calathea: Projection matrices for a tropical understory herb
In popbio: Construction and Analysis of Matrix Population Models
Description
Usage
Format
Source
References
Examples
Description
Projection matrices for a tropical understory herb (Calathea
ovandensis) for plots 1-4 in years 1982-1985 and the pooled matrix.
Matrices were constructed using a post-breeding census with 8 size classes:
seed, seedling, juvenile, pre-reproductive, and 4 reproductive classes
divided by leaf area.
Usage
1
Format
A list of 17 matrices ordered by plot then year, with the pooled
matrix last.
Source
Table 7 in Horvitz and Schemske (1995). The pooled matrix is from
Table 8.
References
Horvitz, C.C. and D.W. Schemske. 1995. Spatiotemporal variation
in demographic transitions of a tropical understory herb: Projection matrix
analysis. Ecological Monographs 65:155-192.
Examples
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
calathea
## Single matrix
calathea[[11]]
image2(calathea[[11]], text.cex = .8)
title(paste("Calathea", names(calathea[11])), line = 3)
## MEAN matrix (exclude pooled matrix)
mean(calathea[-17])
## all plot 1
calathea[1:4]
## all 1982 matrices
calathea[ grep("1982", names(calathea)) ]
# OR
# calathea[seq(1,16,4)]
# split(calathea, 1:4)[[1]]
## Growth rates -see Figure 7
x <- sapply(calathea[-17], lambda)
x <- matrix(x, nrow = 4, byrow = TRUE, dimnames = list(paste("plot", 1:4), 1982:1985))
x
matplot2(x, type = "b", ylab = "Growth rate", main = "Calathea growth rates")
Example output
$`plot1 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5670 0 0.8200 7.5000 16.8000 30.2 0 0
Sdlg 0.0314 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Juv 0.0016 0 0.4737 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Pre 0.0000 0 0.2632 0.4286 0.1250 0.0 0 0
Sm 0.0000 0 0.0526 0.3333 0.5938 0.0 0 0
Med 0.0000 0 0.0000 0.0952 0.2188 0.5 0 0
Lrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0625 0.5 0 0
Xlrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
$`plot1 1983`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5850 0.0000 0.0000 10.8000 19.4000 25.8 35.7000 0
Sdlg 0.0146 0.0351 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
Juv 0.0004 0.0702 0.4167 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
Pre 0.0000 0.0000 0.2500 0.3889 0.0370 0.0 0.0000 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.5556 0.7407 0.5 0.0000 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0556 0.2222 0.2 0.3333 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.3 0.6667 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
$`plot1 1984`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5580 0.0000 1.8 14.3000 20.7000 28.6 25.9 0
Sdlg 0.0408 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0 0.0 0
Juv 0.0012 0.0732 0.4 0.0000 0.0286 0.0 0.0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.2 0.2737 0.0857 0.0 0.0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.1 0.6364 0.4571 0.2 0.4 0
Med 0.0000 0.0000 0.0 0.0909 0.3143 0.3 0.2 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0857 0.5 0.4 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0 0.0 0
$`plot1 1985`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5480 0.0000 5.0 9.300 17.6000 31.4000 35.1 0
Sdlg 0.0513 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0000 0.0 0
Juv 0.0007 0.0156 0.4 0.250 0.0000 0.0000 0.0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.0 0.375 0.2500 0.0000 0.0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.2 0.375 0.6429 0.7500 0.7 0
Med 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0357 0.1875 0.1 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0625 0.2 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0000 0.0 0
$`plot2 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.2150 0.0000 2.8000 8.900 12.7000 20.3000 32.8000 0
Sdlg 0.3407 0.0088 0.0000 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0
Juv 0.0392 0.1150 0.3696 0.025 0.0541 0.0000 0.1667 0
Pre 0.0000 0.0000 0.1739 0.400 0.1351 0.1333 0.0000 1
Sm 0.0000 0.0000 0.1304 0.325 0.4865 0.4667 0.0000 0
Med 0.0000 0.0000 0.0217 0.050 0.1081 0.0667 0.1667 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.050 0.0000 0.2667 0.5000 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.0270 0.0000 0.1667 0
$`plot2 1983`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.485 0.0000 0.40 8.4000 12.4000 17.3000 18.4000 14.6
Sdlg 0.115 0.0098 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0
Juv 0.000 0.0727 0.29 0.0313 0.0000 0.0000 0.0000 0.0
Pre 0.000 0.0079 0.16 0.3438 0.1364 0.0000 0.0000 0.0
Sm 0.000 0.0000 0.03 0.5000 0.7045 0.7778 0.7778 1.0
Med 0.000 0.0000 0.00 0.0000 0.0455 0.2222 0.1111 0.0
Lrg 0.000 0.0000 0.00 0.0313 0.0227 0.0000 0.1111 0.0
Xlrg 0.000 0.0000 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0
$`plot2 1984`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.512 0.0000 0.0000 1.4000 3.6000 5.2 7.1000 0
Sdlg 0.087 0.0114 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
Juv 0.001 0.0727 0.4179 0.1351 0.0303 0.0 0.0000 0
Pre 0.000 0.0000 0.0896 0.5135 0.3182 0.0 0.0000 0
Sm 0.000 0.0000 0.0000 0.2703 0.5606 1.0 0.3333 0
Med 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0606 0.0 0.0000 0
Lrg 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0152 0.0 0.6667 0
Xlrg 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
$`plot2 1985`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5040 0.0000 0.6000 9.8000 17.6000 35.80 77.4000 0
Sdlg 0.0939 0.0417 0.0580 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0
Juv 0.0020 0.0536 0.4638 0.0870 0.0189 0.00 0.0000 0
Pre 0.0000 0.0000 0.1594 0.4130 0.1698 0.00 0.0000 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0290 0.4783 0.7736 0.50 0.0000 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0377 0.25 0.3333 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.25 0.3333 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0.3333 0
$`plot3 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.4580 0.0000 0.0000 28.6000 30.4000 45.0000 57.2000 72.4000
Sdlg 0.1378 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Juv 0.0041 0.0508 0.1875 0.0000 0.0385 0.0000 0.0000 0.0000
Pre 0.0000 0.0000 0.2500 0.1667 0.0385 0.0000 0.0000 0.0000
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.6667 0.3462 0.1429 0.0645 0.0000
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1923 0.1905 0.0000 0.0000
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1923 0.3333 0.5161 0.1667
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.1667 0.0769 0.2381 0.3871 0.8333
$`plot3 1983`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5710 0.0000 0.7000 2.9000 16.5000 13.5000 26.2000 39.30
Sdlg 0.0287 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00
Juv 0.0003 0.0097 0.1154 0.3333 0.0000 0.0000 0.0000 0.00
Pre 0.0000 0.0000 0.0769 0.5000 0.1111 0.3333 0.0345 0.00
Sm 0.0000 0.0000 0.0385 0.1667 0.7222 0.5556 0.3793 0.12
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1111 0.1111 0.3448 0.40
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1724 0.28
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.16
$`plot3 1984`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5500 0.0000 0.90 5.3000 11.3000 15.7000 16.4000 27.5000
Sdlg 0.0478 0.0148 0.05 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Juv 0.0021 0.0148 0.10 0.1429 0.1111 0.0417 0.0000 0.0000
Pre 0.0000 0.0000 0.05 0.1429 0.2222 0.2917 0.3636 0.0909
Sm 0.0000 0.0000 0.05 0.2857 0.4444 0.2500 0.3636 0.4545
Med 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.1111 0.3333 0.0909 0.2727
Lrg 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.0000 0.0417 0.1818 0.0909
Xlrg 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0909
$`plot3 1985`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5560 0.0000 4.2000 18.8000 36.6000 60.2000 83.80 116.6
Sdlg 0.0438 0.0351 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0.0
Juv 0.0002 0.0351 0.2500 0.0625 0.0000 0.0000 0.00 0.0
Pre 0.0000 0.0000 0.0833 0.2500 0.0455 0.0000 0.00 0.0
Sm 0.0000 0.0000 0.1667 0.5000 0.5000 0.0769 0.00 0.0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.1250 0.4091 0.6923 0.25 0.0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0455 0.0769 0.50 0.0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1538 0.25 1.0
$`plot4 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.3360 0.0000 0.0000 8.1 14.8000 17.0000 26.1000 0
Sdlg 0.2533 0.0000 0.0364 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Juv 0.0103 0.0435 0.3273 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Pre 0.0000 0.0000 0.0909 0.6 0.1818 0.1538 0.0000 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.4 0.7273 0.6154 0.3333 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.1538 0.6667 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
$`plot4 1983`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.4900 0.0000 0.0000 5.5000 11.0000 10.60 0 0
Sdlg 0.1087 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0 0
Juv 0.0013 0.0167 0.3793 0.0556 0.0000 0.00 0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.0069 0.5556 0.1739 0.25 0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.3889 0.7826 0.75 0 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0 0
$`plot4 1984`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.513 0.0000 0.0000 3.2000 7.2000 0 0 0
Sdlg 0.087 0.0242 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
Juv 0.000 0.0303 0.2222 0.1765 0.1071 0 0 0
Pre 0.000 0.0000 0.1667 0.4118 0.2500 0 0 0
Sm 0.000 0.0000 0.0000 0.2353 0.5357 0 0 0
Med 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
Lrg 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
Xlrg 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
$`plot4 1985`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5240 0.0000 0.0000 1.2000 10.5000 0 0 0
Sdlg 0.0751 0.0172 0.1333 0.0000 0.0000 0 0 0
Juv 0.0009 0.0000 0.1333 0.0588 0.0526 0 0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.1333 0.7647 0.4211 0 0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.0588 0.5263 0 0 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
$pooled
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.4983 0.0000 0.5935 7.1390 14.2715 24.6953 34.9027 40.5437
Sdlg 0.0973 0.0110 0.0191 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Juv 0.0041 0.0442 0.3378 0.0698 0.0251 0.0065 0.0085 0.0000
Pre 0.0000 0.0014 0.1355 0.4286 0.1736 0.0968 0.0427 0.0435
Sm 0.0000 0.0000 0.0363 0.3841 0.6025 0.4258 0.2991 0.2174
Med 0.0000 0.0000 0.0019 0.0254 0.1130 0.2387 0.1709 0.2826
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0095 0.0272 0.1548 0.3248 0.1957
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0032 0.0063 0.0452 0.1282 0.2391
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5500 0.0000 0.90 5.3000 11.3000 15.7000 16.4000 27.5000
Sdlg 0.0478 0.0148 0.05 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Juv 0.0021 0.0148 0.10 0.1429 0.1111 0.0417 0.0000 0.0000
Pre 0.0000 0.0000 0.05 0.1429 0.2222 0.2917 0.3636 0.0909
Sm 0.0000 0.0000 0.05 0.2857 0.4444 0.2500 0.3636 0.4545
Med 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.1111 0.3333 0.0909 0.2727
Lrg 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.0000 0.0417 0.1818 0.0909
Xlrg 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0909
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med
Sd 0.49825000 0.00000000 1.07625000 9.00000000 16.19375000 22.28750000
Sdlg 0.09730625 0.01238125 0.01735625 0.00000000 0.00000000 0.00000000
Juv 0.00408125 0.04211875 0.30916875 0.08487500 0.02757500 0.00260625
Pre 0.00000000 0.00049375 0.13463125 0.40801250 0.16883125 0.07263125
Sm 0.00000000 0.00000000 0.04982500 0.38600000 0.59652500 0.41158125
Med 0.00000000 0.00000000 0.00135625 0.02604375 0.11665625 0.20046250
Lrg 0.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00508125 0.02649375 0.14569375
Xlrg 0.00000000 0.00000000 0.00000000 0.01041875 0.00649375 0.02449375
Lrg Xlrg
Sd 27.63125000 16.90000000
Sdlg 0.00000000 0.00000000
Juv 0.01041875 0.00000000
Pre 0.02488125 0.06818125
Sm 0.20948750 0.09840625
Med 0.16230000 0.04204375
Lrg 0.26550625 0.03360000
Xlrg 0.07106875 0.13026250
$`plot1 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5670 0 0.8200 7.5000 16.8000 30.2 0 0
Sdlg 0.0314 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Juv 0.0016 0 0.4737 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Pre 0.0000 0 0.2632 0.4286 0.1250 0.0 0 0
Sm 0.0000 0 0.0526 0.3333 0.5938 0.0 0 0
Med 0.0000 0 0.0000 0.0952 0.2188 0.5 0 0
Lrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0625 0.5 0 0
Xlrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
$`plot1 1983`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5850 0.0000 0.0000 10.8000 19.4000 25.8 35.7000 0
Sdlg 0.0146 0.0351 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
Juv 0.0004 0.0702 0.4167 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
Pre 0.0000 0.0000 0.2500 0.3889 0.0370 0.0 0.0000 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.5556 0.7407 0.5 0.0000 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0556 0.2222 0.2 0.3333 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.3 0.6667 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
$`plot1 1984`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5580 0.0000 1.8 14.3000 20.7000 28.6 25.9 0
Sdlg 0.0408 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0 0.0 0
Juv 0.0012 0.0732 0.4 0.0000 0.0286 0.0 0.0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.2 0.2737 0.0857 0.0 0.0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.1 0.6364 0.4571 0.2 0.4 0
Med 0.0000 0.0000 0.0 0.0909 0.3143 0.3 0.2 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0857 0.5 0.4 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0 0.0 0
$`plot1 1985`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5480 0.0000 5.0 9.300 17.6000 31.4000 35.1 0
Sdlg 0.0513 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0000 0.0 0
Juv 0.0007 0.0156 0.4 0.250 0.0000 0.0000 0.0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.0 0.375 0.2500 0.0000 0.0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.2 0.375 0.6429 0.7500 0.7 0
Med 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0357 0.1875 0.1 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0625 0.2 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0000 0.0 0
$`plot1 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5670 0 0.8200 7.5000 16.8000 30.2 0 0
Sdlg 0.0314 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Juv 0.0016 0 0.4737 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Pre 0.0000 0 0.2632 0.4286 0.1250 0.0 0 0
Sm 0.0000 0 0.0526 0.3333 0.5938 0.0 0 0
Med 0.0000 0 0.0000 0.0952 0.2188 0.5 0 0
Lrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0625 0.5 0 0
Xlrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
$`plot2 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.2150 0.0000 2.8000 8.900 12.7000 20.3000 32.8000 0
Sdlg 0.3407 0.0088 0.0000 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0
Juv 0.0392 0.1150 0.3696 0.025 0.0541 0.0000 0.1667 0
Pre 0.0000 0.0000 0.1739 0.400 0.1351 0.1333 0.0000 1
Sm 0.0000 0.0000 0.1304 0.325 0.4865 0.4667 0.0000 0
Med 0.0000 0.0000 0.0217 0.050 0.1081 0.0667 0.1667 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.050 0.0000 0.2667 0.5000 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.0270 0.0000 0.1667 0
$`plot3 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.4580 0.0000 0.0000 28.6000 30.4000 45.0000 57.2000 72.4000
Sdlg 0.1378 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Juv 0.0041 0.0508 0.1875 0.0000 0.0385 0.0000 0.0000 0.0000
Pre 0.0000 0.0000 0.2500 0.1667 0.0385 0.0000 0.0000 0.0000
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.6667 0.3462 0.1429 0.0645 0.0000
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1923 0.1905 0.0000 0.0000
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1923 0.3333 0.5161 0.1667
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.1667 0.0769 0.2381 0.3871 0.8333
$`plot4 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.3360 0.0000 0.0000 8.1 14.8000 17.0000 26.1000 0
Sdlg 0.2533 0.0000 0.0364 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Juv 0.0103 0.0435 0.3273 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Pre 0.0000 0.0000 0.0909 0.6 0.1818 0.1538 0.0000 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.4 0.7273 0.6154 0.3333 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.1538 0.6667 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
1982 1983 1984 1985
plot 1 0.8594069 1.0301461 1.0659012 0.9317363
plot 2 1.2477338 0.9864686 0.9042326 1.0379192
plot 3 1.1571680 0.8877019 0.7356622 1.0795589
plot 4 0.9986718 0.9538090 0.7783927 0.8543452
popbio documentation built on March 26, 2020, 8:44 p.m.
R Package Documentation
Browse R Packages
We want your feedback!
Note that we can't provide technical support on individual packages. You should contact the package authors for that.
Description Usage Format Source References Examples
Description
Projection matrices for a tropical understory herb (Calathea ovandensis) for plots 1-4 in years 1982-1985 and the pooled matrix. Matrices were constructed using a post-breeding census with 8 size classes: seed, seedling, juvenile, pre-reproductive, and 4 reproductive classes divided by leaf area.
Usage
1 |
Format
A list of 17 matrices ordered by plot then year, with the pooled matrix last.
Source
Table 7 in Horvitz and Schemske (1995). The pooled matrix is from Table 8.
References
Horvitz, C.C. and D.W. Schemske. 1995. Spatiotemporal variation in demographic transitions of a tropical understory herb: Projection matrix analysis. Ecological Monographs 65:155-192.
Examples
1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 | calathea
## Single matrix
calathea[[11]]
image2(calathea[[11]], text.cex = .8)
title(paste("Calathea", names(calathea[11])), line = 3)
## MEAN matrix (exclude pooled matrix)
mean(calathea[-17])
## all plot 1
calathea[1:4]
## all 1982 matrices
calathea[ grep("1982", names(calathea)) ]
# OR
# calathea[seq(1,16,4)]
# split(calathea, 1:4)[[1]]
## Growth rates -see Figure 7
x <- sapply(calathea[-17], lambda)
x <- matrix(x, nrow = 4, byrow = TRUE, dimnames = list(paste("plot", 1:4), 1982:1985))
x
matplot2(x, type = "b", ylab = "Growth rate", main = "Calathea growth rates")
|
Example output
$`plot1 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5670 0 0.8200 7.5000 16.8000 30.2 0 0
Sdlg 0.0314 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Juv 0.0016 0 0.4737 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Pre 0.0000 0 0.2632 0.4286 0.1250 0.0 0 0
Sm 0.0000 0 0.0526 0.3333 0.5938 0.0 0 0
Med 0.0000 0 0.0000 0.0952 0.2188 0.5 0 0
Lrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0625 0.5 0 0
Xlrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
$`plot1 1983`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5850 0.0000 0.0000 10.8000 19.4000 25.8 35.7000 0
Sdlg 0.0146 0.0351 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
Juv 0.0004 0.0702 0.4167 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
Pre 0.0000 0.0000 0.2500 0.3889 0.0370 0.0 0.0000 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.5556 0.7407 0.5 0.0000 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0556 0.2222 0.2 0.3333 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.3 0.6667 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
$`plot1 1984`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5580 0.0000 1.8 14.3000 20.7000 28.6 25.9 0
Sdlg 0.0408 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0 0.0 0
Juv 0.0012 0.0732 0.4 0.0000 0.0286 0.0 0.0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.2 0.2737 0.0857 0.0 0.0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.1 0.6364 0.4571 0.2 0.4 0
Med 0.0000 0.0000 0.0 0.0909 0.3143 0.3 0.2 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0857 0.5 0.4 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0 0.0 0
$`plot1 1985`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5480 0.0000 5.0 9.300 17.6000 31.4000 35.1 0
Sdlg 0.0513 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0000 0.0 0
Juv 0.0007 0.0156 0.4 0.250 0.0000 0.0000 0.0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.0 0.375 0.2500 0.0000 0.0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.2 0.375 0.6429 0.7500 0.7 0
Med 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0357 0.1875 0.1 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0625 0.2 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0000 0.0 0
$`plot2 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.2150 0.0000 2.8000 8.900 12.7000 20.3000 32.8000 0
Sdlg 0.3407 0.0088 0.0000 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0
Juv 0.0392 0.1150 0.3696 0.025 0.0541 0.0000 0.1667 0
Pre 0.0000 0.0000 0.1739 0.400 0.1351 0.1333 0.0000 1
Sm 0.0000 0.0000 0.1304 0.325 0.4865 0.4667 0.0000 0
Med 0.0000 0.0000 0.0217 0.050 0.1081 0.0667 0.1667 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.050 0.0000 0.2667 0.5000 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.0270 0.0000 0.1667 0
$`plot2 1983`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.485 0.0000 0.40 8.4000 12.4000 17.3000 18.4000 14.6
Sdlg 0.115 0.0098 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0
Juv 0.000 0.0727 0.29 0.0313 0.0000 0.0000 0.0000 0.0
Pre 0.000 0.0079 0.16 0.3438 0.1364 0.0000 0.0000 0.0
Sm 0.000 0.0000 0.03 0.5000 0.7045 0.7778 0.7778 1.0
Med 0.000 0.0000 0.00 0.0000 0.0455 0.2222 0.1111 0.0
Lrg 0.000 0.0000 0.00 0.0313 0.0227 0.0000 0.1111 0.0
Xlrg 0.000 0.0000 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0
$`plot2 1984`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.512 0.0000 0.0000 1.4000 3.6000 5.2 7.1000 0
Sdlg 0.087 0.0114 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
Juv 0.001 0.0727 0.4179 0.1351 0.0303 0.0 0.0000 0
Pre 0.000 0.0000 0.0896 0.5135 0.3182 0.0 0.0000 0
Sm 0.000 0.0000 0.0000 0.2703 0.5606 1.0 0.3333 0
Med 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0606 0.0 0.0000 0
Lrg 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0152 0.0 0.6667 0
Xlrg 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
$`plot2 1985`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5040 0.0000 0.6000 9.8000 17.6000 35.80 77.4000 0
Sdlg 0.0939 0.0417 0.0580 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0
Juv 0.0020 0.0536 0.4638 0.0870 0.0189 0.00 0.0000 0
Pre 0.0000 0.0000 0.1594 0.4130 0.1698 0.00 0.0000 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0290 0.4783 0.7736 0.50 0.0000 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0377 0.25 0.3333 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.25 0.3333 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0.3333 0
$`plot3 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.4580 0.0000 0.0000 28.6000 30.4000 45.0000 57.2000 72.4000
Sdlg 0.1378 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Juv 0.0041 0.0508 0.1875 0.0000 0.0385 0.0000 0.0000 0.0000
Pre 0.0000 0.0000 0.2500 0.1667 0.0385 0.0000 0.0000 0.0000
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.6667 0.3462 0.1429 0.0645 0.0000
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1923 0.1905 0.0000 0.0000
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1923 0.3333 0.5161 0.1667
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.1667 0.0769 0.2381 0.3871 0.8333
$`plot3 1983`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5710 0.0000 0.7000 2.9000 16.5000 13.5000 26.2000 39.30
Sdlg 0.0287 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00
Juv 0.0003 0.0097 0.1154 0.3333 0.0000 0.0000 0.0000 0.00
Pre 0.0000 0.0000 0.0769 0.5000 0.1111 0.3333 0.0345 0.00
Sm 0.0000 0.0000 0.0385 0.1667 0.7222 0.5556 0.3793 0.12
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1111 0.1111 0.3448 0.40
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1724 0.28
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.16
$`plot3 1984`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5500 0.0000 0.90 5.3000 11.3000 15.7000 16.4000 27.5000
Sdlg 0.0478 0.0148 0.05 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Juv 0.0021 0.0148 0.10 0.1429 0.1111 0.0417 0.0000 0.0000
Pre 0.0000 0.0000 0.05 0.1429 0.2222 0.2917 0.3636 0.0909
Sm 0.0000 0.0000 0.05 0.2857 0.4444 0.2500 0.3636 0.4545
Med 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.1111 0.3333 0.0909 0.2727
Lrg 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.0000 0.0417 0.1818 0.0909
Xlrg 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0909
$`plot3 1985`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5560 0.0000 4.2000 18.8000 36.6000 60.2000 83.80 116.6
Sdlg 0.0438 0.0351 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0.0
Juv 0.0002 0.0351 0.2500 0.0625 0.0000 0.0000 0.00 0.0
Pre 0.0000 0.0000 0.0833 0.2500 0.0455 0.0000 0.00 0.0
Sm 0.0000 0.0000 0.1667 0.5000 0.5000 0.0769 0.00 0.0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.1250 0.4091 0.6923 0.25 0.0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0455 0.0769 0.50 0.0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1538 0.25 1.0
$`plot4 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.3360 0.0000 0.0000 8.1 14.8000 17.0000 26.1000 0
Sdlg 0.2533 0.0000 0.0364 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Juv 0.0103 0.0435 0.3273 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Pre 0.0000 0.0000 0.0909 0.6 0.1818 0.1538 0.0000 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.4 0.7273 0.6154 0.3333 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.1538 0.6667 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
$`plot4 1983`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.4900 0.0000 0.0000 5.5000 11.0000 10.60 0 0
Sdlg 0.1087 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0 0
Juv 0.0013 0.0167 0.3793 0.0556 0.0000 0.00 0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.0069 0.5556 0.1739 0.25 0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.3889 0.7826 0.75 0 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.00 0 0
$`plot4 1984`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.513 0.0000 0.0000 3.2000 7.2000 0 0 0
Sdlg 0.087 0.0242 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
Juv 0.000 0.0303 0.2222 0.1765 0.1071 0 0 0
Pre 0.000 0.0000 0.1667 0.4118 0.2500 0 0 0
Sm 0.000 0.0000 0.0000 0.2353 0.5357 0 0 0
Med 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
Lrg 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
Xlrg 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
$`plot4 1985`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5240 0.0000 0.0000 1.2000 10.5000 0 0 0
Sdlg 0.0751 0.0172 0.1333 0.0000 0.0000 0 0 0
Juv 0.0009 0.0000 0.1333 0.0588 0.0526 0 0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.1333 0.7647 0.4211 0 0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.0588 0.5263 0 0 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0 0 0
$pooled
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.4983 0.0000 0.5935 7.1390 14.2715 24.6953 34.9027 40.5437
Sdlg 0.0973 0.0110 0.0191 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Juv 0.0041 0.0442 0.3378 0.0698 0.0251 0.0065 0.0085 0.0000
Pre 0.0000 0.0014 0.1355 0.4286 0.1736 0.0968 0.0427 0.0435
Sm 0.0000 0.0000 0.0363 0.3841 0.6025 0.4258 0.2991 0.2174
Med 0.0000 0.0000 0.0019 0.0254 0.1130 0.2387 0.1709 0.2826
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0095 0.0272 0.1548 0.3248 0.1957
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0032 0.0063 0.0452 0.1282 0.2391
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5500 0.0000 0.90 5.3000 11.3000 15.7000 16.4000 27.5000
Sdlg 0.0478 0.0148 0.05 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Juv 0.0021 0.0148 0.10 0.1429 0.1111 0.0417 0.0000 0.0000
Pre 0.0000 0.0000 0.05 0.1429 0.2222 0.2917 0.3636 0.0909
Sm 0.0000 0.0000 0.05 0.2857 0.4444 0.2500 0.3636 0.4545
Med 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.1111 0.3333 0.0909 0.2727
Lrg 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.0000 0.0417 0.1818 0.0909
Xlrg 0.0000 0.0000 0.00 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0909
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med
Sd 0.49825000 0.00000000 1.07625000 9.00000000 16.19375000 22.28750000
Sdlg 0.09730625 0.01238125 0.01735625 0.00000000 0.00000000 0.00000000
Juv 0.00408125 0.04211875 0.30916875 0.08487500 0.02757500 0.00260625
Pre 0.00000000 0.00049375 0.13463125 0.40801250 0.16883125 0.07263125
Sm 0.00000000 0.00000000 0.04982500 0.38600000 0.59652500 0.41158125
Med 0.00000000 0.00000000 0.00135625 0.02604375 0.11665625 0.20046250
Lrg 0.00000000 0.00000000 0.00000000 0.00508125 0.02649375 0.14569375
Xlrg 0.00000000 0.00000000 0.00000000 0.01041875 0.00649375 0.02449375
Lrg Xlrg
Sd 27.63125000 16.90000000
Sdlg 0.00000000 0.00000000
Juv 0.01041875 0.00000000
Pre 0.02488125 0.06818125
Sm 0.20948750 0.09840625
Med 0.16230000 0.04204375
Lrg 0.26550625 0.03360000
Xlrg 0.07106875 0.13026250
$`plot1 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5670 0 0.8200 7.5000 16.8000 30.2 0 0
Sdlg 0.0314 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Juv 0.0016 0 0.4737 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Pre 0.0000 0 0.2632 0.4286 0.1250 0.0 0 0
Sm 0.0000 0 0.0526 0.3333 0.5938 0.0 0 0
Med 0.0000 0 0.0000 0.0952 0.2188 0.5 0 0
Lrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0625 0.5 0 0
Xlrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
$`plot1 1983`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5850 0.0000 0.0000 10.8000 19.4000 25.8 35.7000 0
Sdlg 0.0146 0.0351 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
Juv 0.0004 0.0702 0.4167 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
Pre 0.0000 0.0000 0.2500 0.3889 0.0370 0.0 0.0000 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.5556 0.7407 0.5 0.0000 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0556 0.2222 0.2 0.3333 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.3 0.6667 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0
$`plot1 1984`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5580 0.0000 1.8 14.3000 20.7000 28.6 25.9 0
Sdlg 0.0408 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0 0.0 0
Juv 0.0012 0.0732 0.4 0.0000 0.0286 0.0 0.0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.2 0.2737 0.0857 0.0 0.0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.1 0.6364 0.4571 0.2 0.4 0
Med 0.0000 0.0000 0.0 0.0909 0.3143 0.3 0.2 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0857 0.5 0.4 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0 0.0 0
$`plot1 1985`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5480 0.0000 5.0 9.300 17.6000 31.4000 35.1 0
Sdlg 0.0513 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0000 0.0 0
Juv 0.0007 0.0156 0.4 0.250 0.0000 0.0000 0.0 0
Pre 0.0000 0.0000 0.0 0.375 0.2500 0.0000 0.0 0
Sm 0.0000 0.0000 0.2 0.375 0.6429 0.7500 0.7 0
Med 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0357 0.1875 0.1 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0625 0.2 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0 0.000 0.0000 0.0000 0.0 0
$`plot1 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.5670 0 0.8200 7.5000 16.8000 30.2 0 0
Sdlg 0.0314 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Juv 0.0016 0 0.4737 0.0000 0.0000 0.0 0 0
Pre 0.0000 0 0.2632 0.4286 0.1250 0.0 0 0
Sm 0.0000 0 0.0526 0.3333 0.5938 0.0 0 0
Med 0.0000 0 0.0000 0.0952 0.2188 0.5 0 0
Lrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0625 0.5 0 0
Xlrg 0.0000 0 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0 0
$`plot2 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.2150 0.0000 2.8000 8.900 12.7000 20.3000 32.8000 0
Sdlg 0.3407 0.0088 0.0000 0.000 0.0000 0.0000 0.0000 0
Juv 0.0392 0.1150 0.3696 0.025 0.0541 0.0000 0.1667 0
Pre 0.0000 0.0000 0.1739 0.400 0.1351 0.1333 0.0000 1
Sm 0.0000 0.0000 0.1304 0.325 0.4865 0.4667 0.0000 0
Med 0.0000 0.0000 0.0217 0.050 0.1081 0.0667 0.1667 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.050 0.0000 0.2667 0.5000 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.000 0.0270 0.0000 0.1667 0
$`plot3 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.4580 0.0000 0.0000 28.6000 30.4000 45.0000 57.2000 72.4000
Sdlg 0.1378 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000
Juv 0.0041 0.0508 0.1875 0.0000 0.0385 0.0000 0.0000 0.0000
Pre 0.0000 0.0000 0.2500 0.1667 0.0385 0.0000 0.0000 0.0000
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.6667 0.3462 0.1429 0.0645 0.0000
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1923 0.1905 0.0000 0.0000
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0000 0.1923 0.3333 0.5161 0.1667
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.1667 0.0769 0.2381 0.3871 0.8333
$`plot4 1982`
Sd Sdlg Juv Pre Sm Med Lrg Xlrg
Sd 0.3360 0.0000 0.0000 8.1 14.8000 17.0000 26.1000 0
Sdlg 0.2533 0.0000 0.0364 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Juv 0.0103 0.0435 0.3273 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Pre 0.0000 0.0000 0.0909 0.6 0.1818 0.1538 0.0000 0
Sm 0.0000 0.0000 0.0000 0.4 0.7273 0.6154 0.3333 0
Med 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.1538 0.6667 0
Lrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
Xlrg 0.0000 0.0000 0.0000 0.0 0.0000 0.0000 0.0000 0
1982 1983 1984 1985
plot 1 0.8594069 1.0301461 1.0659012 0.9317363
plot 2 1.2477338 0.9864686 0.9042326 1.0379192
plot 3 1.1571680 0.8877019 0.7356622 1.0795589
plot 4 0.9986718 0.9538090 0.7783927 0.8543452
R Package Documentation
Browse R Packages
We want your feedback!
Note that we can't provide technical support on individual packages. You should contact the package authors for that.
Embedding an R snippet on your website
Add the following code to your website.
For more information on customizing the embed code, read Embedding Snippets.