inst/doc/DeMAND.R

### R code from vignette source 'DeMAND.Rnw'

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### code chunk number 1: DeMAND.Rnw:24-27 (eval = FALSE)
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## if (!requireNamespace("BiocManager", quietly=TRUE))
##     install.packages("BiocManager")
## BiocManager::install("DeMAND")


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### code chunk number 2: DeMAND.Rnw:34-35
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library(DeMAND)


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### code chunk number 3: DeMAND.Rnw:50-52
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data(inputExample)
#ls()


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### code chunk number 4: DeMAND.Rnw:57-59
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dobj <- demandClass(exp=bcellExp, anno=bcellAnno, network=bcellNetwork)
printDeMAND(dobj)


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### code chunk number 5: DeMAND.Rnw:66-68
###################################################
dobj <- runDeMAND(dobj, fgIndex=caseIndex, bgIndex=controlIndex)
printDeMAND(dobj)


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### code chunk number 6: DeMAND.Rnw:100-101
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sessionInfo()

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DeMAND documentation built on Nov. 1, 2018, 3:47 a.m.