R/parseFuns.R

In rxode2: Facilities for Simulating from ODE-Based Models

.parseEnv$.parseFuns <- c("gammafn", "lgammafn", "lgamma", "loggamma", "digamma", "trigamma", 
"tetragamma", "pentagamma", "cospi", "sinpi", "tanpi", "log1p", 
"expm1", "factorial", "lfactorial", "lgamma1p", "log10", "log2", 
"log1pexp", "phi", "pnorm", "normcdf", "qnorm", "fabs", "pow", 
"R_pow", "R_pow_di", "Rx_pow_di", "Rx_pow", "lbeta", "abs", "acos", 
"acosh", "asin", "asinh", "atan", "atan2", "atanh", "beta", "cos", 
"cosh", "erf", "erfc", "exp", "gamma", "linCmtA", "linCmtC", 
"linCmtB", "log", "polygamma", "rxTBS", "rxTBSi", "rxTBSd", "rxTBSd2", 
"sin", "sinh", "sqrt", "tan", "tanh", "gammap", "floor", "round", 
"ceil", "trunc", "bessel_i", "bessel_j", "bessel_k", "bessel_y", 
"logspace_add", "logspace_sub", "fmax2", "fmin2", "sign", "fsign", 
"fprec", "fround", "ftrunc", "transit", "gammaq", "gammapDer", 
"gammapInv", "gammapInva", "gammaqInv", "gammaqInva", "lowergamma", 
"uppergamma", "max", "min", "logit", "expit", "probit", "probitInv", 
"tlast", "tfirst", "lag", "lead", "dose", "podo", "dabs", "dabs2", 
"abs1", "dabs1", "erfinv", "abs0", "dosenum", "first", "last", 
"diff", "is.nan", "is.na", "is.finite", "is.infinite", "llikPois", 
"llikPoisDlambda", "llikBinom", "llikBinomDprob", "llikNbinom", 
"llikNbinomDprob", "llikNbinomMu", "llikNbinomMuDmu", "llikBeta", 
"llikBetaDshape1", "llikBetaDshape2", "llikT", "llikTDdf", "llikTDmean", 
"llikTDsd", "llikChisq", "llikChisqDdf", "llikExp", "llikExpDrate", 
"llikF", "llikFDdf1", "llikFDdf2", "llikGeom", "llikGeomDprob", 
"llikUnif", "llikUnifDalpha", "llikUnifDbeta", "llikWeibull", 
"llikWeibullDshape", "llikWeibullDscale", "llikGamma", "llikGammaDshape", 
"llikGammaDrate", "llikCauchy", "llikCauchyDlocation", "llikCauchyDscale", 
"llikNorm", "llikNormDmean", "llikNormDsd", "llikXPois", "llikXPoisDlambda", 
"llikXBinom", "llikXBinomDprob", "llikXNbinomMu", "llikXNbinomMuDmu", 
"llikXNbinom", "llikXNbinomDprob", "llikXBeta", "llikXBetaDshape1", 
"llikXBetaDshape2", "llikXT", "llikXTDdf", "llikXTDmean", "llikXTDsd", 
"llikXChisq", "llikXChisqDdf", "llikXExp", "llikXExpDrate", "llikXF", 
"llikXFDdf1", "llikXFDdf2", "llikXGeom", "llikXGeomDprob", "llikXUnif", 
"llikXUnifDalpha", "llikXUnifDbeta", "llikXWeibull", "llikXWeibullDshape", 
"llikXWeibullDscale", "llikXGamma", "llikXGammaDshape", "llikXGammaDrate", 
"llikXCauchy", "llikXCauchyDlocation", "llikXCauchyDscale", "llikXNorm", 
"llikXNormDmean", "llikXNormDsd", "linCmt", "rnorm", "rxnorm", 
"rxbinom", "rbinom", "rxcauchy", "rcauchy", "rchisq", "rxchisq", 
"rexp", "rxexp", "rbeta", "rxbeta", "rgeom", "rxgeom", "rxpois", 
"rpois", "rxt", "rt")
.parseEnv$.parseNum <- c(lgamma = 1, abs = 1, acos = 1, acosh = 1, asin = 1, asinh = 1, 
atan = 1, atan2 = 2, atanh = 1, beta = 2, cos = 1, cosh = 1, 
erf = 1, erfc = 1, exp = 1, gamma = 1, linCmtA = 20, linCmtC = 20, 
linCmtB = 21, log = 1, polygamma = 2, rxTBS = 5, rxTBSi = 5, 
rxTBSd = 5, rxTBSd2 = 5, sin = 1, sinh = 1, sqrt = 1, tan = 1, 
tanh = 1, gammap = 2, floor = 1, round = 1, ceil = 1, trunc = 1, 
bessel_i = 3, bessel_j = 2, bessel_k = 3, bessel_y = 2, logspace_add = 2, 
logspace_sub = 2, fmax2 = 2, fmin2 = 2, sign = 1, fsign = 2, 
fprec = 2, fround = 2, ftrunc = 2, transit = NA, gammaq = 2, 
gammapDer = 2, gammapInv = 2, gammapInva = 2, gammaqInv = 2, 
gammaqInva = 2, lowergamma = 2, uppergamma = 2, max = NA, min = NA, 
logit = NA, expit = NA, probit = NA, probitInv = NA, tlast = NA, 
tfirst = NA, lag = NA, lead = NA, dose = NA, podo = NA, dabs = 1, 
dabs2 = 1, abs1 = 1, dabs1 = 1, erfinv = 1, abs0 = 1, dosenum = 0, 
first = 1, last = 1, diff = 1, is.nan = 1, is.na = 1, is.finite = 1, 
is.infinite = 1, llikPois = 2, llikPoisDlambda = 2, llikBinom = 3, 
llikBinomDprob = 3, llikNbinom = 3, llikNbinomDprob = 3, llikNbinomMu = 3, 
llikNbinomMuDmu = 3, llikBeta = 3, llikBetaDshape1 = 3, llikBetaDshape2 = 3, 
llikT = 4, llikTDdf = 4, llikTDmean = 4, llikTDsd = 4, llikChisq = 2, 
llikChisqDdf = 2, llikExp = 2, llikExpDrate = 2, llikF = 3, llikFDdf1 = 3, 
llikFDdf2 = 3, llikGeom = 2, llikGeomDprob = 2, llikUnif = 3, 
llikUnifDalpha = 3, llikUnifDbeta = 3, llikWeibull = 3, llikWeibullDshape = 3, 
llikWeibullDscale = 3, llikGamma = 3, llikGammaDshape = 3, llikGammaDrate = 3, 
llikCauchy = 3, llikCauchyDlocation = 3, llikCauchyDscale = 3, 
llikNorm = 3, llikNormDmean = 3, llikNormDsd = 3, llikXPois = 3, 
llikXPoisDlambda = 3, llikXBinom = 4, llikXBinomDprob = 4, llikXNbinomMu = 4, 
llikXNbinomMuDmu = 4, llikXNbinom = 4, llikXNbinomDprob = 4, 
llikXBeta = 4, llikXBetaDshape1 = 4, llikXBetaDshape2 = 4, llikXT = 5, 
llikXTDdf = 5, llikXTDmean = 5, llikXTDsd = 5, llikXChisq = 3, 
llikXChisqDdf = 3, llikXExp = 3, llikXExpDrate = 3, llikXF = 4, 
llikXFDdf1 = 4, llikXFDdf2 = 4, llikXGeom = 3, llikXGeomDprob = 3, 
llikXUnif = 4, llikXUnifDalpha = 4, llikXUnifDbeta = 4, llikXWeibull = 4, 
llikXWeibullDshape = 4, llikXWeibullDscale = 4, llikXGamma = 4, 
llikXGammaDshape = 4, llikXGammaDrate = 4, llikXCauchy = 4, llikXCauchyDlocation = 4, 
llikXCauchyDscale = 4, llikXNorm = 4, llikXNormDmean = 4, llikXNormDsd = 4
)