specify.Mesnil.gamma: 再生産関係推定でSR＝HSにおいて同一尤度を持つ複数のパラメータセットがえられたとき、SR＝Mesnilとしてcheck.SRfitを呼び出し、gammaを変えながら尤度が一意に定まる値を探す関数

In ichimomo/frasyr: Fisheries Research Agency (FRA) provides the method for calculating sustainable yield (SY) with R

再生産関係推定でSR＝HSにおいて同一尤度を持つ複数のパラメータセットがえられたとき、SR＝Mesnilとしてcheck.SRfitを呼び出し、gammaを変えながら尤度が一意に定まる値を探す関数

Description

再生産関係推定でSR＝HSにおいて同一尤度を持つ複数のパラメータセットがえられたとき、SR＝Mesnilとしてcheck.SRfitを呼び出し、gammaを変えながら尤度が一意に定まる値を探す関数

Usage

specify.Mesnil.gamma(resSR, n = 100, seed = 1, sigma = 5, gamma_ini = 10)

Arguments

resSR	fit.SRかfit.SRregimeのオブジェクトで、かつSR=Mesnilのもの
n	初期値を変えてパラメータ推定する回数 (check.SRfitの引数)
seed	set.seedで使用するseed(check.SRfitの引数)
sigma	初期値を変えるときの生起乱数の標準偏差(check.SRfitの引数)
gamma_ini	SR=Mesnilの曲がり具合を決めるパラメータ デフォルトは10で、9,8,…,2,1,0.9,0.8,…と複数のパラメータが得られるまで探していく。

ichimomo/frasyr documentation built on May 3, 2024, 1:30 a.m.