do_caaboot_vpa: 年齢別漁獲尾数の不確実性評価の関数

In ichimomo/frasyr: Fisheries Research Agency (FRA) provides the method for calculating sustainable yield (SY) with R

年齢別漁獲尾数の不確実性評価の関数

Description

年齢別漁獲尾数を乱数で再生成した後、VPA計算を行う関数

Usage

do_caaboot_vpa(
  res,
  B_ite = 1000,
  B_cv = 0.2,
  ci_range = 0.95,
  ess = 200,
  detail = FALSE,
  ci_fill = "blue"
)

Arguments

res	VPAの結果のオブジェクト
B_ite	ブートストラップ計算の数。デフォルトで1000。
B_cv	乱数生成の変動係数。デフォルトは0.2。
ci_range	信頼区間の幅。デフォルトでは0.95（95％信頼区間）
ess	多項分布の乱数生成の有効サンプル数。デフォルトは200。
detail	TRUEの場合、個々のVPAの推定結果がリストで出力される
ci_fill	描画された信頼区間の色の指定。デフォルトは'"blue"'

Value

返ってくる値: plot 親魚重量、資源尾数、資源重量それぞれについて信頼区間のプロットが得られる。 caa_boot_sample 年齢別漁獲尾数のブートストラップ標本が得られる。 res_boot detail=TRUEの場合、個々のVPAの推定結果のリスト

Author(s)

濵邉昂平, 市野川桃子

See Also

https://ichimomo.github.io/frasyr/articles/Diagnostics-for-VPA.html

ichimomo/frasyr documentation built on Dec. 11, 2023, 12:50 a.m.