get_map: GIS-data ophalen

In msberends/certedata: Tools for Data Analysis at Certe

Description

Hiermee kan Nederlandse GIS-data opgehaald worden voor ruimtelijke analyse (spatial analysis) met plot2.map.

Usage

get_map(maptype = "pc3", only_adherence = TRUE)

add_map(data, maptype = "pc3", by = NULL)

Arguments

maptype	Standaard is "pc3". Geldige waarden zijn "provincies", "gemeenten", "postcodes", "pc4", "pc3", "pc2".
only_adherence	Standaard is TRUE. Data filteren op alleen het adherentiegebied van Certe. Hiermee worden postcodes gefilterd op >7300, of provincies gefilterd op Friesland, Groningen, Drenthe.
data	Gegevens (zoals isolaten) waar GIS-data aan gekoppeld moet worden.
by	Kolommen die voor de join gebruikt worden, zie left_join.

Details

De kolom met geogegevens heeft de volgende naam:

• Bij provincies provincies (oorspronkelijk provincien)

• Bij gemeenten: gemeenten (oorspronkelijk gemeentena)

• Bij postcodes postcode (oorspronkelijk pc4)

Deze worden gebruikt bij een join, zoals met add_map.

Examples

## Not run: 

# Werkend voorbeeld:
urines <- certedb_getmmb(2015,
                         2018,
                         zipcodes = TRUE,
                         ziplength = 3,
                         first_isolates = TRUE)
urines %>%
  filter(eerste_urineisolaat_gewogen == TRUE,
         bacteriecode %like% "ESCCOL") %>%
  group_by(postcode) %>%
  summarise(amox = portion_R(amox)) %>%
  add_map(maptype = "pc3") %>%
  plot2.map(y = amox,
            title = "Amoxicilline-resistentie bij *E. coli*",
            subtitle = "Eerste urinekweekisolaten in 2018")

## End(Not run)

msberends/certedata documentation built on Nov. 26, 2019, 5:19 a.m.