tests/testthat/_snaps/finbif_collections.md

fetching collections works

Code
  collections
Output
          id      long_name has_children secure_level abbreviation
  HR.1127 HR.1127 Collecti… TRUE         <NA>         <NA>        
  HR.1207 HR.1207 Collecti… TRUE         <NA>         <NA>        
  HR.121  HR.121  Collecti… TRUE         <NA>         <NA>        
  HR.1247 HR.1247 Natural … TRUE         <NA>         <NA>        
  HR.128  HR.128  Collecti… TRUE         <NA>         <NA>        
  HR.1627 HR.1627 Collecti… TRUE         <NA>         <NA>        
  HR.1915 HR.1915 Data sou… TRUE         <NA>         <NA>        
  HR.1989 HR.1989 FinBIF d… TRUE         <NA>         Lajitietoke…
  HR.3551 HR.3551 Data sou… TRUE         <NA>         <NA>        
  HR.3552 HR.3552 Data sou… TRUE         <NA>         Syke        
  HR.3778 HR.3778 Other oc… TRUE         <NA>         <NA>        
  HR.3811 HR.3811 Collecti… TRUE         <NA>         <NA>        
  HR.4171 HR.4171 Porvoo M… TRUE         MX.secureLe… <NA>        
  HR.4911 HR.4911 Iisalmi … TRUE         <NA>         <NA>        
  HR.5896 HR.5896 Data sou… TRUE         <NA>         <NA>        
          additional_identifier allowed_for_dw_statistics bounding_box_lat_max
  HR.1127 NA                    NA                        NA                  
  HR.1207 NA                    NA                        NA                  
  HR.121  NA                    NA                        NA                  
  HR.1247 NA                    NA                        NA                  
  HR.128  NA                    NA                        NA                  
  HR.1627 NA                    NA                        NA                  
  HR.1915 NA                    NA                        NA                  
  HR.1989 NA                    NA                        NA                  
  HR.3551 NA                    NA                        NA                  
  HR.3552 NA                    NA                        NA                  
  HR.3778 NA                    NA                        NA                  
  HR.3811 NA                    NA                        NA                  
  HR.4171 NA                    NA                        NA                  
  HR.4911 NA                    NA                        NA                  
  HR.5896 NA                    NA                        NA                  
          bounding_box_lat_min bounding_box_lon_max bounding_box_lon_min
  HR.1127 NA                   NA                   NA                  
  HR.1207 NA                   NA                   NA                  
  HR.121  NA                   NA                   NA                  
  HR.1247 NA                   NA                   NA                  
  HR.128  NA                   NA                   NA                  
  HR.1627 NA                   NA                   NA                  
  HR.1915 NA                   NA                   NA                  
  HR.1989 NA                   NA                   NA                  
  HR.3551 NA                   NA                   NA                  
  HR.3552 NA                   NA                   NA                  
  HR.3778 NA                   NA                   NA                  
  HR.3811 NA                   NA                   NA                  
  HR.4171 NA                   NA                   NA                  
  HR.4911 NA                   NA                   NA                  
  HR.5896 NA                   NA                   NA                  
          citation  collection_code collection_name collection_quality
  HR.1127 <NA>      NA              Collections of… MY.collectionQual…
  HR.1207 <NA>      NA              Collections of… MY.collectionQual…
  HR.121  <NA>      NA              Collections of… MY.collectionQual…
  HR.1247 Natural … NA              Natural Histor… MY.collectionQual…
  HR.128  <NA>      NA              Collections of… MY.collectionQual…
  HR.1627 <NA>      NA              Collections of… MY.collectionQual…
  HR.1915 <NA>      NA              Data sources o… MY.collectionQual…
  HR.1989 <NA>      NA              FinBIF datasets MY.collectionQual…
  HR.3551 <NA>      NA              Data sources o… MY.collectionQual…
  HR.3552 <NA>      NA              Data sources o… MY.collectionQual…
  HR.3778 <NA>      NA              Other occurren… MY.collectionQual…
  HR.3811 <NA>      NA              Collections of… MY.collectionQual…
  HR.4171 <NA>      NA              Porvoo Museum … MY.collectionQual…
  HR.4911 <NA>      NA              Iisalmi Natura… MY.collectionQual…
  HR.5896 <NA>      NA              Data soursces … MY.collectionQual…
          collection_size collection_type concealment_basis contact_email
  HR.1127 <NA>            MY.collectionT… NA                jukka.olavi.…
  HR.1207 <NA>            MY.collectionT… NA                jouni.aspi@o…
  HR.121  25700           MY.collectionT… NA                kieppi@kokko…
  HR.1247 300000          MY.collectionT… NA                jyrki.t.torn…
  HR.128  <NA>            MY.collectionT… NA                paula.kankaa…
  HR.1627 <NA>            MY.collectionT… NA                ilesa@utu.fi 
  HR.1915 <NA>            MY.collectionT… NA                tietopalvelu…
  HR.1989 <NA>            MY.collectionT… NA                info@laji.fi 
  HR.3551 <NA>            MY.collectionT… NA                lajigis@mets…
  HR.3552 <NA>            MY.collectionT… NA                kirjaamo@syk…
  HR.3778 <NA>            MY.collectionT… NA                helpdesk@laj…
  HR.3811 <NA>            MY.collectionT… NA                tomi.kumpula…
  HR.4171 50000           MY.collectionT… NA                solveig.berg…
  HR.4911 70000           MY.collectionT… NA                jaderholmkai…
  HR.5896 <NA>            MY.collectionT… NA                matti.kervin…
          coverage_basis data_notes data_quality data_quality_description
  HR.1127 NA             <NA>       MY.dataQual… Data of the Kuopio Natu…
  HR.1207 NA             <NA>       MY.dataQual… <NA>                    
  HR.121  NA             <NA>       MY.dataQual… <NA>                    
  HR.1247 NA             <NA>       MY.dataQual… <NA>                    
  HR.128  NA             <NA>       MY.dataQual… <NA>                    
  HR.1627 NA             <NA>       MY.dataQual… International scientifi…
  HR.1915 NA             <NA>       MY.dataQual… <NA>                    
  HR.1989 NA             <NA>       MY.dataQual… <NA>                    
  HR.3551 NA             <NA>       <NA>         <NA>                    
  HR.3552 NA             <NA>       <NA>         <NA>                    
  HR.3778 NA             <NA>       <NA>         <NA>                    
  HR.3811 NA             <NA>       <NA>         <NA>                    
  HR.4171 NA             <NA>       <NA>         <NA>                    
  HR.4911 NA             Data of t… <NA>         <NA>                    
  HR.5896 NA             <NA>       <NA>         <NA>                    
          data_quarantine_period data_use_terms description digitized_size doi
  HR.1127 NA                     NA             Botanical … <NA>           NA 
  HR.1207 NA                     NA             Collection… <NA>           NA 
  HR.121  NA                     NA             Mineral, L… 33             NA 
  HR.1247 NA                     NA             Natural Hi… 35             NA 
  HR.128  NA                     NA             The nation… <NA>           NA 
  HR.1627 NA                     NA             Collection… <NA>           NA 
  HR.1915 NA                     NA             Data sourc… <NA>           NA 
  HR.1989 NA                     NA             FinBIF Col… <NA>           NA 
  HR.3551 NA                     NA             All data s… <NA>           NA 
  HR.3552 NA                     NA             All data s… <NA>           NA 
  HR.3778 NA                     NA             Other occu… <NA>           NA 
  HR.3811 NA                     NA             Collection… <NA>           NA 
  HR.4171 NA                     NA             Natural Hi… 0              NA 
  HR.4911 NA                     NA             Zoological… <NA>           NA 
  HR.5896 NA                     NA             Data sourc… <NA>           NA 
          edit_notes gbif_doi geographic_coverage institution_code
  HR.1127 NA         NA       World               KUO             
  HR.1207 NA         NA       <NA>                <NA>            
  HR.121  NA         NA       World               <NA>            
  HR.1247 NA         NA       Eurasia             JYV             
  HR.128  NA         NA       World               <NA>            
  HR.1627 NA         NA       World wide          <NA>            
  HR.1915 NA         NA       <NA>                <NA>            
  HR.1989 NA         NA       World               <NA>            
  HR.3551 NA         NA       <NA>                <NA>            
  HR.3552 NA         NA       <NA>                <NA>            
  HR.3778 NA         NA       <NA>                <NA>            
  HR.3811 NA         NA       <NA>                <NA>            
  HR.4171 NA         NA       mostly East Uusimaa <NA>            
  HR.4911 NA         NA       World               <NA>            
  HR.5896 NA         NA       <NA>                <NA>            
          intellectual_description intellectual_owner intellectual_rights
  HR.1127 NA                       <NA>               MY.intellectualRig…
  HR.1207 NA                       University of Oulu MY.intellectualRig…
  HR.121  NA                       <NA>               MY.intellectualRig…
  HR.1247 NA                       <NA>               MY.intellectualRig…
  HR.128  NA                       <NA>               MY.intellectualRig…
  HR.1627 NA                       <NA>               MY.intellectualRig…
  HR.1915 NA                       Natural Resources… MY.intellectualRig…
  HR.1989 NA                       Finnish Biodivers… MY.intellectualRig…
  HR.3551 NA                       <NA>               MY.intellectualRig…
  HR.3552 NA                       <NA>               MY.intellectualRig…
  HR.3778 NA                       <NA>               MY.intellectualRig…
  HR.3811 NA                       Tampere Museum of… MY.intellectualRig…
  HR.4171 NA                       Porvoo Museum      MY.intellectualRig…
  HR.4911 NA                       Iisalmi Natural H… MY.intellectualRig…
  HR.5896 NA                       <NA>               MY.intellectualRig…
          internal_use_only is_part_of language metadata_creator metadata_status
  HR.1127 NA                NA         <NA>     Renvall, Pertti  MY.metadataSta…
  HR.1207 NA                NA         <NA>     Aspi, Jouni      MY.metadataSta…
  HR.121  NA                NA         <NA>     Hyttinen, Paula  MY.metadataSta…
  HR.1247 NA                NA         mixed    Torniainen, Jyr… MY.metadataSta…
  HR.128  NA                NA         <NA>     Paula Kankaanpää <NA>           
  HR.1627 NA                NA         english  <NA>             MY.metadataSta…
  HR.1915 NA                NA         finnish  <NA>             MY.metadataSta…
  HR.1989 NA                NA         <NA>     <NA>             MY.metadataSta…
  HR.3551 NA                NA         <NA>     <NA>             MY.metadataSta…
  HR.3552 NA                NA         <NA>     <NA>             MY.metadataSta…
  HR.3778 NA                NA         <NA>     <NA>             <NA>           
  HR.3811 NA                NA         <NA>     <NA>             MY.metadataSta…
  HR.4171 NA                NA         english  <NA>             MY.metadataSta…
  HR.4911 NA                NA         <NA>     <NA>             MY.metadataSta…
  HR.5896 NA                NA         <NA>     <NA>             MY.metadataSta…
          methods notes     online_url person_responsible public_access
  HR.1127 NA      Data of … <NA>       Renvall, Pertti      NA         
  HR.1207 NA      <NA>      <NA>       Aspi, Jouni          NA         
  HR.121  NA      <NA>      https://w… Mäenpää, Mari        NA         
  HR.1247 NA      <NA>      <NA>       Torniainen, Jyrki    NA         
  HR.128  NA      <NA>      http://ww… Kankaanpää, Paula    NA         
  HR.1627 NA      <NA>      <NA>       Ilari Sääksjärvi     NA         
  HR.1915 NA      <NA>      <NA>       Katja Holmala        NA         
  HR.1989 NA      <NA>      <NA>       Matti Sahla          NA         
  HR.3551 NA      <NA>      <NA>       Tuuli Pakkanen       NA         
  HR.3552 NA      <NA>      https://w… Suomen ympäristök…   NA         
  HR.3778 NA      <NA>      <NA>       Heikkinen, Mikko     NA         
  HR.3811 NA      <NA>      <NA>       Tomi Kumpulainen     NA         
  HR.4171 NA      <NA>      <NA>       Bergholm, Solveig  TRUE         
  HR.4911 NA      <NA>      <NA>       Jäderholm, Kai       NA         
  HR.5896 NA      <NA>      <NA>       Matti Kervinen       NA         
          publication_description publication_terms publisher_shortname
  HR.1127 NA                      <NA>              Kuopio Natural His…
  HR.1207 NA                      <NA>              University of Oulu 
  HR.121  NA                      <NA>              Kieppi             
  HR.1247 NA                      <NA>              University of Jyvä…
  HR.128  NA                      MY.publicationTe… Luomus             
  HR.1627 NA                      <NA>              University of Turku
  HR.1915 NA                      <NA>              Luke               
  HR.1989 NA                      <NA>              FinBIF             
  HR.3551 NA                      <NA>              Metsähallitus      
  HR.3552 NA                      <NA>              Syke               
  HR.3778 NA                      <NA>              <NA>               
  HR.3811 NA                      <NA>              Tampere Museum of …
  HR.4171 NA                      <NA>              Porvoo Museum      
  HR.4911 NA                      <NA>              Iisalmi Natural Hi…
  HR.5896 NA                      <NA>              <NA>               
          share_to_feo share_to_gbif taxonomic_coverage temporal_coverage
  HR.1127 NA           NA            Biota              <NA>             
  HR.1207 NA           NA            <NA>               <NA>             
  HR.121  NA           NA            <NA>               1948 -           
  HR.1247 NA           NA            <NA>               1850-            
  HR.128  NA           NA            <NA>               <NA>             
  HR.1627 NA           NA            <NA>               <NA>             
  HR.1915 NA           NA            <NA>               <NA>             
  HR.1989 NA           NA            Biota              <NA>             
  HR.3551 NA           NA            <NA>               <NA>             
  HR.3552 NA           NA            <NA>               <NA>             
  HR.3778 NA           NA            <NA>               <NA>             
  HR.3811 NA           NA            <NA>               <NA>             
  HR.4171 NA           NA            plants, fungi and… 1800-            
  HR.4911 NA           NA            Biota              <NA>             
  HR.5896 NA           NA            <NA>               <NA>             
          types_size date_created date_edited owner    publicity_restrictions
  HR.1127 <NA>       2015-06-30T… 2024-10-14… MOS.173  NA                    
  HR.1207 <NA>       2015-11-19T… 2024-10-14… MOS.1045 NA                    
  HR.121  <NA>       2012-08-20T… 2021-11-24… MOS.1025 NA                    
  HR.1247 <NA>       2015-12-02T… 2024-10-14… MOS.2820 NA                    
  HR.128  <NA>       2012-10-10T… 2024-06-19… MOS.3620 NA                    
  HR.1627 <NA>       2016-09-06T… 2024-10-14… MOS.2180 NA                    
  HR.1915 <NA>       2017-01-13T… 2024-10-14… MOS.3680 NA                    
  HR.1989 <NA>       2017-01-25T… 2024-10-14… MOS.1016 NA                    
  HR.3551 <NA>       2020-05-28T… 2024-10-14… MOS.1057 NA                    
  HR.3552 <NA>       2020-05-28T… 2024-10-14… MOS.307  NA                    
  HR.3778 <NA>       2020-12-09T… 2024-10-14… MOS.1016 NA                    
  HR.3811 <NA>       2020-12-18T… 2021-11-24… MOS.7046 NA                    
  HR.4171 0          2021-07-01T… 2023-01-22… MOS.9282 NA                    
  HR.4911 <NA>       2022-11-04T… 2022-12-09… MOS.9662 NA                    
  HR.5896 <NA>       2024-01-31T… 2024-10-14… MOS.1016 NA                    
          download_request_handler            count    gathering_count
  HR.1127 MA.116                                     0 NA             
  HR.1207 MA.172                                     0 NA             
  HR.121  MA.186                                  6073 NA             
  HR.1247 MA.161                                 27926 NA             
  HR.128  MA.167, MA.3, MA.44, MA.75907, MA.9 15513082 NA             
  HR.1627 NA                                       181 NA             
  HR.1915 MA.2114, MA.44008, MA.53327            73983 NA             
  HR.1989 MA.167, MA.3, MA.44, MA.75907, MA.9  3961097 NA             
  HR.3551 MA.24746, MA.39268                   2087757 NA             
  HR.3552 MA.167, MA.3, MA.44, MA.75907, MA.9  2484946 NA             
  HR.3778 MA.167, MA.3, MA.44, MA.75907, MA.9  7202183 NA             
  HR.3811 MA.702                                     0 NA             
  HR.4171 MA.49989                                  47 NA             
  HR.4911 MA.32607                                   0 NA             
  HR.5896 MA.38028                               16338 NA             
          secured_count oldest_record newest_record first_load_date_min
  HR.1127 NA            NA            NA            NA                 
  HR.1207 NA            NA            NA            NA                 
  HR.121  NA            NA            NA            NA                 
  HR.1247 NA            NA            NA            NA                 
  HR.128  NA            NA            NA            NA                 
  HR.1627 NA            NA            NA            NA                 
  HR.1915 NA            NA            NA            NA                 
  HR.1989 NA            NA            NA            NA                 
  HR.3551 NA            NA            NA            NA                 
  HR.3552 NA            NA            NA            NA                 
  HR.3778 NA            NA            NA            NA                 
  HR.3811 NA            NA            NA            NA                 
  HR.4171 NA            NA            NA            NA                 
  HR.4911 NA            NA            NA            NA                 
  HR.5896 NA            NA            NA            NA                 
          first_load_date_max individual_count_sum individual_count_max
  HR.1127 NA                  NA                   NA                  
  HR.1207 NA                  NA                   NA                  
  HR.121  NA                  NA                   NA                  
  HR.1247 NA                  NA                   NA                  
  HR.128  NA                  NA                   NA                  
  HR.1627 NA                  NA                   NA                  
  HR.1915 NA                  NA                   NA                  
  HR.1989 NA                  NA                   NA                  
  HR.3551 NA                  NA                   NA                  
  HR.3552 NA                  NA                   NA                  
  HR.3778 NA                  NA                   NA                  
  HR.3811 NA                  NA                   NA                  
  HR.4171 NA                  NA                   NA                  
  HR.4911 NA                  NA                   NA                  
  HR.5896 NA                  NA                   NA                  
          record_quality_max red_list_status_max species_count taxon_count
  HR.1127 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.1207 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.121  NA                 NA                  NA            NA         
  HR.1247 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.128  NA                 NA                  NA            NA         
  HR.1627 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.1915 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.1989 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.3551 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.3552 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.3778 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.3811 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.4171 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.4911 NA                 NA                  NA            NA         
  HR.5896 NA                 NA                  NA            NA         
          line_length_sum pair_count_sum pair_count_max atlas_code_max
  HR.1127 NA              NA             NA             NA            
  HR.1207 NA              NA             NA             NA            
  HR.121  NA              NA             NA             NA            
  HR.1247 NA              NA             NA             NA            
  HR.128  NA              NA             NA             NA            
  HR.1627 NA              NA             NA             NA            
  HR.1915 NA              NA             NA             NA            
  HR.1989 NA              NA             NA             NA            
  HR.3551 NA              NA             NA             NA            
  HR.3552 NA              NA             NA             NA            
  HR.3778 NA              NA             NA             NA            
  HR.3811 NA              NA             NA             NA            
  HR.4171 NA              NA             NA             NA            
  HR.4911 NA              NA             NA             NA            
  HR.5896 NA              NA             NA             NA            
          atlas_class_max data_description
  HR.1127 NA              Botanical and Z…
  HR.1207 NA              Collections of …
  HR.121  NA              Mineral, Lepido…
  HR.1247 NA              Natural History…
  HR.128  NA              The national na…
  HR.1627 NA              Collections of …
  HR.1915 NA              Data sources of…
  HR.1989 NA              FinBIF Collecti…
  HR.3551 NA              All data source…
  HR.3552 NA              All data source…
  HR.3778 NA              Other occurrenc…
  HR.3811 NA              Collections of …
  HR.4171 NA              Natural History…
  HR.4911 NA              Zoological and …
  HR.5896 NA              Data sources of…


Try the finbif package in your browser

Any scripts or data that you put into this service are public.

finbif documentation built on April 12, 2025, 2:22 a.m.