Files in robinweide/tagmeppr
A computational pipeline to map tagmap-insertions
.Rbuildignore
.gitignore
.travis.yml
DESCRIPTION
LICENSE
NAMESPACE
NEWS.md
R/align.R
R/checkPrimer.R
R/data.R
R/findInsertions.R
R/makeIndex.R
R/methods.R
R/newTagMeppr.R
R/plotInsertions.R
R/plotSite.R
R/testData.R
R/utils.R
README.md
data-raw/PiggyBacITRs.R
data-raw/SleepingBeautyITRs.R
data/PiggyBacITRs.RData
data/SleepingBeautyITRs.RData
man/PiggyBacITRs.Rd
man/SleepingBeautyITRs.Rd
man/align.Rd
man/checkPrimer.Rd
man/findInsertions.Rd
man/loadIndex.Rd
man/makeIndex.Rd
man/newTagMeppr.Rd
man/plotInsertions.Rd
man/plotSite.Rd
man/print.tagMepprIndex.Rd
man/print.tagMepprSample.Rd
man/results.Rd
man/runIDgen.Rd
man/tagMepprCol.Rd
tagMeppr.Rproj
vignettes/.gitignore
vignettes/TM.pdf
vignettes/TM.png
vignettes/logo_tagMeppr.pdf
vignettes/logo_tagMeppr.png
vignettes/tagmentation-based-mapping-(tagmap)-of-mobile-dna-genomic-insertion-sites.bib
vignettes/tagmeppr.Rmd
vignettes/tagmeppr.pdf
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PI-1.pdf
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PI-1.png
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PImult1-1.pdf
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PImult1-1.png
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PImult1o-1.pdf
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PImult1o-1.png
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PImult2-1.pdf
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PImult2-1.png
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PIo-1.pdf
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PIo-1.png
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PLOTsingle-1.pdf
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PLOTsingle-1.png
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PLOTsingle100-1.pdf
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PLOTsingle100-1.png
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PLOTsinglenoDedup-1.pdf
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/PLOTsinglenoDedup-1.png
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/sing-1.pdf
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/sing-1.png
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/unnamed-chunk-6-1.pdf
vignettes/tagmeppr_files/figure-latex/unnamed-chunk-7-1.pdf
vignettes/xkcd.ttf
