build_pkg.R

In walmes/ClickMetrics: Measure length, area and count objects on images based on clicks

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# Construção do pacote.

(find-file "~/Projects/ClickMetrics/DESCRIPTION")
(find-file "~/Projects/ClickMetrics/NAMESPACE")

# Carrega conteúdo do pacote.
devtools::load_all()

# wzRfun::pkgs_versions("ClickMetrics")

# Gera a documentação e escreve o NAMESPACE.
devtools::document()

# Faz verificação de conformidade do pacote.
# devtools::check(env_vars = c("_R_CHECK_LICENSE_" = FALSE))
devtools::check(args = "--no-build-vignettes",
                build_args = "--no-build-vignettes",
                env_vars = c("_R_CHECK_LICENSE_" = FALSE))

# Gera o tar.gz do pacote.
devtools::build(vignettes = FALSE,
                manual = FALSE)

# Gera as vinhetas.
# build_vignettes(dependencies = FALSE)

# Instala o pacote.
devtools::install(reload = TRUE,
                  build_vignettes = FALSE,
                  dependencies = FALSE,
                  upgrade_dependencies = FALSE)

devtools::session_info()
sessionInfo()

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# Gera a página em pkgdown do pacote.

library(pkgdown)
options(pkgdown.internet = FALSE)

# Constrói os elementos da página do pacote.
unlink("docs", recursive = TRUE)
pkgdown::build_site()      # Todo o site que inclui tudo acima.

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# Inspecina o pacote.

quit("no")

library(ClickMetrics)
packageVersion("ClickMetrics")
packageDescription("ClickMetrics")

ls("package:ClickMetrics")

help(package = "ClickMetrics")

rm(list = objects())
ls()

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# Zona de testes.

devtools::load_all()

files <- dir(path = system.file("images", package = "ClickMetrics"),
             pattern = "^petri.*\\.png$",
             full.names = TRUE)
files

tb <- diameter_measurer(files = files,
                        labels = c("Plate", "Trat1", "Trat2"),
                        obs = "Done with ClickMetrics",
                        csv = "my_clicks.csv")
str(tb)

with(tb, by(cbind(x, y), INDICES = pair, FUN = dist))

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