Description Usage Arguments Value Author(s) References See Also Examples
Plot of the dose response curves with each cell line presented in a panel.
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A.data |
The A.data object created by the function bgModel. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
diff.var |
Character indicating the variable used for separating the experiments for which the difference is to be calculated. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
drug |
The drug for which the difference should be calculated. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
type |
The summary statistic for which the difference is to be calculated. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
time |
The time point where the difference is to be calculated. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
names |
The names of the cell lines that are to plotted. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
dose.scale |
Character indicating the scale used for the summary statistcs. The unit is written as e.g. ug/ml to indicate micro grams per milli litre and defaults to
The current implementations for fractions are:
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
dose.logfun |
Character indicating if the concentrations should be log transformed. The possible inputs are | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
col |
Character vector of colours. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
reverse |
Logical indicater for whether or not the the number of plots per figure. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
las |
Logical indicater for whether or not the the number of plots per figure. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ylab |
Logical indicater for whether or not the the number of plots per figure. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
main |
Logical indicater for whether or not the the number of plots per figure. | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
... |
Further arguments passed on to the plot. |
plot of absorbance values plotted aginst time with the result of the G-model superimposed.
The function was written at department of haematology, Aalborg University Hospital and maintained by Steffen Falgreen.
Steffen Falgreen et al. Exposure time independent summary statistics for assessment of drug dependent cell line growth inhibition (2013)
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