plot_futures: 将来予測の複数の結果をggplotで重ね書きする

In ichimomo/frasyr: Fisheries Research Agency (FRA) provides the method for calculating sustainable yield (SY) with R

将来予測の複数の結果をggplotで重ね書きする

Description

将来予測の複数の結果をggplotで重ね書きする

Usage

plot_futures(
  vpares = NULL,
  future.list = NULL,
  future.name = names(future.list),
  future_tibble = NULL,
  CI_range = c(0.1, 0.9),
  maxyear = NULL,
  minyear = NULL,
  is.plot.CIrange = TRUE,
  is.plot.CIline = TRUE,
  what.plot = c("Recruitment", "SSB", "biomass", "cbiomass", "catch", "beta_gamma", "U",
    "Fratio"),
  biomass.unit = 1,
  number.unit = 1,
  number.name = "",
  RP_name = c("Btarget", "Blimit", "Bban"),
  Btarget = NA,
  Blimit = NA,
  Bban = NA,
  MSY = NA,
  Umsy = NA,
  SPRtarget = NULL,
  exclude.japanese.font = FALSE,
  average_lwd = 1,
  n_example = 3,
  example_width = 0.7,
  future.replicate = NULL,
  seed = 1,
  legend.position = "top",
  type = "detail",
  font.size = 16,
  ncol = 3,
  ncol_legend = 2,
  remove.last.vpa.year = FALSE
)

Arguments

vpares	VPAの結果のオブジェクト(NULLでもOK)
future.list	将来予測の結果をリストで並べたもの(こちらは必須)
future.name	将来予測のリストの名前。ない場合はfuture.listについている名前を使う
CI_range	予測区間の範囲。デフォルトは８０%でc(0.1,0.9)
maxyear	表示する年の最大
minyear	表示する年の最小
is.plot.CIrange	予測区間を表示するかどうか
is.plot.CIline	予測区間の上限と下限の線を引くか
what.plot	Recruitment,SSB,biomass,catch,beta_gamma,U,Fratioのうち何をプロットするか。これらの文字列のベクトルで指定する
biomass.unit	量の単位
number.unit	尾数（加入尾数とか）のときの単位
number.name	尾数の凡例をどのように表示するか（「億尾」とか）
RP_name	管理基準値をどのように名前つけるか
Btarget	Btargetの値、設定しない場合はNA（デフォルトはNA）
Blimit	Blimitの値、設定しない場合はNA（デフォルトはNA）
Bban	Bbanの値、設定しない場合はNA（デフォルトはNA）
MSY	MSYの値、設定しない場合はNA（デフォルトはNA）
Umsy	Umsyの値、設定しない場合はNA（デフォルトはNA）
SPRtarget	MSYのときのSPRの値
exclude.japanese.font	日本語を図中に表示しない
average_lwd	将来予測の平均値の線の太さ. 基本は1.
n_example	個々のシミュレーションの例を示す数
future.replicate	どのreplicateを選ぶかを選択する。この場合n_exampleによる指定は無効になる
legend.position	凡例の位置。top, right, left, bottomなど
font.size	フォントの大きさ
ncol	図を並べるときの列数
remove.last.vpa.year	VPAの最終年のデータのプロットを除くかどうか（last.catch.zero用オプション）
width_example	個々のシミュレーションをプロットする場合の線の太さ (default=0.7)

ichimomo/frasyr documentation built on May 3, 2024, 1:30 a.m.