Files in dvera/gyro

gyro: Genomic utility wrappers in R

R/bcftoolsCall.R R/bcftoolsFilter.R R/bcftoolsMerge.R R/bcftoolsQuery.R R/bcftoolsView.R R/bedtoolsClosest.R R/bedtoolsComplement.R R/bedtoolsCoverage.R R/bedtoolsGenomeCov.R R/bedtoolsIntersect.R R/bedtoolsMakeWindows.R R/bedtoolsMap.R R/bedtoolsMerge.R R/bedtoolsMulticov.R R/bedtoolsShuffle.R R/bedtoolsSlop.R R/bedtoolsSubtract.R R/bedtoolsWindow.R R/bfc.R R/bgzip.R R/bowtie.R R/bowtie2.R R/bwaAln.R R/bwaIndex.R R/bwaMem.R R/bwaSampe.R R/bwaSamse.R R/bwaSw.R R/cuffdiff.R R/cufflinks.R R/cutadapt.R R/cutadapt2.R R/cutadapt3.R R/fastq.filter.R R/fastq.merge.R R/fastqc.R R/fastqp.R R/fastx.trimmer.R R/fastxClipper.R R/fastxTrimmer.R R/featureCounts.R R/fermi.R R/gyroDeploy.R R/gyroUpdate.R R/hisat2.R R/kallistoQuant.R R/kentBedClip.R R/kentBigWigAverageOverBed.R R/kentLiftOver.R R/macsCallpeak.R R/pepr.R R/sambambaRmdup.R R/samtoolsCat.R R/samtoolsIndex.R R/samtoolsMerge.R R/samtoolsMpileup.R R/samtoolsRmdup.R R/samtoolsSort.R R/samtoolsView.R R/seqtkSeq.R R/seqtkTrimfq.R R/stringtie.R R/tabix.R R/tophat.R README.md man/bedtoolsCoverage.Rd man/bedtoolsGenomeCov.Rd man/bedtoolsIntersect.Rd man/bedtoolsMap.Rd man/bedtoolsMerge.Rd man/bedtoolsMulticov.Rd man/bedtoolsSubtract.Rd man/macsCallpeak.Rd man/samtoolsCat.Rd man/samtoolsIndex.Rd man/samtoolsMerge.Rd man/samtoolsSort.Rd