retro.est: レトロスペクティブ解析の実施

In ichimomo/frasyr: Fisheries Research Agency (FRA) provides the method for calculating sustainable yield (SY) with R

レトロスペクティブ解析の実施

Description

レトロスペクティブ解析の実施

Usage

retro.est(
  res,
  n = 5,
  stat = "mean",
  init.est = FALSE,
  b.fix = TRUE,
  remove.maxAgeF = FALSE,
  ssb.forecast = FALSE,
  sel.mat = NULL,
  grid.add.ini = NULL,
  grid.init = NULL,
  remove.short.index = -1
)

Arguments

res	VPAの出力
n	除く年数
b.fix	b推定してる場合にbを固定するかどうか
remove.maxAgeF	Mohn's rhoを計算する際に最高齢のFを除くか（alphaを仮定して計算していることが多いから）
ssb.forecast	Mohn's rhoを計算する際にSSBは1年後を計算するか(last.catch.zero=TRUEのときのみ有効)
grid.add.ini	add.p.iniをgridで変えて初期値を事前に探索する
grid.init	p.initでgridを変えて初期値を事前に探索する
remove.short.index	年数が指定された数字以下になった指標値を除いて計算する(初期設定:-1)

ichimomo/frasyr documentation built on May 3, 2024, 1:30 a.m.