Nothing
#' qda UI Function
#'
#' @description A shiny Module.
#'
#' @param id,input,output,session Internal parameters for {shiny}.
#'
#' @noRd
#'
#' @importFrom shiny NS tagList
mod_qda_ui <- function(id){
ns <- NS(id)
opciones <-
div(
conditionalPanel(
"input['qda_ui_1-Boxqda'] == 'tabqdaModelo' || input['qda_ui_1-Boxqda'] == 'tabqdaProb' || input['qda_ui_1-Boxqda'] == 'tabqdaProbInd'",
tabsOptions(heights = c(70), tabs.content = list(
list(
conditionalPanel(
"input['qda_ui_1-Boxqda'] == 'tabqdaModelo'",
options.run(ns("runqda")), tags$hr(style = "margin-top: 0px;")),
conditionalPanel(
"input['qda_ui_1-Boxqda'] == 'tabqdaProb'",
options.run(ns("runProb")), tags$hr(style = "margin-top: 0px;"),
div(col_12(selectInput(inputId = ns("cat.sel.prob"),label = labelInput("selectCat"),
choices = "", width = "100%"))),
div(col_12(numericInput(inputId = ns("by.prob"),label = labelInput("selpaso"), value = -0.05, min = 0, max = 1, step = 0.01,
width = "100%")))
),
conditionalPanel(
"input['qda_ui_1-Boxqda'] == 'tabqdaProbInd'",
options.run(ns("runProbInd")), tags$hr(style = "margin-top: 0px;"),
div(col_12(selectInput(inputId = ns("cat_probC"),label = labelInput("selectCat"),
choices = "", width = "100%"))),
div(col_12(numericInput(inputId = ns("val_probC"),label = labelInput("probC"), value = 0.5, min = 0, max = 1, step = 0.1,
width = "100%"))))
))))
)
tagList(
tabBoxPrmdt(
id = ns("Boxqda"), opciones = opciones,
tabPanel(title = labelInput("generatem"), value = "tabqdaModelo",
withLoader(verbatimTextOutput(ns("txtqda")),
type = "html", loader = "loader4")),
tabPanel(title = labelInput("predm"), value = "tabqdaPred",
withLoader(DT::dataTableOutput(ns("qdaPrediTable")),
type = "html", loader = "loader4")),
tabPanel(title = labelInput("mc"), value = "tabqdaMC",
withLoader(plotOutput(ns('plot_qda_mc'), height = "45vh"),
type = "html", loader = "loader4"),
verbatimTextOutput(ns("txtqdaMC"))),
tabPanel(title = labelInput("indices"), value = "tabqdaIndex",
fluidRow(col_6(echarts4rOutput(ns("qdaPrecGlob"), width = "100%")),
col_6(echarts4rOutput(ns("qdaErrorGlob"), width = "100%"))),
fluidRow(col_12(shiny::tableOutput(ns("qdaIndPrecTable")))),
fluidRow(col_12(shiny::tableOutput(ns("qdaIndErrTable"))))),
tabPanel(title = labelInput("probC"), value = "tabqdaProbInd",
withLoader(verbatimTextOutput(ns("txtqdaprobInd")),
type = "html", loader = "loader4")),
tabPanel(title = labelInput("probCstep"), value = "tabqdaProb",
withLoader(verbatimTextOutput(ns("txtqdaprob")),
type = "html", loader = "loader4"))
)
)
}
#' qda Server Function
#'
#' @noRd
mod_qda_server <- function(input, output, session, updateData, modelos, codedioma, modelos2){
ns <- session$ns
nombre.modelo <- rv(x = NULL)
observeEvent(updateData$datos, {
modelos2$qda = list(n = 0, mcs = vector(mode = "list", length = 10))
})
#Cuando se generan los datos de prueba y aprendizaje
observeEvent(c(updateData$datos.aprendizaje,updateData$datos.prueba), {
variable <- updateData$variable.predecir
datos <- updateData$datos
choices <- as.character(unique(datos[, variable]))
if(length(choices) == 2){
updateSelectInput(session, "cat_probC", choices = choices, selected = choices[1])
updateSelectInput(session, "cat.sel.prob", choices = choices, selected = choices[1])
}else{
updateSelectInput(session, "cat.sel.prob", choices = "")
updateSelectInput(session, "cat_probC", choices = "")
}
updateTabsetPanel(session, "Boxqda",selected = "tabqdaModelo")
})
# Genera el texto del modelo, predicción y mc de qda
output$txtqda <- renderPrint({
input$runqda
tryCatch({
default.codigo.qda()
train <- updateData$datos.aprendizaje
test <- updateData$datos.prueba
var <- paste0(updateData$variable.predecir, "~.")
nombre <- paste0("qda")
modelo <- traineR::train.qda(as.formula(var), data = train)
prob <- predict(modelo , test, type = 'prob')
variable <- updateData$variable.predecir
choices <- levels(test[, variable])
if(length(choices) == 2){
category <- isolate(input$cat_probC)
corte <- isolate(input$val_probC)
Score <- prob$prediction[,category]
Clase <- test[,variable]
results <- prob.values.ind(Score, Clase, choices, category, corte, print = FALSE)
mc <- results$MC
pred <- results$Prediccion
}else{
pred <- predict(modelo , test, type = 'class')
mc <- confusion.matrix(test, pred)
pred <- pred$prediction
}
isolate({
modelos$qda[[nombre]] <- list(nombre = nombre, modelo = modelo ,pred = pred , prob = prob, mc = mc)
modelos2$qda$n <- modelos2$qda$n + 1
modelos2$qda$mcs[modelos2$qda$n] <- general.indexes(mc = mc)
if(modelos2$qda$n > 9)
modelos2$qda$n <- 0
})
nombre.modelo$x <- nombre
print(modelo)
},error = function(e){
return(invisible(""))
})
})
#Tabla de la predicción
output$qdaPrediTable <- DT::renderDataTable({
test <- updateData$datos.prueba
var <- updateData$variable.predecir
idioma <- codedioma$idioma
obj.predic(modelos$qda[[nombre.modelo$x]]$pred,idioma = idioma, test, var)
},server = FALSE)
#Texto de la Matríz de Confusión
output$txtqdaMC <- renderPrint({
print(modelos$qda[[nombre.modelo$x]]$mc)
})
#Gráfico de la Matríz de Confusión
output$plot_qda_mc <- renderPlot({
idioma <- codedioma$idioma
exe(plot_MC_code(idioma = idioma))
plot.MC(modelos$qda[[nombre.modelo$x]]$mc)
})
#Tabla de Indices por Categoría
output$qdaIndPrecTable <- shiny::renderTable({
idioma <- codedioma$idioma
indices.qda <- indices.generales(modelos$qda[[nombre.modelo$x]]$mc)
xtable(indices.prec.table(indices.qda,"qda", idioma = idioma))
}, spacing = "xs",bordered = T, width = "100%", align = "c", digits = 2)
#Tabla de Errores por Categoría
output$qdaIndErrTable <- shiny::renderTable({
idioma <- codedioma$idioma
indices.qda <- indices.generales(modelos$qda[[nombre.modelo$x]]$mc)
#Gráfico de Error y Precisión Global
output$qdaPrecGlob <- renderEcharts4r(e_global_gauge(round(indices.qda[[1]],2), tr("precG",idioma), "#B5E391", "#90C468"))
output$qdaErrorGlob <- renderEcharts4r(e_global_gauge(round(indices.qda[[2]],2), tr("errG",idioma), "#E39191", "#C46868"))
xtable(indices.error.table(indices.qda,"qda"))
}, spacing = "xs",bordered = T, width = "100%", align = "c", digits = 2)
# Genera la probabilidad de corte
output$txtqdaprob <- renderPrint({
input$runProb
tryCatch({
test <- updateData$datos.prueba
variable <- updateData$variable.predecir
choices <- levels(test[, variable])
category <- isolate(input$cat.sel.prob)
paso <- isolate(input$by.prob)
prediccion <- modelos$qda[[nombre.modelo$x]]$prob
Score <- prediccion$prediction[,category]
Clase <- test[,variable]
prob.values(Score, Clase, choices, category, paso)
},error = function(e){
if(length(choices) != 2){
showNotification(paste0("ERROR Probabilidad de Corte: ", tr("errorprobC", codedioma$idioma)), type = "error")
}else{
showNotification(paste0("ERROR: ", e), type = "error")
}
return(invisible(""))
})
})
# Genera la probabilidad de corte
output$txtqdaprobInd <- renderPrint({
input$runProbInd
tryCatch({
test <- updateData$datos.prueba
variable <- updateData$variable.predecir
choices <- levels(test[, variable])
category <- isolate(input$cat_probC)
corte <- isolate(input$val_probC)
prediccion <- modelos$qda[[nombre.modelo$x]]$prob
Score <- prediccion$prediction[,category]
Clase <- test[,variable]
if(!is.null(Score) & length(choices) == 2){
results <- prob.values.ind(Score, Clase, choices, category, corte)
modelos$qda[[nombre.modelo$x]]$mc <- results$MC
modelos$qda[[nombre.modelo$x]]$pred <- results$Prediccion
}
},error = function(e){
if(length(choices) != 2){
showNotification(paste0("ERROR Probabilidad de Corte: ", tr("errorprobC", codedioma$idioma)), type = "error")
}else{
showNotification(paste0("ERROR: ", e), type = "error")
}
return(invisible(""))
})
})
#Código por defecto de qda
default.codigo.qda <- function() {
#Modelo
codigo <- codigo.modelo("qda", updateData$variable.predecir)
cod <- paste0("### adc\n",codigo)
#Predicción
codigo <- codigo.prediccion("qda")
cod <- paste0(cod,codigo)
#Matríz de Confusión
codigo <- codigo.MC("qda")
cod <- paste0(cod,codigo)
#Indices generales
codigo <- extract.code("indices.generales")
codigo <- paste0(codigo,"\nindices.generales(MC.qda)\n")
cod <- paste0(cod,codigo)
isolate(codedioma$code <- append(codedioma$code, cod))
}
}
## To be copied in the UI
# mod_qda_ui("qda_ui_1")
## To be copied in the server
# callModule(mod_qda_server, "qda_ui_1")
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