plotftir_to_ir: Convert 'PlotFTIR' data to 'ir'

In PlotFTIR: Plot FTIR Spectra

Convert 'PlotFTIR' data to 'ir'

Description

Converts 'PlotFTIR' data to that ready to use by the 'ir' package.

Convertit les données 'PlotFTIR' en données prêtes à être utilisées par le paquet 'ir'.

Usage

plotftir_to_ir(ftir, metadata = NA)

Arguments

ftir

A data.frame in long format with columns 'sample_id', 'wavenumber', and 'absorbance'. The 'absorbance' column may be replaced by a 'transmittance' column for transmittance plots. The code determines the correct y axis units and labels the plot/adjusts the margins appropriately. Un data.frame au format long avec les colonnes 'sample_id', 'wavenumber', et 'absorbance'. La colonne 'absorbance' peut être remplacée par une colonne 'transmittance' pour les tracés de transmission. Le code détermine les unités correctes de l'axe y et étiquette le tracé/ajuste les marges de manière appropriée.

metadata

Additional data to pass to 'ir' to include as metadata. Should be structured as a data.frame. Données supplémentaires à transmettre à 'ir' pour les inclure dans les métadonnées. Doit être structuré comme un data.frame.

Value

an 'ir' classed data.frame structured for use in that package.

un data.frame de classe 'ir' structuré pour être utilisé dans ce paquet.

See Also

[ir::ir_new_ir()] for information on how ir takes in data.

Examples

if (requireNamespace("ir", quietly = TRUE)) {
  # convert biodiesel to a `ir` object
  plotftir_to_ir(biodiesel,
    metadata = data.frame("Biodiesel_Content" = c(0, 0.25, 0.5, 1, 2.5, 5, 7.5, 10, 0.5, 5, NA))
  )
}

PlotFTIR documentation built on April 13, 2025, 5:11 p.m.