dataquieR: The 'dataquieR' package about Data Quality in Epidemiological...

In dataquieR: Data Quality in Epidemiological Research

The dataquieR package about Data Quality in Epidemiological Research

Description

For a quick start please read dq_report2 and maybe the vignettes or the package's website.

Options

This package features the following options():

• dataquieR.CONDITIONS_LEVEL_TRHESHOLD

• dataquieR.CONDITIONS_WITH_STACKTRACE

• dataquieR.ELEMENT_MISSMATCH_CHECKTYPE

• dataquieR.ERRORS_WITH_CALLER

• dataquieR.GAM_for_LOESS

• dataquieR.MAHALANOBIS_THRESHOLD

• dataquieR.MAX_LABEL_LEN

• dataquieR.MAX_LONG_LABEL_LEN

• dataquieR.MAX_VALUE_LABEL_LEN

• dataquieR.MESSAGES_WITH_CALLER

• dataquieR.MULTIVARIATE_OUTLIER_CHECK

• dataquieR.VALUE_LABELS_htmlescaped

• dataquieR.WARNINGS_WITH_CALLER

• dataquieR.acc_loess.exclude_constant_subgroups

• dataquieR.acc_loess.mark_time_points

• dataquieR.acc_loess.min_bw

• dataquieR.acc_loess.min_proportion

• dataquieR.acc_loess.plot_format

• dataquieR.acc_loess.plot_observations

• dataquieR.acc_margins_num

• dataquieR.acc_margins_sort

• dataquieR.acc_multivariate_outlier.scale

• dataquieR.col_con_con_empirical

• dataquieR.col_con_con_logical

• dataquieR.convert_to_list_for_lapply

• dataquieR.debug

• dataquieR.des_summary_hard_lim_remove

• dataquieR.dontwrapresults

• dataquieR.droplevels_ReportSummaryTable

• dataquieR.dt_adjust

• dataquieR.fix_column_type_on_read

• dataquieR.flip_mode

• dataquieR.force_item_specific_missing_codes

• dataquieR.force_label_col

• dataquieR.grading_formats

• dataquieR.grading_rulesets

• dataquieR.guess_character

• dataquieR.guess_missing_codes

• dataquieR.ignore_empty_vars

• dataquieR.lang

• dataquieR.lazy_plots

• dataquieR.lazy_plots_cache

• dataquieR.lazy_plots_gg_compatibility

• dataquieR.locale

• dataquieR.max_cat_resp_var_levels_in_plot

• dataquieR.max_group_var_levels_in_plot

• dataquieR.max_group_var_levels_with_violins

• dataquieR.min_obs_per_group_var_in_plot

• dataquieR.min_time_points_for_cat_resp_var

• dataquieR.non_disclosure

• dataquieR.old_factor_handling

• dataquieR.old_type_adjust

• dataquieR.precomputeStudyData

• dataquieR.print_block_load_factor

• dataquieR.resume_checkpoint

• dataquieR.resume_print

• dataquieR.scale_level_heuristics_control_binaryrecodelimit

• dataquieR.scale_level_heuristics_control_metriclevels

• dataquieR.study_data_cache_max

• dataquieR.study_data_cache_metrics

• dataquieR.study_data_cache_metrics_env

• dataquieR.study_data_cache_quick_fill

• dataquieR.study_data_colnames_case_sensitive

• dataquieR.testdebug

• dataquieR.traceback

• dataquieR.type_adjust_parallel

Author(s)

Maintainer: Stephan Struckmann [e-mail] (ORCID)

Authors:

• Elisa Kasbohm [e-mail] (ORCID)

• Elena Salogni [e-mail] (ORCID)

• Joany Marino [e-mail] (ORCID)

• Adrian Richter [e-mail] (ORCID)

• Carsten Oliver Schmidt [e-mail] (ORCID)

Other contributors:

• University Medicine Greifswald [copyright holder]

• German Research Foundation (DFG SCHM 2744/3-1, SCHM 2744/9-1, SCHM 2744/3-4) [funder]

• National Research Data Infrastructure for Personal Health Data: (NFDI 13/1) [funder]

• European Union’s Horizon 2020 programme (euCanSHare, grant agreement No. 825903) [funder]

References

• JOSS 2024

• JOSS 2021

• DQ_OBS data quality framework

See Also

Useful links:

• https://dataquality.qihs.uni-greifswald.de/

• Report bugs at https://gitlab.com/libreumg/dataquier/-/issues

Other options: dataquieR.CONDITIONS_LEVEL_TRHESHOLD, dataquieR.CONDITIONS_WITH_STACKTRACE, dataquieR.ELEMENT_MISSMATCH_CHECKTYPE, dataquieR.ERRORS_WITH_CALLER, dataquieR.GAM_for_LOESS, dataquieR.MAHALANOBIS_THRESHOLD, dataquieR.MAX_LABEL_LEN, dataquieR.MAX_LONG_LABEL_LEN, dataquieR.MAX_VALUE_LABEL_LEN, dataquieR.MESSAGES_WITH_CALLER, dataquieR.MULTIVARIATE_OUTLIER_CHECK, dataquieR.VALUE_LABELS_htmlescaped, dataquieR.WARNINGS_WITH_CALLER, dataquieR.acc_loess.exclude_constant_subgroups, dataquieR.acc_loess.mark_time_points, dataquieR.acc_loess.min_bw, dataquieR.acc_loess.min_proportion, dataquieR.acc_loess.plot_format, dataquieR.acc_loess.plot_observations, dataquieR.acc_margins_num, dataquieR.acc_margins_sort, dataquieR.acc_multivariate_outlier.scale, dataquieR.col_con_con_empirical, dataquieR.col_con_con_logical, dataquieR.convert_to_list_for_lapply, dataquieR.debug, dataquieR.des_summary_hard_lim_remove, dataquieR.dontwrapresults, dataquieR.droplevels_ReportSummaryTable, dataquieR.dt_adjust, dataquieR.fix_column_type_on_read, dataquieR.flip_mode, dataquieR.force_item_specific_missing_codes, dataquieR.force_label_col, dataquieR.grading_formats, dataquieR.grading_rulesets, dataquieR.guess_character, dataquieR.guess_missing_codes, dataquieR.ignore_empty_vars, dataquieR.lang, dataquieR.lazy_plots, dataquieR.lazy_plots_cache, dataquieR.lazy_plots_gg_compatibility, dataquieR.locale, dataquieR.max_cat_resp_var_levels_in_plot, dataquieR.max_group_var_levels_in_plot, dataquieR.max_group_var_levels_with_violins, dataquieR.min_obs_per_group_var_in_plot, dataquieR.min_time_points_for_cat_resp_var, dataquieR.non_disclosure, dataquieR.old_factor_handling, dataquieR.old_type_adjust, dataquieR.precomputeStudyData, dataquieR.print_block_load_factor, dataquieR.progress_fkt_default, dataquieR.progress_msg_fkt_default, dataquieR.resume_checkpoint, dataquieR.resume_print, dataquieR.scale_level_heuristics_control_binaryrecodelimit, dataquieR.scale_level_heuristics_control_metriclevels, dataquieR.study_data_cache_max, dataquieR.study_data_cache_metrics, dataquieR.study_data_cache_metrics_env, dataquieR.study_data_cache_quick_fill, dataquieR.study_data_colnames_case_sensitive, dataquieR.testdebug, dataquieR.traceback, dataquieR.type_adjust_parallel, progress_init_fkt

dataquieR documentation built on Jan. 8, 2026, 5:08 p.m.