R/sim2dist.R

In RFLPtools: Tools to Analyse RFLP Data

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## convert similarity matrix to dist object
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sim2dist <- function(x, maxSim = 1){
    stopifnot(is.matrix(x))
    stopifnot(isSymmetric(x))
    stopifnot(maxSim >= max(x))
    d <- maxSim - x # from similarity to distance
    return(as.dist(d))
}