byChroms.R
In geneplotter: Graphics related functions for Bioconductor

### R code from vignette source 'byChroms.Rnw'

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### code chunk number 1: loaddata
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 library("annotate")
 library("hu6800.db")
 lens <- unlist(eapply(hu6800CHR, length))

 table(lens)
 wh2 = mget(names(lens)[lens==2], env = hu6800CHR)

 wh2[1]


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### code chunk number 2: fixdata
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chrs2 <- unlist(eapply(hu6800CHR, function(x) x[1]))
chrs2 <- factor(chrs2)
length(chrs2)
 table(unlist(chrs2))


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### code chunk number 3: strandloc
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 strand <- as.list(hu6800CHRLOC)

 splits <- split(strand, chrs2)
 length(splits)
 names(splits)



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### code chunk number 4: chrloc
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 newChrClass <- buildChromLocation("hu6800")



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### code chunk number 5: cPlot
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  library(geneplotter)

  cPlot(newChrClass)