plot_ftir_core: PlotFTIR core plot generator

In PlotFTIR: Plot FTIR Spectra

PlotFTIR core plot generator

Description

Plot the FTIR spectra in a journal prepared format. Call [plot_ftir()] for basic (overlaid) plots and [plot_ftir_stacked()] for stacked and offset plots.

Tracez les spectres IRTF dans un format préparé par un journal. Appelez [plot_ftir()] pour les tracés de base (superposés) et [plot_ftir_stacked()] pour les tracés empilés et décalés.

Usage

plot_ftir_core(
  ftir,
  plot_title = "FTIR Spectra",
  legend_title = "Sample ID",
  lang = NA
)

Arguments

ftir	A data.frame in long format with columns 'sample_id', 'wavenumber', and 'absorbance'. The 'absorbance' column may be replaced by a 'transmittance' column for transmittance plots. The code determines the correct y axis units and labels the plot/adjusts the margins appropriately. Un data.frame au format long avec les colonnes 'sample_id', 'wavenumber', et 'absorbance'. La colonne 'absorbance' peut être remplacée par une colonne 'transmittance' pour les tracés de transmission. Le code détermine les unités correctes de l'axe y et étiquette le tracé/ajuste les marges de manière appropriée.
plot_title	Title for plot. Defaults to "FTIR Spectra". Vector length 2 uses second element as subtitle. Titre du tracé. Par défaut "FTIR Spectra". Un vecteur de longueur 2 utilise le deuxième élément comme sous-titre.
legend_title	Title for legend. Defaults to "Sample ID". Titre de la légende. Par défaut "Sample ID".
lang	Optional language argument: 'fr'/'french'/'francais'/'français' for French; 'en'/'english'/'anglais' for English; 'NA' uses default. Argument optionnel pour la langue : 'fr'/'french'/'francais'/'français' pour le français ; ‘en'/'english'/'anglais' pour l’anglais ; 'NA' utilise la valeur par défaut.

Value

a ggplot object containing a FTIR spectral plot. The plot and legend titles are as provided, with each sample provided a different default color. Because this is a ggplot object, any other ggplot modifiers, layers, or changes can be applied to the returned object. Further manipulations can be performed by this package. Peut également fournir 'en', 'english' ou 'anglais'.

un objet ggplot contenant un tracé spectral IRTF. Les titres de le tracé et de la légende sont tels que fournis, avec une couleur par défaut différente pour chaque échantillon. Puisqu'il s'agit d'un objet ggplot, tous les autres modificateurs, calques ou changements ggplot peuvent être appliqués à l'objet retourné. D'autres manipulations peuvent être effectuées par ce package.

See Also

[zoom_in_on_range()] to 'zoom' into a specified range, [compress_low_energy()] to make the x axis non-linear (compressing lower energy regions), [add_wavenumber_marker()] to add markers to highlight important wavenumbers, and [move_plot_legend()] to modify the legend position.

[zoom_in_on_range()] pour 'zoomer' sur une gamme spécifiée, [compress_low_energy()] pour rendre l'axe x non linéaire (en compression les régions à basse énergie), [add_wavenumber_marker()] pour ajouter des marqueurs afin de mettre en évidence les nombres d'ondes importants, et [move_plot_legend()] pour modifier la position de la légende.

PlotFTIR documentation built on July 21, 2026, 5:06 p.m.