inst/doc/DeMAND.R

### R code from vignette source 'DeMAND.Rnw'

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### code chunk number 1: DeMAND.Rnw:24-26 (eval = FALSE)
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## source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
## biocLite("DeMAND")


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### code chunk number 2: DeMAND.Rnw:33-34
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library(DeMAND)


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### code chunk number 3: DeMAND.Rnw:49-51
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data(inputExample)
#ls()


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### code chunk number 4: DeMAND.Rnw:56-58
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dobj <- demandClass(exp=bcellExp, anno=bcellAnno, network=bcellNetwork)
printDeMAND(dobj)


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### code chunk number 5: DeMAND.Rnw:65-67
###################################################
dobj <- runDeMAND(dobj, fgIndex=caseIndex, bgIndex=controlIndex)
printDeMAND(dobj)


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### code chunk number 6: DeMAND.Rnw:99-100
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sessionInfo()

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DeMAND documentation built on May 2, 2018, 2:30 a.m.