bootSR.plot: 再生産関係の残差ブートストラップをプロットする関数

In ichimomo/frasyr: Fisheries Research Agency (FRA) provides the method for calculating sustainable yield (SY) with R

再生産関係の残差ブートストラップをプロットする関数

Description

ブートストラップによる各パラメータのヒストグラムと、それらパラメータをつかった再生産関係が描画される

Usage

bootSR.plot(
  boot.res,
  CI = 0.8,
  output = FALSE,
  filename = "boot",
  lwd = 1.2,
  pch = 1,
  ggplt = TRUE,
  ...
)

Arguments

boot.res	boot.SRのオブジェクト
CI	プロットする信頼区間
output	pngファイルに出力するか否か
filename	ファイル名

Details

ヒストグラムの描画ではとその中央値、上側・下側CIが（デフォルトのggplt=Tでは加えて平均値が）推定値とともに表示される

ヒストグラムのプロットにはggplotをつかうオプションggplt=TRUEをデフォルトにしているが、ggplotを使わない作図もggplt=Fで実行可能 　 ggplotで描画する場合でRstudio利用時にはplotをZoomで表示にしないと描画されないことがあるので注意

ichimomo/frasyr documentation built on Nov. 5, 2024, 3:06 p.m.