Usage

1
2
3
4
5
6
7
8
9
pairs_mantel(data = list(x, y, ...), nrepet = 1000, names = NULL, 
          prob = 0.05, diag = FALSE, export = FALSE, main = "auto",
          file.type = "pdf", file.name = NULL, width = 8, 
          height = 7, resolution = 300, size.point = 0.5, 
          shape.point = 19, alpha.point = 1, fill.point = NULL,
          col.point = "black", minsize = 2, maxsize = 3, 
          signcol = "green", alpha = 0.15, diagcol = "gray", 
          col.up.panel = "gray", col.lw.panel = "gray", 
          col.dia.panel = "black", pan.spacing = 0.15, digits = 2)

Arguments

data

Uma lista com objetos da função distdend

nrepet

O número de permutações a serem utilizadas. Padrão é 1000

names

Um vetor de caracteres correspondente aos nomes de cada matriz. Padrão é o nome do arquivo.

prob

A probabilidade considerada.

diag

Argumento lógico. Se TRUE, a funcao de distribuicao de probabilidade pela estimativa Kernel é mostrada na diagonal

main

O titulo do grafico. Padrao é 'auto'.

file.type

O tipo de arquivo a ser exportado. Argumento válido se export = T|TRUE. Padrão é "pdf". O gráfico também pode ser exportado em formato *.tiff declarando file.type = "tiff".

file.name

O nome do arquivo para exportação. Padrão é NULL, ou seja, o arquivo é nomeado automaticamente.

width

A largura em "inch" do gráfico. Padrão é 8.

height

A algura em "inch" do gráfico. Padrão é 7.

resolution

A resolução da imagem. Argumento válido se file.type = "tiff" é declarado. Padrão é 300 (300 dpi).

size.point

O tamanho do ponto que representa as ditribuições das variáveis. Padrão é 0.5.

shape.point

O formato do ponto. Padrão é 19.

alpha.point

Valor para indicar a transparência do ponto. 0 = totalmente transparente; 1 = cor completa. Padrão é 1.

fill.point

Cor para preenximento do ponto. Argumento valido, se shape.point = 21:25.

col.point

Cor para a borda do ponto. Padrão é 'black'.

minsize

O tamanho da letra para representar o menor coeficiente de correlação.

maxsize

O tamanho da letra para representar o maior coeficiente de correlação.

signcol

Cor para indicar as correlações significantes. Padrão é "green".

alpha

Valor para indicar a transparência da cor informada no argumento signcol. 0 = totalmente transparente; 1 = cor completa. Padrão é 0.15

diagcol

Cor para representar a distribuição da variável (diagonal). Padrão é "gray".

col.up.panel, col.lw.panel, col.dia.panel

A cor da borda dos painéis da diagonal superior, inferior e da diagonal, respectivamente. Os padrões são, respectivamente "gray", "gray" e "black".

pan.spacing

O espaçamento entre os painéis. Padrão é 0.15. Valores maiores aumentam a distância entre os painéis. Se o valor for 0, não há espaço entre os painéis.

digits

O número de digitos a ser mostrado no gráfico.

Author(s)

Tiago Olivoto tiagoolivoto@gmail.com


TiagoOlivoto/cursoR documentation built on May 13, 2019, 1:23 p.m.