average_SR_mat: モデル平均的な再生産関係を与える

In ichimomo/frasyr: Fisheries Research Agency (FRA) provides the method for calculating sustainable yield (SY) with R

モデル平均的な再生産関係を与える

Description

モデル平均的な再生産関係を与える

Usage

average_SR_mat(
  res_vpa,
  res_SR_list,
  range_list = list(1:500, 501:1000),
  SR_mat,
  seed_number,
  start_random_rec_year_name,
  recruit_age,
  resid_type = "lognormal",
  resample_year_range = 0,
  regime_shift_option = NULL,
  recruit_intercept = 0,
  bias_correction = TRUE
)

Arguments

res_vpa	VPAの推定結果
res_SR_list	再生産関係の推定結果のリスト
SR_mat	将来予測用の再生産関係パラメータを格納する３次元行列
seed_number	シード番号
start_random_rec_year_name	ランダム加入を仮定する最初の年
resid_type	残差の発生パターン；対数正規分布は"lognormal"、単純リサンプリングは"resampling"
resample_year_range	0の場合、推定に使ったデータから計算される残差を用いる。年の範囲を入れると、対象とした年の範囲で計算される残差を用いる

ichimomo/frasyr documentation built on Dec. 11, 2023, 12:50 a.m.