R/999.DEPRECATED.R

In aroma.affymetrix: Analysis of Large Affymetrix Microarray Data Sets

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# DEFUNCT
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# - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - - -
# DEPRECATED
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# TODO, but still used alot internally.
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setMethodS3("getData", "AffymetrixCelFile", function(this, ...) {
##  .Deprecated("readRawData")
  readRawData(this, ...)
}, protected=TRUE, deprecated=TRUE)


setMethodS3("nbrOfArrays", "AffymetrixCelSet", function(this, ...) {
##  .Deprecated("length")
  length(this, ...)
}, protected=TRUE)

setMethodS3("nbrOfArrays", "AffymetrixCnChpSet", function(this, ...) {
##  .Deprecated("length")
  length(this, ...)
}, protected=TRUE)

setMethodS3("nbrOfArrays", "CnagCfhSet", function(this, ...) {
##  .Deprecated("length")
  length(this, ...)
}, protected=TRUE)

setMethodS3("nbrOfArrays", "DChipDcpSet", function(this, ...) {
##  .Deprecated("length")
  length(this, ...)
}, protected=TRUE)