est_MSYRP: future_vpaを使ってMSY管理基準値などを計算するwrapper関数

In ichimomo/frasyr: Fisheries Research Agency (FRA) provides the method for calculating sustainable yield (SY) with R

future_vpaを使ってMSY管理基準値などを計算するwrapper関数

Description

future_vpaを使ってMSY管理基準値などを計算するwrapper関数

Usage

est_MSYRP(
  data_future,
  ncore = 0,
  optim_method = "R",
  compile_tmb = FALSE,
  candidate_PGY = c(0.1, 0.6),
  only_lowerPGY = "lower",
  candidate_B0 = -1,
  candidate_Babs = -1,
  candidate_Fbase = -1,
  calc_yieldcurve = TRUE,
  trace_multi = c(0.9, 0.925, 0.95, 0.975, 1.025, 1.05, 1.075),
  select_Btarget = 0,
  select_Blimit = 0,
  select_Bban = 0,
  multi_upper_PGY = 10
)

Arguments

data_future	make_future_dataの返り値
candidate_PGY	PGYの計算候補
candidate_B0	b0の計算候補
candidate_Babs	Babsの計算候補
trace_multi	（このベクトル）×（管理基準値として計算されるF）の平行状態の資源状態などを計算する。HCR_catchのプロットするときに、この値をもっと細かく設定することが必要になってくるかも
multi_upper_PGY	PGYを計算するときの探索範囲の上限。デフォルトは10だが、うまくいかない場合にはこの数字を少し変えてみるとよいかも。

ichimomo/frasyr documentation built on May 3, 2024, 1:30 a.m.